MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 38821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_020560	CGC	2	6	1524037	1524042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186810
35002	NC_020560	CGGC	2	8	1524067	1524074	0 %	0 %	50 %	50 %	470186810
35003	NC_020560	CGTCGC	2	12	1524172	1524183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470186810
35004	NC_020560	TGC	2	6	1524186	1524191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186810
35005	NC_020560	CCG	2	6	1524258	1524263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186810
35006	NC_020560	GTC	2	6	1524266	1524271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186810
35007	NC_020560	GCG	2	6	1524291	1524296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186810
35008	NC_020560	CAT	2	6	1524352	1524357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186810
35009	NC_020560	TCA	2	6	1524372	1524377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186810
35010	NC_020560	ATC	4	12	1524410	1524421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186810
35011	NC_020560	ATT	2	6	1524507	1524512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_020560	GGA	2	6	1524514	1524519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35013	NC_020560	GCC	2	6	1524550	1524555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186811
35014	NC_020560	GAT	2	6	1524561	1524566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186811
35015	NC_020560	CAAGA	2	10	1524592	1524601	60 %	0 %	20 %	20 %	470186811
35016	NC_020560	CGG	2	6	1524626	1524631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186811
35017	NC_020560	CCG	2	6	1524647	1524652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186811
35018	NC_020560	GCT	2	6	1524684	1524689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186811
35019	NC_020560	CCGA	2	8	1524805	1524812	25 %	0 %	25 %	50 %	470186811
35020	NC_020560	CAAGGG	2	12	1524846	1524857	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470186811
35021	NC_020560	TCG	2	6	1524863	1524868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186811
35022	NC_020560	TGG	2	6	1524872	1524877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186811
35023	NC_020560	CG	3	6	1524880	1524885	0 %	0 %	50 %	50 %	470186811
35024	NC_020560	ACA	2	6	1524899	1524904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470186811
35025	NC_020560	AAC	2	6	1524931	1524936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470186811
35026	NC_020560	GGT	2	6	1524993	1524998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186811
35027	NC_020560	CCGATC	2	12	1525015	1525026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470186811
35028	NC_020560	CAG	2	6	1525030	1525035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186811
35029	NC_020560	CGT	2	6	1525167	1525172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186811
35030	NC_020560	GAC	2	6	1525186	1525191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186811
35031	NC_020560	TGC	2	6	1525205	1525210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186811
35032	NC_020560	GAT	2	6	1525305	1525310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186811
35033	NC_020560	CCG	2	6	1525330	1525335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186811
35034	NC_020560	CGAT	2	8	1525409	1525416	25 %	25 %	25 %	25 %	470186811
35035	NC_020560	GCCT	2	8	1525504	1525511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35036	NC_020560	CGGG	2	8	1525523	1525530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35037	NC_020560	CTGCC	2	10	1525566	1525575	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35038	NC_020560	C	6	6	1525704	1525709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35039	NC_020560	GGCAG	2	10	1525726	1525735	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35040	NC_020560	CGC	2	6	1525758	1525763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35041	NC_020560	CCG	2	6	1525793	1525798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35042	NC_020560	ACG	2	6	1525802	1525807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35043	NC_020560	CCA	2	6	1525808	1525813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186812
35044	NC_020560	CCG	2	6	1525828	1525833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35045	NC_020560	CTC	2	6	1525839	1525844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186812
35046	NC_020560	CCG	2	6	1525858	1525863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35047	NC_020560	GCG	2	6	1525870	1525875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186812
35048	NC_020560	CGA	2	6	1525883	1525888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35049	NC_020560	CGC	3	9	1525922	1525930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35050	NC_020560	GCC	2	6	1525948	1525953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35051	NC_020560	CGG	2	6	1525965	1525970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186812
35052	NC_020560	TCC	2	6	1525987	1525992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186812
35053	NC_020560	CAG	2	6	1525998	1526003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35054	NC_020560	CGGC	2	8	1526050	1526057	0 %	0 %	50 %	50 %	470186812
35055	NC_020560	TTC	2	6	1526083	1526088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186812
35056	NC_020560	CTCGCC	2	12	1526130	1526141	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470186812
35057	NC_020560	CGCC	2	8	1526168	1526175	0 %	0 %	25 %	75 %	470186812
35058	NC_020560	CCG	2	6	1526189	1526194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35059	NC_020560	CCG	2	6	1526212	1526217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35060	NC_020560	CAG	3	9	1526277	1526285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35061	NC_020560	CGC	3	9	1526334	1526342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35062	NC_020560	TCG	3	9	1526357	1526365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35063	NC_020560	GCGCAA	2	12	1526372	1526383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35064	NC_020560	TGCG	2	8	1526386	1526393	0 %	25 %	50 %	25 %	470186812
35065	NC_020560	GAT	2	6	1526394	1526399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186812
35066	NC_020560	TGGC	2	8	1526422	1526429	0 %	25 %	50 %	25 %	470186812
35067	NC_020560	CGA	2	6	1526498	1526503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35068	NC_020560	TTCG	2	8	1526514	1526521	0 %	50 %	25 %	25 %	470186812
35069	NC_020560	CGGAT	2	10	1526533	1526542	20 %	20 %	40 %	20 %	470186812
35070	NC_020560	ATCGC	2	10	1526569	1526578	20 %	20 %	20 %	40 %	470186812
35071	NC_020560	ATC	2	6	1526626	1526631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186812
35072	NC_020560	ATC	2	6	1526644	1526649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186812
35073	NC_020560	GAT	3	9	1526673	1526681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186812
35074	NC_020560	TCG	2	6	1526708	1526713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35075	NC_020560	GAC	2	6	1526727	1526732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35076	NC_020560	TGC	2	6	1526775	1526780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35077	NC_020560	CGC	2	6	1526795	1526800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186812
35078	NC_020560	TGA	2	6	1526873	1526878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186812
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35080	NC_020560	GGTA	2	8	1527071	1527078	25 %	25 %	50 %	0 %	470186812
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35083	NC_020560	AGC	2	6	1527130	1527135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
35084	NC_020560	GAC	2	6	1527153	1527158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186812
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35087	NC_020560	CGA	2	6	1527352	1527357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186813
35088	NC_020560	GC	3	6	1527366	1527371	0 %	0 %	50 %	50 %	470186813
35089	NC_020560	CG	3	6	1527400	1527405	0 %	0 %	50 %	50 %	470186813
35090	NC_020560	TGCC	2	8	1527424	1527431	0 %	25 %	25 %	50 %	470186813
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35093	NC_020560	CGAG	2	8	1527457	1527464	25 %	0 %	50 %	25 %	470186813
35094	NC_020560	GAC	2	6	1527479	1527484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186813
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35098	NC_020560	CG	3	6	1527616	1527621	0 %	0 %	50 %	50 %	470186813
35099	NC_020560	CCG	2	6	1527637	1527642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186813
35100	NC_020560	CG	3	6	1527641	1527646	0 %	0 %	50 %	50 %	470186813
35101	NC_020560	GCA	2	6	1527670	1527675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186813
35102	NC_020560	GTCCA	2	10	1527677	1527686	20 %	20 %	20 %	40 %	470186813
35103	NC_020560	ACG	2	6	1527771	1527776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186813
35104	NC_020560	GCTT	2	8	1527896	1527903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35105	NC_020560	TTTC	2	8	1527950	1527957	0 %	75 %	0 %	25 %	470186814
35106	NC_020560	T	6	6	1527960	1527965	0 %	100 %	0 %	0 %	470186814
35107	NC_020560	GC	3	6	1527977	1527982	0 %	0 %	50 %	50 %	470186814
35108	NC_020560	TTC	2	6	1528003	1528008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186814
35109	NC_020560	CTCG	2	8	1528056	1528063	0 %	25 %	25 %	50 %	470186814
35110	NC_020560	GAT	2	6	1528083	1528088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186814
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35113	NC_020560	GGCC	2	8	1528292	1528299	0 %	0 %	50 %	50 %	470186814
35114	NC_020560	GCCG	2	8	1528341	1528348	0 %	0 %	50 %	50 %	470186814
35115	NC_020560	GCC	2	6	1528386	1528391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186814
35116	NC_020560	TCG	2	6	1528409	1528414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186814
35117	NC_020560	CG	3	6	1528502	1528507	0 %	0 %	50 %	50 %	470186814
35118	NC_020560	GGC	2	6	1528554	1528559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186814
35119	NC_020560	ACA	2	6	1528631	1528636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470186814
35120	NC_020560	CAT	2	6	1528686	1528691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186814
35121	NC_020560	GGT	2	6	1528710	1528715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186814
35122	NC_020560	GGC	2	6	1528743	1528748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186814
35123	NC_020560	GCC	2	6	1528750	1528755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186814
35124	NC_020560	GCC	2	6	1528766	1528771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186814
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35128	NC_020560	TGC	2	6	1528988	1528993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186814
35129	NC_020560	AGGC	2	8	1529010	1529017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35130	NC_020560	CCG	2	6	1529108	1529113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35131	NC_020560	GGA	2	6	1529125	1529130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35132	NC_020560	GC	3	6	1529216	1529221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35133	NC_020560	GGA	2	6	1529227	1529232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35134	NC_020560	CTT	2	6	1529247	1529252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186815
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35146	NC_020560	TCG	2	6	1529594	1529599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186815
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35152	NC_020560	GCC	2	6	1529731	1529736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186815
35153	NC_020560	CGG	3	9	1529775	1529783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186815
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35170	NC_020560	TCG	2	6	1530451	1530456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186816
35171	NC_020560	GCG	2	6	1530465	1530470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186816
35172	NC_020560	TGC	2	6	1530475	1530480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186816
35173	NC_020560	TTC	2	6	1530663	1530668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186816
35174	NC_020560	GTGC	2	8	1530688	1530695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35175	NC_020560	GCC	2	6	1530701	1530706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35176	NC_020560	GATC	2	8	1530730	1530737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35177	NC_020560	CGA	2	6	1530784	1530789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35178	NC_020560	GCT	2	6	1530820	1530825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186817
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35180	NC_020560	TGC	2	6	1530894	1530899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186817
35181	NC_020560	CCGG	2	8	1530959	1530966	0 %	0 %	50 %	50 %	470186817
35182	NC_020560	TCA	2	6	1530972	1530977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186817
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35187	NC_020560	CGG	2	6	1531105	1531110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186817
35188	NC_020560	TCG	2	6	1531143	1531148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186817
35189	NC_020560	CG	3	6	1531221	1531226	0 %	0 %	50 %	50 %	470186817
35190	NC_020560	TCC	2	6	1531265	1531270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186817
35191	NC_020560	GC	3	6	1531361	1531366	0 %	0 %	50 %	50 %	470186817
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35196	NC_020560	GCCG	2	8	1531591	1531598	0 %	0 %	50 %	50 %	470186817
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35200	NC_020560	GCT	2	6	1531828	1531833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186817
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35203	NC_020560	TGC	2	6	1531896	1531901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186817
35204	NC_020560	TGC	2	6	1532037	1532042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186817
35205	NC_020560	GGT	2	6	1532098	1532103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186817
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35207	NC_020560	CGC	2	6	1532221	1532226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186817
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35209	NC_020560	CGC	2	6	1532290	1532295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186817
35210	NC_020560	CCG	2	6	1532339	1532344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35211	NC_020560	GGCTG	2	10	1532366	1532375	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35212	NC_020560	AAC	2	6	1532394	1532399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470186818
35213	NC_020560	GCT	2	6	1532515	1532520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186818
35214	NC_020560	GCC	3	9	1532521	1532529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186818
35215	NC_020560	CCG	2	6	1532604	1532609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186818
35216	NC_020560	GCTTCA	2	12	1532710	1532721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470186819
35217	NC_020560	GAT	2	6	1532731	1532736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186819
35218	NC_020560	CCGG	2	8	1532754	1532761	0 %	0 %	50 %	50 %	470186819
35219	NC_020560	CGA	2	6	1532855	1532860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186819
35220	NC_020560	CGC	2	6	1532932	1532937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35221	NC_020560	TGCCC	2	10	1532992	1533001	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35222	NC_020560	GAT	2	6	1533051	1533056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186820
35223	NC_020560	CAGG	2	8	1533137	1533144	25 %	0 %	50 %	25 %	470186820
35224	NC_020560	CGGC	2	8	1533184	1533191	0 %	0 %	50 %	50 %	470186820
35225	NC_020560	CGGT	2	8	1533209	1533216	0 %	25 %	50 %	25 %	470186820
35226	NC_020560	CCCA	2	8	1533283	1533290	25 %	0 %	0 %	75 %	470186820
35227	NC_020560	GCAG	2	8	1533313	1533320	25 %	0 %	50 %	25 %	470186820
35228	NC_020560	CATC	2	8	1533424	1533431	25 %	25 %	0 %	50 %	470186821
35229	NC_020560	TCGA	2	8	1533620	1533627	25 %	25 %	25 %	25 %	470186821
35230	NC_020560	CGT	3	9	1533722	1533730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186821
35231	NC_020560	CG	3	6	1533853	1533858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35232	NC_020560	CCG	2	6	1533907	1533912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186822
35233	NC_020560	GCG	2	6	1533980	1533985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186822
35234	NC_020560	GTT	2	6	1534010	1534015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186822
35235	NC_020560	TTC	2	6	1534155	1534160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186822
35236	NC_020560	GCC	2	6	1534196	1534201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186822
35237	NC_020560	GCA	2	6	1534318	1534323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186822
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35239	NC_020560	CTT	2	6	1534358	1534363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186822
35240	NC_020560	CGA	2	6	1534468	1534473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186822
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35242	NC_020560	GTA	2	6	1534517	1534522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186822
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35250	NC_020560	GCT	2	6	1534813	1534818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186822
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35252	NC_020560	GTG	2	6	1534942	1534947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35253	NC_020560	AC	3	6	1534985	1534990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35254	NC_020560	GA	3	6	1535048	1535053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35255	NC_020560	T	6	6	1535057	1535062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35256	NC_020560	CGG	2	6	1535091	1535096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35262	NC_020560	A	6	6	1535330	1535335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35263	NC_020560	CGA	2	6	1535516	1535521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186823
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35266	NC_020560	GCT	2	6	1535627	1535632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186823
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35288	NC_020560	ACAG	2	8	1536461	1536468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35289	NC_020560	GTGCAA	2	12	1536507	1536518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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35348	NC_020560	TGC	2	6	1539361	1539366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186826
35349	NC_020560	GACG	2	8	1539433	1539440	25 %	0 %	50 %	25 %	470186826
35350	NC_020560	CGCGC	2	10	1539476	1539485	0 %	0 %	40 %	60 %	470186826
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35352	NC_020560	GCG	2	6	1539521	1539526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186826
35353	NC_020560	CGG	2	6	1539545	1539550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186826
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35459	NC_020560	ACAGGC	2	12	1543582	1543593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35497	NC_020560	A	6	6	1545191	1545196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35498	NC_020560	GAG	2	6	1545200	1545205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35499	NC_020560	GC	3	6	1545212	1545217	0 %	0 %	50 %	50 %	470186832
35500	NC_020560	GCGG	2	8	1545254	1545261	0 %	0 %	75 %	25 %	470186832

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