MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 38821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020560	CGA	2	6	539141	539146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12502	NC_020560	TGC	2	6	539154	539159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12503	NC_020560	GCT	2	6	539164	539169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12504	NC_020560	GAAAT	2	10	539186	539195	60 %	20 %	20 %	0 %	470185872
12505	NC_020560	CAT	2	6	539200	539205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185872
12506	NC_020560	CTC	2	6	539271	539276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185872
12507	NC_020560	CAC	2	6	539300	539305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185872
12508	NC_020560	CGACG	2	10	539368	539377	20 %	0 %	40 %	40 %	470185872
12509	NC_020560	GCG	2	6	539414	539419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185872
12510	NC_020560	ACCGC	2	10	539488	539497	20 %	0 %	20 %	60 %	470185872
12511	NC_020560	GGT	2	6	539518	539523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185872
12512	NC_020560	GAACG	2	10	539529	539538	40 %	0 %	40 %	20 %	470185872
12513	NC_020560	AGG	2	6	539592	539597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185872
12514	NC_020560	CGA	2	6	539625	539630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12515	NC_020560	CGA	2	6	539632	539637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12516	NC_020560	CCG	2	6	539644	539649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185872
12517	NC_020560	AGG	2	6	539655	539660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185872
12518	NC_020560	GAG	2	6	539699	539704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185872
12519	NC_020560	GCCACC	2	12	539708	539719	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470185872
12520	NC_020560	GAA	2	6	539741	539746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185872
12521	NC_020560	GAG	2	6	539825	539830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185872
12522	NC_020560	CAA	2	6	539842	539847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470185872
12523	NC_020560	CGAC	2	8	539913	539920	25 %	0 %	25 %	50 %	470185872
12524	NC_020560	CGA	2	6	540004	540009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12525	NC_020560	TGA	2	6	540061	540066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185872
12526	NC_020560	CG	3	6	540071	540076	0 %	0 %	50 %	50 %	470185872
12527	NC_020560	AGCG	2	8	540209	540216	25 %	0 %	50 %	25 %	470185872
12528	NC_020560	GGC	2	6	540232	540237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185872
12529	NC_020560	TCG	2	6	540276	540281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12530	NC_020560	CG	3	6	540369	540374	0 %	0 %	50 %	50 %	470185872
12531	NC_020560	AGG	2	6	540375	540380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185872
12532	NC_020560	GAA	2	6	540398	540403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185872
12533	NC_020560	CTC	2	6	540427	540432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185872
12534	NC_020560	GCG	2	6	540477	540482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185872
12535	NC_020560	AG	3	6	540523	540528	50 %	0 %	50 %	0 %	470185872
12536	NC_020560	GCC	2	6	540558	540563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185872
12537	NC_020560	ACCG	2	8	540590	540597	25 %	0 %	25 %	50 %	470185872
12538	NC_020560	GCG	2	6	540610	540615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185872
12539	NC_020560	GAA	2	6	540652	540657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185872
12540	NC_020560	CGCT	2	8	540660	540667	0 %	25 %	25 %	50 %	470185872
12541	NC_020560	GTC	2	6	540668	540673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12542	NC_020560	GC	3	6	540683	540688	0 %	0 %	50 %	50 %	470185872
12543	NC_020560	CGAG	2	8	540711	540718	25 %	0 %	50 %	25 %	470185872
12544	NC_020560	TCG	2	6	540723	540728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12545	NC_020560	GCA	2	6	540749	540754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12546	NC_020560	GCT	2	6	540772	540777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12547	NC_020560	GGCGC	2	10	540792	540801	0 %	0 %	60 %	40 %	470185872
12548	NC_020560	GCC	2	6	540892	540897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185872
12549	NC_020560	TGC	2	6	540946	540951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12550	NC_020560	AAC	2	6	541010	541015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470185872
12551	NC_020560	CCG	2	6	541055	541060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185872
12552	NC_020560	GCC	2	6	541066	541071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185872
12553	NC_020560	GAGC	2	8	541072	541079	25 %	0 %	50 %	25 %	470185872
12554	NC_020560	CGG	2	6	541087	541092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185872
12555	NC_020560	CGT	2	6	541153	541158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12556	NC_020560	GAC	2	6	541212	541217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185872
12557	NC_020560	CTT	2	6	541224	541229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185873
12558	NC_020560	AGC	2	6	541286	541291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185873
12559	NC_020560	GGC	2	6	541340	541345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185873
12560	NC_020560	GCG	2	6	541353	541358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185873
12561	NC_020560	ACC	2	6	541410	541415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185873
12562	NC_020560	CATTC	2	10	541448	541457	20 %	40 %	0 %	40 %	470185873
12563	NC_020560	TTC	3	9	541455	541463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185873
12564	NC_020560	CGA	2	6	541484	541489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185873
12565	NC_020560	GAAA	2	8	541495	541502	75 %	0 %	25 %	0 %	470185873
12566	NC_020560	CGT	2	6	541514	541519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185873
12567	NC_020560	GCA	2	6	541538	541543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185873
12568	NC_020560	TTG	2	6	541549	541554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470185873
12569	NC_020560	GCC	2	6	541589	541594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185873
12570	NC_020560	GCG	2	6	541634	541639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_020560	AGG	2	6	541670	541675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_020560	CG	3	6	541698	541703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_020560	GGCG	2	8	541749	541756	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12574	NC_020560	ACG	2	6	541757	541762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_020560	GGCTA	2	10	541883	541892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12576	NC_020560	CAA	2	6	541945	541950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_020560	TGGA	2	8	542194	542201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_020560	CGT	2	6	542314	542319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_020560	GGCG	2	8	542335	542342	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12580	NC_020560	TCG	2	6	542383	542388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185874
12581	NC_020560	GCCG	2	8	542394	542401	0 %	0 %	50 %	50 %	470185874
12582	NC_020560	GAG	2	6	542575	542580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185874
12583	NC_020560	GTG	2	6	542625	542630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185874
12584	NC_020560	CCAT	2	8	542658	542665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12585	NC_020560	GCC	2	6	542724	542729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12586	NC_020560	GAC	2	6	542743	542748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_020560	ACC	2	6	542778	542783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12588	NC_020560	GCC	2	6	542792	542797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_020560	AAT	2	6	542799	542804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_020560	CAG	2	6	542848	542853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185875
12591	NC_020560	CATG	2	8	542982	542989	25 %	25 %	25 %	25 %	470185875
12592	NC_020560	GCA	2	6	543039	543044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185875
12593	NC_020560	CGGC	2	8	543176	543183	0 %	0 %	50 %	50 %	470185875
12594	NC_020560	TCG	2	6	543200	543205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185875
12595	NC_020560	AC	3	6	543266	543271	50 %	0 %	0 %	50 %	470185875
12596	NC_020560	CGA	2	6	543291	543296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185875
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12598	NC_020560	CGG	2	6	543330	543335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185875
12599	NC_020560	GGCT	2	8	543365	543372	0 %	25 %	50 %	25 %	470185875
12600	NC_020560	TTC	2	6	543413	543418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185875
12601	NC_020560	TGC	2	6	543474	543479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185875
12602	NC_020560	GCCG	2	8	543520	543527	0 %	0 %	50 %	50 %	470185875
12603	NC_020560	GGA	2	6	543551	543556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020560	C	6	6	543582	543587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12605	NC_020560	GC	3	6	543596	543601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12606	NC_020560	GTG	2	6	543603	543608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_020560	GCC	2	6	543700	543705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185876
12608	NC_020560	GCG	2	6	543731	543736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185876
12609	NC_020560	ACG	2	6	543737	543742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185876
12610	NC_020560	TCC	2	6	543819	543824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185876
12611	NC_020560	GTG	2	6	543872	543877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185876
12612	NC_020560	CTGAT	2	10	543882	543891	20 %	40 %	20 %	20 %	470185876
12613	NC_020560	GC	4	8	543894	543901	0 %	0 %	50 %	50 %	470185877
12614	NC_020560	GACCG	2	10	543932	543941	20 %	0 %	40 %	40 %	470185877
12615	NC_020560	TCG	2	6	543942	543947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185877
12616	NC_020560	GCG	2	6	543956	543961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185877
12617	NC_020560	CGGG	2	8	544000	544007	0 %	0 %	75 %	25 %	470185877
12618	NC_020560	CAG	2	6	544030	544035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185878
12619	NC_020560	GCT	2	6	544044	544049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185878
12620	NC_020560	GAA	2	6	544059	544064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185878
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12622	NC_020560	GGC	2	6	544281	544286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185878
12623	NC_020560	CGT	2	6	544308	544313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185878
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12862	NC_020560	TCGCG	2	10	555460	555469	0 %	20 %	40 %	40 %	470185892
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12866	NC_020560	GCT	2	6	555624	555629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185893
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12885	NC_020560	CCGC	2	8	556268	556275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12886	NC_020560	TTA	2	6	556291	556296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12983	NC_020560	AG	3	6	561019	561024	50 %	0 %	50 %	0 %	470185898
12984	NC_020560	GCG	2	6	561075	561080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185898
12985	NC_020560	AGC	2	6	561120	561125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185898
12986	NC_020560	AGC	2	6	561141	561146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185898
12987	NC_020560	GC	4	8	561145	561152	0 %	0 %	50 %	50 %	470185898
12988	NC_020560	CCG	2	6	561245	561250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185899
12989	NC_020560	GAC	2	6	561259	561264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185899
12990	NC_020560	GTGA	2	8	561268	561275	25 %	25 %	50 %	0 %	470185899
12991	NC_020560	CGGG	2	8	561281	561288	0 %	0 %	75 %	25 %	470185899
12992	NC_020560	CAT	2	6	561316	561321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185899
12993	NC_020560	TCG	2	6	561363	561368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185899
12994	NC_020560	GCAGG	2	10	561394	561403	20 %	0 %	60 %	20 %	470185899
12995	NC_020560	TCG	2	6	561404	561409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185899
12996	NC_020560	GAT	2	6	561415	561420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185899
12997	NC_020560	GCCG	2	8	561441	561448	0 %	0 %	50 %	50 %	470185899
12998	NC_020560	GGA	2	6	561684	561689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185899
12999	NC_020560	CAG	2	6	561709	561714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185899
13000	NC_020560	CGC	2	6	561724	561729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185899

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