MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 2371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	CGGGC	2	10	79	88	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020545	TCGT	2	8	112	119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020545	GCA	2	6	154	159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327981
4	NC_020545	C	6	6	186	191	0 %	0 %	0 %	100 %	471327981
5	NC_020545	ACC	2	6	193	198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327981
6	NC_020545	CGGG	2	8	199	206	0 %	0 %	75 %	25 %	471327981
7	NC_020545	CAT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471327981
8	NC_020545	GCGCA	2	10	311	320	20 %	0 %	40 %	40 %	471327981
9	NC_020545	GGT	2	6	346	351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327981
10	NC_020545	CGGT	2	8	371	378	0 %	25 %	50 %	25 %	471327981
11	NC_020545	GTG	2	6	455	460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327981
12	NC_020545	GGT	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327981
13	NC_020545	GAG	2	6	470	475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327981
14	NC_020545	GCA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327981
15	NC_020545	GGA	2	6	502	507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327981
16	NC_020545	GC	3	6	509	514	0 %	0 %	50 %	50 %	471327981
17	NC_020545	CGG	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327981
18	NC_020545	CAC	2	6	526	531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327981
19	NC_020545	GCC	2	6	600	605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327981
20	NC_020545	CTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471327981
21	NC_020545	GCG	2	6	654	659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327981
22	NC_020545	CCA	2	6	673	678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327981
23	NC_020545	GCCCTG	2	12	740	751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471327981
24	NC_020545	TCC	2	6	753	758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471327981
25	NC_020545	ACC	2	6	771	776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327981
26	NC_020545	GCC	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327981
27	NC_020545	AGG	2	6	858	863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327981
28	NC_020545	AGC	2	6	912	917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327981
29	NC_020545	TGG	2	6	978	983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327981
30	NC_020545	GGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327981
31	NC_020545	ACC	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327981
32	NC_020545	TCGT	2	8	1148	1155	0 %	50 %	25 %	25 %	471327981
33	NC_020545	GATG	2	8	1277	1284	25 %	25 %	50 %	0 %	471327981
34	NC_020545	GC	3	6	1442	1447	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
35	NC_020545	GGCG	2	8	1523	1530	0 %	0 %	75 %	25 %	471327982
36	NC_020545	CAC	3	9	1605	1613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327982
37	NC_020545	GCC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
38	NC_020545	CT	3	6	1677	1682	0 %	50 %	0 %	50 %	471327982
39	NC_020545	CGA	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
40	NC_020545	GGCG	2	8	1752	1759	0 %	0 %	75 %	25 %	471327982
41	NC_020545	TCGC	2	8	1795	1802	0 %	25 %	25 %	50 %	471327982
42	NC_020545	GCG	2	6	1852	1857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
43	NC_020545	CCG	2	6	1880	1885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
44	NC_020545	CGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
45	NC_020545	CGA	2	6	1983	1988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
46	NC_020545	TGGC	2	8	2011	2018	0 %	25 %	50 %	25 %	471327982
47	NC_020545	GGA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327982
48	NC_020545	CTG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471327982
49	NC_020545	CTG	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471327982
50	NC_020545	CGG	2	6	2177	2182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
51	NC_020545	GGA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327982
52	NC_020545	CACCGA	2	12	2280	2291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	471327982
53	NC_020545	GACGA	2	10	2293	2302	40 %	0 %	40 %	20 %	471327982
54	NC_020545	CGT	2	6	2330	2335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471327982
55	NC_020545	GGCC	2	8	2364	2371	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
56	NC_020545	CCG	2	6	2380	2385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
57	NC_020545	GCG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
58	NC_020545	ACC	2	6	2417	2422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327982
59	NC_020545	AGCG	2	8	2428	2435	25 %	0 %	50 %	25 %	471327982
60	NC_020545	CCA	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327982
61	NC_020545	ATC	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471327982
62	NC_020545	TGG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327982
63	NC_020545	AGC	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
64	NC_020545	TCG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471327982
65	NC_020545	ACG	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
66	NC_020545	CGC	2	6	2922	2927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
67	NC_020545	C	6	6	2954	2959	0 %	0 %	0 %	100 %	471327982
68	NC_020545	ACCG	2	8	3002	3009	25 %	0 %	25 %	50 %	471327982
69	NC_020545	GGCG	2	8	3053	3060	0 %	0 %	75 %	25 %	471327982
70	NC_020545	GGTG	2	8	3143	3150	0 %	25 %	75 %	0 %	471327982
71	NC_020545	CAG	2	6	3154	3159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
72	NC_020545	CGC	2	6	3270	3275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
73	NC_020545	GGGCGA	2	12	3333	3344	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	471327982
74	NC_020545	GCA	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
75	NC_020545	GGC	2	6	3391	3396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
76	NC_020545	GC	4	8	3426	3433	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
77	NC_020545	AGC	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
78	NC_020545	GGACTG	2	12	3456	3467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471327982
79	NC_020545	TGA	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471327982
80	NC_020545	AGA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471327982
81	NC_020545	AGC	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
82	NC_020545	CGG	2	6	3695	3700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
83	NC_020545	CG	4	8	3704	3711	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
84	NC_020545	GGC	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
85	NC_020545	CG	3	6	3806	3811	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
86	NC_020545	CG	3	6	3889	3894	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
87	NC_020545	AGC	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
88	NC_020545	GCC	2	6	3925	3930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
89	NC_020545	CGC	2	6	3933	3938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
90	NC_020545	CGA	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
91	NC_020545	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
92	NC_020545	GCA	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
93	NC_020545	GGC	2	6	4101	4106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
94	NC_020545	GC	3	6	4117	4122	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
95	NC_020545	CTG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471327982
96	NC_020545	GGC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
97	NC_020545	CGT	2	6	4248	4253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471327982
98	NC_020545	GCC	3	9	4270	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
99	NC_020545	CCGCC	2	10	4319	4328	0 %	0 %	20 %	80 %	471327982
100	NC_020545	GCC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327982
101	NC_020545	CAC	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327982
102	NC_020545	GCG	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327982
103	NC_020545	GAC	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327982
104	NC_020545	AC	3	6	4486	4491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020545	AG	3	6	4500	4505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020545	TC	3	6	4530	4535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020545	ACG	2	6	4545	4550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020545	GCGG	2	8	4619	4626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020545	GGA	3	9	4695	4703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471327983
110	NC_020545	GGGGGC	2	12	4704	4715	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	471327983
111	NC_020545	TG	3	6	4731	4736	0 %	50 %	50 %	0 %	471327983
112	NC_020545	GCC	2	6	4746	4751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327983
113	NC_020545	GCA	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327983
114	NC_020545	CGG	2	6	4790	4795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327983
115	NC_020545	CAG	2	6	4799	4804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327983
116	NC_020545	GGCG	2	8	4844	4851	0 %	0 %	75 %	25 %	471327983
117	NC_020545	TTC	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471327983
118	NC_020545	GCGT	2	8	4914	4921	0 %	25 %	50 %	25 %	471327983
119	NC_020545	CGC	2	6	5007	5012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327983
120	NC_020545	CCA	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471327983
121	NC_020545	CCGACT	2	12	5120	5131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471327983
122	NC_020545	CGC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327983
123	NC_020545	GCG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327983
124	NC_020545	GCG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020545	CGG	2	6	5271	5276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020545	ACG	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327984
127	NC_020545	CGA	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327984
128	NC_020545	CG	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
129	NC_020545	GCC	2	6	5414	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327984
130	NC_020545	AGC	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327984
131	NC_020545	GT	3	6	5594	5599	0 %	50 %	50 %	0 %	471327984
132	NC_020545	CTGC	2	8	5644	5651	0 %	25 %	25 %	50 %	471327984
133	NC_020545	GGT	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327984
134	NC_020545	GAC	2	6	5692	5697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471327984
135	NC_020545	CGG	2	6	5751	5756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327984
136	NC_020545	GTG	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327984
137	NC_020545	GCC	2	6	5803	5808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327984
138	NC_020545	GCC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327984
139	NC_020545	CGC	2	6	5836	5841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327984
140	NC_020545	CGG	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327984
141	NC_020545	CG	5	10	5935	5944	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
142	NC_020545	CG	4	8	5955	5962	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
143	NC_020545	CGG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327984
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149	NC_020545	GCGG	2	8	6141	6148	0 %	0 %	75 %	25 %	471327984
150	NC_020545	CGG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327984
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154	NC_020545	AGCG	2	8	6310	6317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020545	TGA	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471327985
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172	NC_020545	CGC	2	6	6874	6879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327985
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266	NC_020545	CGG	2	6	10410	10415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327991
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268	NC_020545	TGG	2	6	10511	10516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471327991
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394	NC_020545	GCC	2	6	14385	14390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471327996
395	NC_020545	TCC	2	6	14424	14429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_020545	CGT	2	6	14435	14440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_020545	GCC	2	6	14513	14518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
398	NC_020545	GCC	2	6	14533	14538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_020545	GGC	2	6	14556	14561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_020545	CGCC	2	8	14569	14576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
401	NC_020545	CGCCCG	2	12	14597	14608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
402	NC_020545	CGC	2	6	14636	14641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_020545	CTG	2	6	14664	14669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_020545	AGC	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_020545	CCCG	2	8	14840	14847	0 %	0 %	25 %	75 %	471327997
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439	NC_020545	GGA	2	6	16114	16119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_020545	CAC	2	6	16930	16935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_020545	CGTC	2	8	19237	19244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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