MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 2371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020545	TGC	2	6	74743	74748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_020545	GAA	2	6	74809	74814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328072
2003	NC_020545	ACG	2	6	74850	74855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2004	NC_020545	AGG	2	6	74922	74927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328072
2005	NC_020545	GA	3	6	75004	75009	50 %	0 %	50 %	0 %	471328072
2006	NC_020545	CGA	2	6	75037	75042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2007	NC_020545	GCC	2	6	75083	75088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328072
2008	NC_020545	GCC	2	6	75161	75166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328072
2009	NC_020545	GCA	2	6	75168	75173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2010	NC_020545	GC	3	6	75205	75210	0 %	0 %	50 %	50 %	471328072
2011	NC_020545	TGG	2	6	75237	75242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328072
2012	NC_020545	GAA	2	6	75305	75310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328072
2013	NC_020545	TGC	2	6	75316	75321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2014	NC_020545	CGA	2	6	75346	75351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2015	NC_020545	GGAA	2	8	75352	75359	50 %	0 %	50 %	0 %	471328072
2016	NC_020545	CAG	2	6	75395	75400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2017	NC_020545	CGA	2	6	75424	75429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328072
2018	NC_020545	GC	3	6	75458	75463	0 %	0 %	50 %	50 %	471328072
2019	NC_020545	GGAAA	2	10	75511	75520	60 %	0 %	40 %	0 %	471328072
2020	NC_020545	CGC	2	6	75532	75537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328072
2021	NC_020545	ATCG	2	8	75553	75560	25 %	25 %	25 %	25 %	471328072
2022	NC_020545	CGG	2	6	75571	75576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328072
2023	NC_020545	GTG	2	6	75618	75623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328072
2024	NC_020545	CGGCA	2	10	75677	75686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2025	NC_020545	G	6	6	75689	75694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_020545	TGC	2	6	75703	75708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_020545	GCTGG	2	10	75717	75726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2028	NC_020545	CGG	2	6	75733	75738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_020545	CCA	2	6	75745	75750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2030	NC_020545	CGC	2	6	75835	75840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_020545	CCGC	2	8	75972	75979	0 %	0 %	25 %	75 %	471328073
2032	NC_020545	CCTACG	2	12	75992	76003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471328073
2033	NC_020545	GTGC	2	8	76041	76048	0 %	25 %	50 %	25 %	471328073
2034	NC_020545	CTC	2	6	76071	76076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328073
2035	NC_020545	GTG	2	6	76152	76157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328073
2036	NC_020545	GTG	2	6	76168	76173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328073
2037	NC_020545	TCG	2	6	76216	76221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328073
2038	NC_020545	CCA	2	6	76339	76344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328073
2039	NC_020545	CGGCTC	2	12	76373	76384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471328073
2040	NC_020545	GCG	2	6	76385	76390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328073
2041	NC_020545	TTGAGT	2	12	76391	76402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	471328073
2042	NC_020545	TGCC	2	8	76413	76420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2043	NC_020545	GAT	2	6	76574	76579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328074
2044	NC_020545	CTC	2	6	76613	76618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328074
2045	NC_020545	TCC	2	6	76656	76661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328074
2046	NC_020545	GAT	2	6	76772	76777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328074
2047	NC_020545	CCA	2	6	76794	76799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328074
2048	NC_020545	TCA	2	6	76851	76856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328074
2049	NC_020545	ACG	2	6	76932	76937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2050	NC_020545	GCA	2	6	76938	76943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2051	NC_020545	CG	3	6	76945	76950	0 %	0 %	50 %	50 %	471328074
2052	NC_020545	CGA	2	6	77035	77040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2053	NC_020545	CGG	2	6	77206	77211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328074
2054	NC_020545	CAC	2	6	77222	77227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328074
2055	NC_020545	CAAC	2	8	77275	77282	50 %	0 %	0 %	50 %	471328074
2056	NC_020545	TGC	2	6	77283	77288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2057	NC_020545	CGC	2	6	77314	77319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328074
2058	NC_020545	CGA	2	6	77356	77361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2059	NC_020545	GCA	2	6	77367	77372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2060	NC_020545	CAC	2	6	77413	77418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328074
2061	NC_020545	GCCAT	2	10	77427	77436	20 %	20 %	20 %	40 %	471328074
2062	NC_020545	CAG	2	6	77463	77468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2063	NC_020545	AG	3	6	77467	77472	50 %	0 %	50 %	0 %	471328074
2064	NC_020545	GAA	2	6	77510	77515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328074
2065	NC_020545	CGC	2	6	77516	77521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328074
2066	NC_020545	CGA	2	6	77551	77556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2067	NC_020545	ACG	2	6	77625	77630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328074
2068	NC_020545	TCT	2	6	77649	77654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328074
2069	NC_020545	GGT	2	6	77655	77660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328074
2070	NC_020545	ACCA	2	8	77681	77688	50 %	0 %	0 %	50 %	471328074
2071	NC_020545	CGG	2	6	77717	77722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_020545	CAGC	2	8	77731	77738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2073	NC_020545	CCG	2	6	77744	77749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2074	NC_020545	CG	3	6	77770	77775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2075	NC_020545	CCT	2	6	77779	77784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2076	NC_020545	GTG	2	6	77811	77816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_020545	AGC	2	6	77829	77834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2079	NC_020545	CCG	2	6	77869	77874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2080	NC_020545	C	6	6	77895	77900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2081	NC_020545	AGGG	2	8	77911	77918	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_020545	CGA	2	6	77929	77934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2083	NC_020545	TCG	2	6	77942	77947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_020545	GCC	2	6	77973	77978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2085	NC_020545	GTC	2	6	78014	78019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_020545	GCT	2	6	78055	78060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328075
2087	NC_020545	GTC	2	6	78080	78085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328075
2088	NC_020545	CTG	3	9	78095	78103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328075
2089	NC_020545	CTG	2	6	78110	78115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328075
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2093	NC_020545	CGA	2	6	78349	78354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328076
2094	NC_020545	CCA	2	6	78416	78421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328076
2095	NC_020545	GC	3	6	78442	78447	0 %	0 %	50 %	50 %	471328076
2096	NC_020545	CGGTGG	2	12	78501	78512	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328076
2097	NC_020545	CCGG	2	8	78557	78564	0 %	0 %	50 %	50 %	471328076
2098	NC_020545	CAG	2	6	78599	78604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328076
2099	NC_020545	GCA	2	6	78607	78612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328076
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2101	NC_020545	GTC	2	6	78764	78769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328076
2102	NC_020545	G	6	6	78790	78795	0 %	0 %	100 %	0 %	471328076
2103	NC_020545	ACA	2	6	78802	78807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328076
2104	NC_020545	CGC	2	6	78808	78813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328076
2105	NC_020545	CTG	2	6	78830	78835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328076
2106	NC_020545	CGG	2	6	78854	78859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328076
2107	NC_020545	GCC	2	6	78899	78904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328076
2108	NC_020545	CAG	2	6	78919	78924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328076
2109	NC_020545	CCGGGC	2	12	78941	78952	0 %	0 %	50 %	50 %	471328076
2110	NC_020545	TCC	3	9	78960	78968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328076
2111	NC_020545	GCC	2	6	79022	79027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328076
2112	NC_020545	TCA	2	6	79036	79041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328076
2113	NC_020545	GC	3	6	79091	79096	0 %	0 %	50 %	50 %	471328076
2114	NC_020545	CGA	2	6	79099	79104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328076
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2116	NC_020545	GGCC	2	8	79179	79186	0 %	0 %	50 %	50 %	471328076
2117	NC_020545	CGGCC	2	10	79246	79255	0 %	0 %	40 %	60 %	471328076
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2119	NC_020545	TCG	2	6	79317	79322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328076
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2121	NC_020545	TCG	2	6	79374	79379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328076
2122	NC_020545	AGC	2	6	79405	79410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328076
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2125	NC_020545	AGG	2	6	79467	79472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328076
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2254	NC_020545	GAAG	2	8	84883	84890	50 %	0 %	50 %	0 %	471328086
2255	NC_020545	GGC	2	6	84970	84975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328086
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2259	NC_020545	CCT	2	6	85096	85101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328086
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2363	NC_020545	CAA	2	6	88919	88924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328093
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2365	NC_020545	CCG	2	6	88951	88956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328093
2366	NC_020545	TTC	2	6	89003	89008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328093
2367	NC_020545	GTG	2	6	89134	89139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2368	NC_020545	G	8	8	89139	89146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2369	NC_020545	ATGC	2	8	89188	89195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2370	NC_020545	ACGA	2	8	89213	89220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2371	NC_020545	GCCCG	2	10	89244	89253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.