MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 39050

< Previous12...67686970717273747576777879Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_020540	CAA	2	6	1829169	1829174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201993
39002	NC_020540	AAC	2	6	1829192	1829197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201993
39003	NC_020540	TAC	2	6	1829206	1829211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201993
39004	NC_020540	TTA	2	6	1829250	1829255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201993
39005	NC_020540	CTT	2	6	1829271	1829276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201993
39006	NC_020540	GTT	2	6	1829405	1829410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201993
39007	NC_020540	TAA	2	6	1829413	1829418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201993
39008	NC_020540	GTT	2	6	1829474	1829479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201993
39009	NC_020540	TGT	2	6	1829518	1829523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201993
39010	NC_020540	AGATA	2	10	1829536	1829545	60 %	20 %	20 %	0 %	470201993
39011	NC_020540	TTGCTA	2	12	1829595	1829606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470201993
39012	NC_020540	A	6	6	1829686	1829691	100 %	0 %	0 %	0 %	470201993
39013	NC_020540	CAA	2	6	1829712	1829717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201993
39014	NC_020540	CAGA	2	8	1829726	1829733	50 %	0 %	25 %	25 %	470201993
39015	NC_020540	TGC	2	6	1829734	1829739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201993
39016	NC_020540	TGG	2	6	1829758	1829763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201993
39017	NC_020540	TAAT	2	8	1829769	1829776	50 %	50 %	0 %	0 %	470201993
39018	NC_020540	AATT	2	8	1829797	1829804	50 %	50 %	0 %	0 %	470201993
39019	NC_020540	TCT	2	6	1829816	1829821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201993
39020	NC_020540	GTG	2	6	1829847	1829852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201993
39021	NC_020540	TTA	2	6	1829892	1829897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201993
39022	NC_020540	ATT	2	6	1829900	1829905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201993
39023	NC_020540	AAC	2	6	1829907	1829912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201993
39024	NC_020540	TGG	2	6	1830022	1830027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201993
39025	NC_020540	GTA	2	6	1830032	1830037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201993
39026	NC_020540	AAGG	2	8	1830047	1830054	50 %	0 %	50 %	0 %	470201993
39027	NC_020540	AGT	2	6	1830140	1830145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201993
39028	NC_020540	A	6	6	1830206	1830211	100 %	0 %	0 %	0 %	470201993
39029	NC_020540	ACT	2	6	1830233	1830238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201993
39030	NC_020540	ATT	2	6	1830362	1830367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415447
39031	NC_020540	TAT	2	6	1830485	1830490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415447
39032	NC_020540	AGTT	2	8	1830520	1830527	25 %	50 %	25 %	0 %	523415447
39033	NC_020540	ACG	2	6	1830536	1830541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415447
39034	NC_020540	A	7	7	1830569	1830575	100 %	0 %	0 %	0 %	523415447
39035	NC_020540	ATC	2	6	1830585	1830590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415447
39036	NC_020540	AAG	2	6	1830591	1830596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415447
39037	NC_020540	CAA	2	6	1830618	1830623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415447
39038	NC_020540	GAA	2	6	1830666	1830671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415447
39039	NC_020540	A	8	8	1830697	1830704	100 %	0 %	0 %	0 %	523415447
39040	NC_020540	AT	3	6	1830731	1830736	50 %	50 %	0 %	0 %	523415447
39041	NC_020540	GAA	2	6	1830810	1830815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415447
39042	NC_020540	CG	3	6	1830836	1830841	0 %	0 %	50 %	50 %	523415447
39043	NC_020540	TGA	2	6	1830860	1830865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415447
39044	NC_020540	CAA	2	6	1830870	1830875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415447
39045	NC_020540	CTCA	2	8	1830882	1830889	25 %	25 %	0 %	50 %	523415447
39046	NC_020540	A	7	7	1830966	1830972	100 %	0 %	0 %	0 %	523415447
39047	NC_020540	CTT	2	6	1830991	1830996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415447
39048	NC_020540	CT	3	6	1831026	1831031	0 %	50 %	0 %	50 %	523415447
39049	NC_020540	ATG	3	9	1831087	1831095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415447
39050	NC_020540	CAA	2	6	1831112	1831117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415447

< Previous12...67686970717273747576777879Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.