MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020537	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020537	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020537	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020537	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020537	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020537	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020537	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020537	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020537	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020537	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020537	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
12	NC_020537	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198177
13	NC_020537	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198177
14	NC_020537	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198177
15	NC_020537	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
16	NC_020537	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198177
17	NC_020537	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198177
18	NC_020537	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198177
19	NC_020537	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	470198177
20	NC_020537	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198177
21	NC_020537	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
22	NC_020537	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	470198177
23	NC_020537	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	470198177
24	NC_020537	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198177
25	NC_020537	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198177
26	NC_020537	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
27	NC_020537	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
28	NC_020537	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198177
29	NC_020537	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
30	NC_020537	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198177
31	NC_020537	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
32	NC_020537	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198177
33	NC_020537	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198177
34	NC_020537	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
35	NC_020537	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
36	NC_020537	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198177
37	NC_020537	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	470198177
38	NC_020537	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470198177
39	NC_020537	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
40	NC_020537	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198177
41	NC_020537	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	470198177
42	NC_020537	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	470198177
43	NC_020537	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	470198177
44	NC_020537	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
45	NC_020537	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198177
46	NC_020537	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	470198177
47	NC_020537	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	470198177
48	NC_020537	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
49	NC_020537	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
50	NC_020537	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020537	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020537	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020537	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020537	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020537	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020537	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020537	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020537	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020537	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
60	NC_020537	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
61	NC_020537	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
62	NC_020537	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198178
63	NC_020537	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
64	NC_020537	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198178
65	NC_020537	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	470198178
66	NC_020537	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
67	NC_020537	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470198178
68	NC_020537	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
69	NC_020537	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470198178
70	NC_020537	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	470198178
71	NC_020537	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198178
72	NC_020537	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198178
73	NC_020537	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	470198178
74	NC_020537	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198178
75	NC_020537	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198178
76	NC_020537	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	470198178
77	NC_020537	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
78	NC_020537	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198178
79	NC_020537	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470198178
80	NC_020537	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
81	NC_020537	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198178
82	NC_020537	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
83	NC_020537	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
84	NC_020537	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198178
85	NC_020537	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198178
86	NC_020537	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198178
87	NC_020537	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198178
88	NC_020537	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	470198178
89	NC_020537	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
90	NC_020537	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	470198178
91	NC_020537	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
92	NC_020537	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
93	NC_020537	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198178
94	NC_020537	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198178
95	NC_020537	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
96	NC_020537	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020537	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020537	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020537	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020537	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020537	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020537	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020537	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020537	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020537	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020537	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020537	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020537	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020537	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020537	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020537	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020537	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020537	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020537	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020537	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020537	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020537	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198179
118	NC_020537	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	470198179
119	NC_020537	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198179
120	NC_020537	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	470198179
121	NC_020537	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198179
122	NC_020537	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470198179
123	NC_020537	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198179
124	NC_020537	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198179
125	NC_020537	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198179
126	NC_020537	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	470198179
127	NC_020537	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198179
128	NC_020537	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198179
129	NC_020537	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198179
130	NC_020537	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198179
131	NC_020537	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198179
132	NC_020537	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198179
133	NC_020537	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198179
134	NC_020537	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198179
135	NC_020537	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198179
136	NC_020537	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198180
137	NC_020537	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	470198180
138	NC_020537	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	470198180
139	NC_020537	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198180
140	NC_020537	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198180
141	NC_020537	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	470198180
142	NC_020537	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198180
143	NC_020537	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470198180
144	NC_020537	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198180
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147	NC_020537	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198180
148	NC_020537	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	470198180
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152	NC_020537	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198180
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156	NC_020537	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198180
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168	NC_020537	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	470198180
169	NC_020537	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	470198180
170	NC_020537	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198180
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172	NC_020537	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198180
173	NC_020537	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470198180
174	NC_020537	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	470198180
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177	NC_020537	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_020537	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020537	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	470198181
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182	NC_020537	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470198181
183	NC_020537	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198181
184	NC_020537	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	470198181
185	NC_020537	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198181
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189	NC_020537	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	470198181
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254	NC_020537	A	7	7	9676	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020537	TGG	2	6	9813	9818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198182
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260	NC_020537	ACA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198182
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269	NC_020537	TCT	2	6	10531	10536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198182
270	NC_020537	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020537	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_020537	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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