MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020537	GTT	2	6	609540	609545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198606
14502	NC_020537	CTTT	2	8	609717	609724	0 %	75 %	0 %	25 %	470198607
14503	NC_020537	ATA	3	9	609749	609757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198607
14504	NC_020537	TCA	2	6	609764	609769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198607
14505	NC_020537	TGA	2	6	609813	609818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_020537	TTG	2	6	609819	609824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_020537	TCAT	2	8	609832	609839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14508	NC_020537	GAATG	2	10	609914	609923	40 %	20 %	40 %	0 %	470198608
14509	NC_020537	AAC	2	6	609945	609950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198608
14510	NC_020537	T	6	6	609978	609983	0 %	100 %	0 %	0 %	470198608
14511	NC_020537	AT	4	8	610028	610035	50 %	50 %	0 %	0 %	470198608
14512	NC_020537	GTT	2	6	610072	610077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198608
14513	NC_020537	GAT	2	6	610192	610197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198608
14514	NC_020537	TTGG	2	8	610310	610317	0 %	50 %	50 %	0 %	470198608
14515	NC_020537	TGA	2	6	610329	610334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198608
14516	NC_020537	ATT	2	6	610336	610341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198608
14517	NC_020537	TGT	2	6	610368	610373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198608
14518	NC_020537	A	6	6	610403	610408	100 %	0 %	0 %	0 %	470198608
14519	NC_020537	TAT	2	6	610437	610442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198608
14520	NC_020537	AATT	2	8	610545	610552	50 %	50 %	0 %	0 %	470198608
14521	NC_020537	AGCAG	2	10	610623	610632	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14522	NC_020537	CATGAC	2	12	610639	610650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_020537	CATA	2	8	610671	610678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14524	NC_020537	AAC	2	6	610727	610732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_020537	TCG	2	6	610740	610745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_020537	TCA	2	6	610794	610799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_020537	GCT	2	6	610807	610812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_020537	GTAAA	2	10	610832	610841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_020537	CAT	3	9	610855	610863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_020537	CAA	3	9	610891	610899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_020537	GAT	2	6	610912	610917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_020537	CAA	2	6	610958	610963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_020537	TAA	2	6	611003	611008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020537	TTA	2	6	611052	611057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020537	TA	3	6	611067	611072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_020537	ATT	2	6	611091	611096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020537	TAT	2	6	611097	611102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_020537	GAT	2	6	611121	611126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_020537	ACG	2	6	611209	611214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_020537	ATT	2	6	611238	611243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_020537	TCAA	2	8	611272	611279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14542	NC_020537	GCTG	2	8	611290	611297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14543	NC_020537	TAT	2	6	611313	611318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020537	TA	3	6	611336	611341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_020537	TGG	2	6	611388	611393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_020537	TCA	2	6	611402	611407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_020537	TAA	2	6	611499	611504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_020537	AAT	2	6	611506	611511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_020537	A	7	7	611579	611585	100 %	0 %	0 %	0 %	470198609
14550	NC_020537	ATAG	2	8	611596	611603	50 %	25 %	25 %	0 %	470198609
14551	NC_020537	AAAAC	2	10	611613	611622	80 %	0 %	0 %	20 %	470198609
14552	NC_020537	GCA	2	6	611722	611727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198609
14553	NC_020537	ATT	2	6	611751	611756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14554	NC_020537	GTTA	2	8	611773	611780	25 %	50 %	25 %	0 %	470198609
14555	NC_020537	TAG	2	6	611789	611794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198609
14556	NC_020537	AG	3	6	611793	611798	50 %	0 %	50 %	0 %	470198609
14557	NC_020537	TCT	2	6	611861	611866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198609
14558	NC_020537	CAT	2	6	611867	611872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198609
14559	NC_020537	AAT	2	6	611962	611967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198609
14560	NC_020537	ATT	2	6	612016	612021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14561	NC_020537	TAC	2	6	612032	612037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198609
14562	NC_020537	ATT	2	6	612092	612097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14563	NC_020537	TG	3	6	612100	612105	0 %	50 %	50 %	0 %	470198609
14564	NC_020537	TCG	2	6	612116	612121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198609
14565	NC_020537	TAT	2	6	612122	612127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14566	NC_020537	TAA	2	6	612153	612158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198609
14567	NC_020537	ATA	2	6	612263	612268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198609
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14570	NC_020537	TGT	2	6	612357	612362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198609
14571	NC_020537	TGGT	2	8	612378	612385	0 %	50 %	50 %	0 %	470198609
14572	NC_020537	CAA	2	6	612389	612394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198609
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14575	NC_020537	GCAATT	2	12	612478	612489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470198609
14576	NC_020537	ATG	2	6	612490	612495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198609
14577	NC_020537	TGA	2	6	612524	612529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198609
14578	NC_020537	TAT	2	6	612567	612572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14579	NC_020537	CAA	2	6	612575	612580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198609
14580	NC_020537	TAG	2	6	612635	612640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198609
14581	NC_020537	GT	3	6	612641	612646	0 %	50 %	50 %	0 %	470198609
14582	NC_020537	GAA	2	6	612668	612673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198609
14583	NC_020537	TTA	2	6	612728	612733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14584	NC_020537	ATT	2	6	612753	612758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
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14586	NC_020537	TAT	2	6	612810	612815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198609
14587	NC_020537	TCAT	2	8	612829	612836	25 %	50 %	0 %	25 %	470198609
14588	NC_020537	GTT	2	6	612846	612851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198609
14589	NC_020537	GCA	2	6	612871	612876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198609
14590	NC_020537	ATTGC	2	10	612895	612904	20 %	40 %	20 %	20 %	470198609
14591	NC_020537	ATC	2	6	612916	612921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198609
14592	NC_020537	ATG	2	6	612971	612976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198609
14593	NC_020537	TGA	2	6	613017	613022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198609
14594	NC_020537	GAA	2	6	613030	613035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198609
14595	NC_020537	GAAAAA	2	12	613039	613050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470198609
14596	NC_020537	ATA	2	6	613056	613061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198609
14597	NC_020537	CTT	2	6	613081	613086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_020537	T	6	6	613109	613114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020537	TAT	2	6	613116	613121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_020537	TA	4	8	613154	613161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_020537	AATT	2	8	613236	613243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_020537	AAT	2	6	613261	613266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_020537	ATTG	2	8	613314	613321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020537	TAA	2	6	613335	613340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020537	T	6	6	613348	613353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_020537	ATG	2	6	613411	613416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020537	TA	3	6	613489	613494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_020537	GAA	2	6	613515	613520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_020537	CCAT	2	8	613532	613539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14610	NC_020537	GATA	2	8	613564	613571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_020537	AGA	2	6	613601	613606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_020537	CCA	2	6	613759	613764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198610
14613	NC_020537	TTA	2	6	613787	613792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198610
14614	NC_020537	ATA	2	6	613828	613833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198610
14615	NC_020537	ATCA	2	8	613995	614002	50 %	25 %	0 %	25 %	470198610
14616	NC_020537	ACC	2	6	614007	614012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198610
14617	NC_020537	TGC	2	6	614043	614048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198610
14618	NC_020537	CTG	2	6	614071	614076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198610
14619	NC_020537	AT	3	6	614091	614096	50 %	50 %	0 %	0 %	470198610
14620	NC_020537	T	6	6	614096	614101	0 %	100 %	0 %	0 %	470198610
14621	NC_020537	ATT	2	6	614136	614141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198610
14622	NC_020537	TTA	2	6	614161	614166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198610
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