MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020537	CCA	2	6	41786	41791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_020537	A	6	6	41799	41804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020537	AGCA	2	8	41826	41833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_020537	A	7	7	41856	41862	100 %	0 %	0 %	0 %	470198203
1006	NC_020537	A	6	6	41905	41910	100 %	0 %	0 %	0 %	470198203
1007	NC_020537	ATA	2	6	41927	41932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198203
1008	NC_020537	T	6	6	41944	41949	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1009	NC_020537	T	6	6	41955	41960	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1010	NC_020537	ATT	2	6	41962	41967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198203
1011	NC_020537	CTA	2	6	41982	41987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1012	NC_020537	GACA	2	8	42052	42059	50 %	0 %	25 %	25 %	470198203
1013	NC_020537	T	6	6	42134	42139	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1014	NC_020537	TTC	2	6	42197	42202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198203
1015	NC_020537	ATT	2	6	42203	42208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198203
1016	NC_020537	T	7	7	42207	42213	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1017	NC_020537	GTTT	2	8	42214	42221	0 %	75 %	25 %	0 %	470198203
1018	NC_020537	TTGAA	2	10	42222	42231	40 %	40 %	20 %	0 %	470198203
1019	NC_020537	ATC	2	6	42268	42273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1020	NC_020537	TAT	2	6	42351	42356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198203
1021	NC_020537	T	6	6	42427	42432	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1022	NC_020537	AT	3	6	42539	42544	50 %	50 %	0 %	0 %	470198203
1023	NC_020537	TTGAA	2	10	42568	42577	40 %	40 %	20 %	0 %	470198203
1024	NC_020537	ATC	2	6	42590	42595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1025	NC_020537	TTG	2	6	42651	42656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198203
1026	NC_020537	TCT	2	6	42704	42709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198203
1027	NC_020537	CAT	2	6	42729	42734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1028	NC_020537	AAT	2	6	42807	42812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198203
1029	NC_020537	T	6	6	42832	42837	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1030	NC_020537	TTG	2	6	42890	42895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198203
1031	NC_020537	TCT	2	6	42953	42958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198203
1032	NC_020537	TCT	2	6	42980	42985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198203
1033	NC_020537	TCAT	2	8	43043	43050	25 %	50 %	0 %	25 %	470198203
1034	NC_020537	ATC	2	6	43144	43149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1035	NC_020537	AC	3	6	43166	43171	50 %	0 %	0 %	50 %	470198203
1036	NC_020537	AATA	2	8	43186	43193	75 %	25 %	0 %	0 %	470198203
1037	NC_020537	TAA	2	6	43201	43206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198203
1038	NC_020537	AAG	2	6	43251	43256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198203
1039	NC_020537	CAT	2	6	43279	43284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1040	NC_020537	T	6	6	43305	43310	0 %	100 %	0 %	0 %	470198203
1041	NC_020537	TG	3	6	43337	43342	0 %	50 %	50 %	0 %	470198203
1042	NC_020537	CAT	2	6	43366	43371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198203
1043	NC_020537	CAC	2	6	43392	43397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_020537	TCG	2	6	43412	43417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_020537	CAA	2	6	43440	43445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020537	TTTGT	2	10	43472	43481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020537	TGA	2	6	43578	43583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198204
1048	NC_020537	T	6	6	43586	43591	0 %	100 %	0 %	0 %	470198204
1049	NC_020537	CTTT	2	8	43593	43600	0 %	75 %	0 %	25 %	470198204
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1051	NC_020537	TCA	2	6	43710	43715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198204
1052	NC_020537	ATTG	2	8	43833	43840	25 %	50 %	25 %	0 %	470198204
1053	NC_020537	ATA	2	6	43869	43874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198204
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1055	NC_020537	CAT	2	6	43962	43967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198204
1056	NC_020537	TCA	2	6	44010	44015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198204
1057	NC_020537	TTC	2	6	44034	44039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_020537	ATA	2	6	44055	44060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020537	A	6	6	44060	44065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020537	CAT	2	6	44072	44077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_020537	T	6	6	44119	44124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020537	GTT	2	6	44162	44167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020537	TCT	2	6	44200	44205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_020537	TCTT	2	8	44250	44257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_020537	AT	3	6	44320	44325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020537	TCC	2	6	44347	44352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_020537	ATG	2	6	44369	44374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020537	ATT	2	6	44425	44430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020537	CTT	2	6	44446	44451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_020537	TAG	2	6	44453	44458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020537	TGA	2	6	44539	44544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020537	GATA	2	8	44572	44579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020537	TCA	2	6	44595	44600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020537	TAG	2	6	44604	44609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020537	CTG	2	6	44677	44682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020537	CTT	2	6	44683	44688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_020537	TA	3	6	44832	44837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020537	TTA	2	6	44851	44856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020537	TTG	2	6	44944	44949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020537	TA	3	6	44961	44966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020537	TA	3	6	44969	44974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020537	ATTTGG	2	12	44977	44988	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020537	TTA	2	6	44994	44999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_020537	TAT	2	6	45020	45025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020537	TTAT	3	12	45022	45033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020537	ATA	2	6	45036	45041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020537	TTTTG	2	10	45118	45127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020537	AT	3	6	45190	45195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020537	ATATT	2	10	45239	45248	40 %	60 %	0 %	0 %	470198205
1095	NC_020537	ATT	4	12	45308	45319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198205
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1098	NC_020537	ATT	2	6	45341	45346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198205
1099	NC_020537	TAA	2	6	45479	45484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020537	AGC	2	6	45485	45490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020537	TTG	2	6	45527	45532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020537	TGA	2	6	45585	45590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020537	TGGT	2	8	45592	45599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020537	TCA	2	6	45669	45674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020537	TTG	3	9	45677	45685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020537	TTGA	2	8	45734	45741	25 %	50 %	25 %	0 %	470198206
1107	NC_020537	TAC	2	6	45874	45879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198206
1108	NC_020537	GT	3	6	45918	45923	0 %	50 %	50 %	0 %	470198206
1109	NC_020537	ATT	2	6	45971	45976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198206
1110	NC_020537	ACTT	2	8	46021	46028	25 %	50 %	0 %	25 %	470198206
1111	NC_020537	TAA	2	6	46068	46073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198206
1112	NC_020537	GT	3	6	46079	46084	0 %	50 %	50 %	0 %	470198206
1113	NC_020537	CGT	2	6	46124	46129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198206
1114	NC_020537	GAATT	2	10	46156	46165	40 %	40 %	20 %	0 %	470198206
1115	NC_020537	GA	3	6	46187	46192	50 %	0 %	50 %	0 %	470198206
1116	NC_020537	T	6	6	46228	46233	0 %	100 %	0 %	0 %	470198206
1117	NC_020537	AT	3	6	46307	46312	50 %	50 %	0 %	0 %	470198206
1118	NC_020537	T	6	6	46351	46356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020537	TTA	2	6	46370	46375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020537	ATA	2	6	46399	46404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020537	TTTC	2	8	46457	46464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_020537	A	6	6	46543	46548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020537	TTC	2	6	46570	46575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020537	GTAA	2	8	46583	46590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020537	CAT	2	6	46659	46664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_020537	AT	4	8	46723	46730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020537	CAA	2	6	46731	46736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_020537	TC	3	6	46810	46815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_020537	AC	3	6	46821	46826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_020537	CCT	2	6	46835	46840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_020537	TTC	2	6	46850	46855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_020537	ATCC	2	8	46871	46878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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