MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020537	A	6	6	420474	420479	100 %	0 %	0 %	0 %	470198480
10003	NC_020537	AAT	2	6	420547	420552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198480
10004	NC_020537	AAG	2	6	420591	420596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020537	CTT	2	6	420627	420632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_020537	GAT	2	6	420644	420649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020537	CTAT	2	8	420717	420724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_020537	TTTA	2	8	420751	420758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020537	TAA	2	6	420787	420792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020537	ATT	2	6	420803	420808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020537	TAA	2	6	420847	420852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_020537	TAA	2	6	420888	420893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_020537	GCA	2	6	420924	420929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198481
10014	NC_020537	TGT	2	6	421232	421237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198481
10015	NC_020537	AAG	2	6	421240	421245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198481
10016	NC_020537	TGG	2	6	421277	421282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198481
10017	NC_020537	TTA	2	6	421307	421312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198481
10018	NC_020537	TA	3	6	421317	421322	50 %	50 %	0 %	0 %	470198481
10019	NC_020537	AG	3	6	421345	421350	50 %	0 %	50 %	0 %	470198481
10020	NC_020537	TACG	2	8	421370	421377	25 %	25 %	25 %	25 %	470198481
10021	NC_020537	AGA	2	6	421400	421405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198481
10022	NC_020537	GGC	2	6	421515	421520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470198481
10023	NC_020537	TAT	2	6	421521	421526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198481
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10026	NC_020537	ACAA	2	8	421550	421557	75 %	0 %	0 %	25 %	470198481
10027	NC_020537	A	6	6	421594	421599	100 %	0 %	0 %	0 %	470198481
10028	NC_020537	ATA	2	6	421635	421640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020537	GAG	2	6	421660	421665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020537	CTT	2	6	421688	421693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_020537	T	6	6	421692	421697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020537	AAT	2	6	421731	421736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020537	A	6	6	421852	421857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020537	A	6	6	421873	421878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020537	TAAT	2	8	421879	421886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020537	TAAC	2	8	421903	421910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_020537	TA	3	6	421968	421973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020537	TAG	2	6	421978	421983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_020537	AT	3	6	422021	422026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020537	TTA	2	6	422107	422112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198482
10041	NC_020537	ACT	2	6	422113	422118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198482
10042	NC_020537	AAAAG	2	10	422154	422163	80 %	0 %	20 %	0 %	470198482
10043	NC_020537	AG	4	8	422166	422173	50 %	0 %	50 %	0 %	470198482
10044	NC_020537	ACA	2	6	422175	422180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198482
10045	NC_020537	TAC	2	6	422209	422214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198482
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10049	NC_020537	AGATAA	2	12	422331	422342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470198482
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10051	NC_020537	AATT	2	8	422387	422394	50 %	50 %	0 %	0 %	470198482
10052	NC_020537	TGG	2	6	422421	422426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198482
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10055	NC_020537	TAA	2	6	422478	422483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198482
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10057	NC_020537	AGA	2	6	422535	422540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198482
10058	NC_020537	TA	3	6	422600	422605	50 %	50 %	0 %	0 %	470198482
10059	NC_020537	CAAT	2	8	422767	422774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_020537	TAA	2	6	422785	422790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020537	AGC	2	6	422797	422802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_020537	AATA	2	8	422820	422827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020537	TCC	2	6	422834	422839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_020537	ATTA	2	8	422953	422960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020537	TTC	2	6	422962	422967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_020537	TTTAAT	2	12	422979	422990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10068	NC_020537	TAA	2	6	423030	423035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020537	TAT	2	6	423041	423046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020537	TAA	2	6	423057	423062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020537	AT	3	6	423073	423078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10088	NC_020537	A	6	6	423630	423635	100 %	0 %	0 %	0 %	470198483
10089	NC_020537	TTA	2	6	423676	423681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198483
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10092	NC_020537	AAG	2	6	423823	423828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020537	TAA	2	6	423834	423839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020537	TAA	3	9	423870	423878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020537	TTA	2	6	423902	423907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020537	GCT	2	6	423909	423914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10098	NC_020537	A	7	7	423981	423987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020537	TAA	2	6	424045	424050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020537	TTTA	2	8	424060	424067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020537	TAA	2	6	424105	424110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020537	AT	3	6	424148	424153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_020537	AAAT	2	8	424166	424173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020537	CATTAG	2	12	424202	424213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470198484
10105	NC_020537	GT	3	6	424229	424234	0 %	50 %	50 %	0 %	470198484
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10109	NC_020537	CAA	2	6	424343	424348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198484
10110	NC_020537	AAAT	2	8	424446	424453	75 %	25 %	0 %	0 %	470198484
10111	NC_020537	A	6	6	424460	424465	100 %	0 %	0 %	0 %	470198484
10112	NC_020537	AT	3	6	424519	424524	50 %	50 %	0 %	0 %	470198484
10113	NC_020537	GTAA	2	8	424573	424580	50 %	25 %	25 %	0 %	470198484
10114	NC_020537	A	6	6	424597	424602	100 %	0 %	0 %	0 %	470198484
10115	NC_020537	GTT	2	6	424635	424640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198484
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10119	NC_020537	ATA	2	6	424887	424892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_020537	AAG	2	6	424897	424902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020537	TA	3	6	424941	424946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020537	TGT	2	6	424970	424975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_020537	GTT	2	6	424979	424984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020537	CAT	2	6	425014	425019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_020537	GTA	2	6	425025	425030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10127	NC_020537	AAT	2	6	425060	425065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10498	NC_020537	TGA	3	9	440140	440148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198499
10499	NC_020537	A	7	7	440155	440161	100 %	0 %	0 %	0 %	470198499
10500	NC_020537	GAA	2	6	440168	440173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198499

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