MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020536	TATT	2	8	649991	649998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_020536	TCT	2	6	650021	650026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_020536	ATA	2	6	650036	650041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_020536	TGG	3	9	650046	650054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_020536	TGG	2	6	650061	650066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_020536	GATT	2	8	650139	650146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020536	ATT	2	6	650161	650166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020536	ATC	2	6	650178	650183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_020536	ATA	2	6	650194	650199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020536	T	6	6	650206	650211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_020536	AAC	2	6	650238	650243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_020536	GTT	2	6	650317	650322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_020536	TGT	2	6	650342	650347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_020536	ATT	2	6	650378	650383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_020536	AT	3	6	650417	650422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_020536	ATCA	2	8	650429	650436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15517	NC_020536	AT	3	6	650466	650471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_020536	ATT	2	6	650490	650495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_020536	TAG	2	6	650519	650524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_020536	TAA	2	6	650536	650541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020536	TGG	2	6	650543	650548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_020536	TTGT	2	8	650556	650563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_020536	TACTTG	2	12	650629	650640	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15524	NC_020536	AGA	2	6	650666	650671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020536	G	6	6	650689	650694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_020536	GAT	2	6	650697	650702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196673
15527	NC_020536	TTA	2	6	650731	650736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15528	NC_020536	A	6	6	650769	650774	100 %	0 %	0 %	0 %	470196673
15529	NC_020536	CAC	2	6	650820	650825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196673
15530	NC_020536	ATT	2	6	650827	650832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15531	NC_020536	GGA	2	6	650887	650892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470196673
15532	NC_020536	ATT	2	6	651042	651047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15533	NC_020536	ATTT	2	8	651086	651093	25 %	75 %	0 %	0 %	470196673
15534	NC_020536	TGC	2	6	651174	651179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196673
15535	NC_020536	ATT	2	6	651181	651186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15536	NC_020536	TGT	2	6	651189	651194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196673
15537	NC_020536	ATT	2	6	651202	651207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15538	NC_020536	TTA	2	6	651223	651228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15539	NC_020536	TCT	2	6	651335	651340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196673
15540	NC_020536	AGC	2	6	651360	651365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196673
15541	NC_020536	GCA	2	6	651421	651426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196673
15542	NC_020536	TTC	2	6	651475	651480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196673
15543	NC_020536	GCT	2	6	651535	651540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196673
15544	NC_020536	AACA	2	8	651648	651655	75 %	0 %	0 %	25 %	470196673
15545	NC_020536	TTG	2	6	651701	651706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196673
15546	NC_020536	TAT	2	6	651726	651731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15547	NC_020536	TAGTT	2	10	651735	651744	20 %	60 %	20 %	0 %	470196673
15548	NC_020536	CAATAT	2	12	651763	651774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196673
15549	NC_020536	A	6	6	651790	651795	100 %	0 %	0 %	0 %	470196673
15550	NC_020536	TAT	2	6	651819	651824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15551	NC_020536	GGC	2	6	651841	651846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470196673
15552	NC_020536	ATT	2	6	651934	651939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196673
15553	NC_020536	TTTA	2	8	651963	651970	25 %	75 %	0 %	0 %	470196673
15554	NC_020536	T	6	6	651977	651982	0 %	100 %	0 %	0 %	470196673
15555	NC_020536	GGA	2	6	652008	652013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470196673
15556	NC_020536	TAG	2	6	652064	652069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196673
15557	NC_020536	TGC	2	6	652092	652097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196673
15558	NC_020536	TGT	2	6	652101	652106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196673
15559	NC_020536	TAT	2	6	652241	652246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196674
15560	NC_020536	CTTT	2	8	652277	652284	0 %	75 %	0 %	25 %	470196674
15561	NC_020536	TA	3	6	652315	652320	50 %	50 %	0 %	0 %	470196674
15562	NC_020536	GAT	2	6	652339	652344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196674
15563	NC_020536	TTTA	2	8	652388	652395	25 %	75 %	0 %	0 %	470196674
15564	NC_020536	TAA	2	6	652403	652408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196674
15565	NC_020536	ATTA	2	8	652426	652433	50 %	50 %	0 %	0 %	470196674
15566	NC_020536	ATT	2	6	652528	652533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196674
15567	NC_020536	T	6	6	652582	652587	0 %	100 %	0 %	0 %	470196674
15568	NC_020536	AGAAAA	2	12	652608	652619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196674
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15570	NC_020536	GAT	2	6	652676	652681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196674
15571	NC_020536	ACAA	2	8	652682	652689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15572	NC_020536	ATT	2	6	652704	652709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_020536	ATT	2	6	652719	652724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_020536	ATC	2	6	652740	652745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_020536	TTTA	2	8	652748	652755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020536	ACA	2	6	652773	652778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_020536	ACA	2	6	652803	652808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_020536	GT	3	6	652834	652839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020536	TTTC	2	8	652861	652868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15580	NC_020536	TGG	2	6	652934	652939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020536	G	6	6	652938	652943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_020536	TGC	2	6	652986	652991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196675
15583	NC_020536	TGT	3	9	652997	653005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196675
15584	NC_020536	TTA	2	6	653024	653029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196675
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15586	NC_020536	TTA	2	6	653107	653112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196675
15587	NC_020536	ATTT	2	8	653131	653138	25 %	75 %	0 %	0 %	470196675
15588	NC_020536	TTA	2	6	653170	653175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196675
15589	NC_020536	TTA	2	6	653189	653194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196675
15590	NC_020536	TCGC	2	8	653225	653232	0 %	25 %	25 %	50 %	470196675
15591	NC_020536	GCT	2	6	653233	653238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196675
15592	NC_020536	A	6	6	653265	653270	100 %	0 %	0 %	0 %	470196675
15593	NC_020536	CA	4	8	653278	653285	50 %	0 %	0 %	50 %	470196675
15594	NC_020536	ATT	2	6	653295	653300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196675
15595	NC_020536	A	6	6	653347	653352	100 %	0 %	0 %	0 %	470196675
15596	NC_020536	T	6	6	653498	653503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_020536	TAT	2	6	653505	653510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_020536	TGT	2	6	653518	653523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_020536	GTT	2	6	653537	653542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_020536	ACAA	2	8	653550	653557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15601	NC_020536	ATAAA	2	10	653564	653573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_020536	AAT	2	6	653578	653583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_020536	AT	3	6	653612	653617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_020536	AG	3	6	653717	653722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_020536	TGT	2	6	653766	653771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196676
15606	NC_020536	TATT	2	8	653849	653856	25 %	75 %	0 %	0 %	470196676
15607	NC_020536	AATTT	2	10	653873	653882	40 %	60 %	0 %	0 %	470196676
15608	NC_020536	AT	3	6	653967	653972	50 %	50 %	0 %	0 %	470196676
15609	NC_020536	TGA	3	9	653981	653989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196676
15610	NC_020536	TAC	2	6	654009	654014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196676
15611	NC_020536	TTTA	2	8	654030	654037	25 %	75 %	0 %	0 %	470196676
15612	NC_020536	AGC	2	6	654069	654074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196676
15613	NC_020536	TGC	2	6	654084	654089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196676
15614	NC_020536	GCAA	2	8	654120	654127	50 %	0 %	25 %	25 %	470196676
15615	NC_020536	AAAGG	2	10	654133	654142	60 %	0 %	40 %	0 %	470196676
15616	NC_020536	ATT	2	6	654183	654188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196676
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15619	NC_020536	TAT	2	6	654204	654209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196676
15620	NC_020536	TTG	2	6	654257	654262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196676
15621	NC_020536	GTT	2	6	654273	654278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196676
15622	NC_020536	TGG	2	6	654294	654299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196676
15623	NC_020536	TGGT	2	8	654305	654312	0 %	50 %	50 %	0 %	470196676
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15625	NC_020536	GCA	2	6	654460	654465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196676
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15745	NC_020536	TAA	3	9	659223	659231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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