MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020536	TGA	2	6	609836	609841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_020536	TTG	2	6	609842	609847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_020536	TCAT	2	8	609855	609862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14504	NC_020536	GAATG	2	10	609937	609946	40 %	20 %	40 %	0 %	470196641
14505	NC_020536	AAC	2	6	609968	609973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196641
14506	NC_020536	T	6	6	610001	610006	0 %	100 %	0 %	0 %	470196641
14507	NC_020536	AT	4	8	610051	610058	50 %	50 %	0 %	0 %	470196641
14508	NC_020536	GTT	2	6	610095	610100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196641
14509	NC_020536	GAT	2	6	610215	610220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196641
14510	NC_020536	TTGG	2	8	610333	610340	0 %	50 %	50 %	0 %	470196641
14511	NC_020536	TGA	2	6	610352	610357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196641
14512	NC_020536	ATT	2	6	610359	610364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196641
14513	NC_020536	TGT	2	6	610391	610396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196641
14514	NC_020536	A	6	6	610426	610431	100 %	0 %	0 %	0 %	470196641
14515	NC_020536	TAT	2	6	610460	610465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196641
14516	NC_020536	AATT	2	8	610568	610575	50 %	50 %	0 %	0 %	470196641
14517	NC_020536	AGCAG	2	10	610646	610655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14518	NC_020536	CATGAC	2	12	610662	610673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_020536	CATA	2	8	610694	610701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14520	NC_020536	AAC	2	6	610750	610755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_020536	TCG	2	6	610763	610768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_020536	TCA	2	6	610817	610822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_020536	GCT	2	6	610830	610835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_020536	GTAAA	2	10	610855	610864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020536	CAT	3	9	610878	610886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_020536	CAA	3	9	610914	610922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_020536	GAT	2	6	610935	610940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020536	CAA	2	6	610981	610986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_020536	TAA	2	6	611026	611031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_020536	TTA	2	6	611075	611080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_020536	TA	3	6	611090	611095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_020536	ATT	2	6	611114	611119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_020536	TAT	2	6	611120	611125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020536	GAT	2	6	611144	611149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020536	ACG	2	6	611232	611237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_020536	ATT	2	6	611261	611266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020536	TCAA	2	8	611295	611302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14538	NC_020536	GCTG	2	8	611313	611320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14539	NC_020536	TAT	2	6	611336	611341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_020536	TA	3	6	611359	611364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_020536	TGG	2	6	611411	611416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_020536	TCA	2	6	611425	611430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_020536	TAA	2	6	611522	611527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020536	AAT	2	6	611529	611534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_020536	A	7	7	611602	611608	100 %	0 %	0 %	0 %	470196642
14546	NC_020536	ATAG	2	8	611619	611626	50 %	25 %	25 %	0 %	470196642
14547	NC_020536	AAAAC	2	10	611636	611645	80 %	0 %	0 %	20 %	470196642
14548	NC_020536	GCA	2	6	611745	611750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196642
14549	NC_020536	ATT	2	6	611774	611779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14550	NC_020536	GTTA	2	8	611796	611803	25 %	50 %	25 %	0 %	470196642
14551	NC_020536	TAG	2	6	611812	611817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196642
14552	NC_020536	AG	3	6	611816	611821	50 %	0 %	50 %	0 %	470196642
14553	NC_020536	TCT	2	6	611884	611889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196642
14554	NC_020536	CAT	2	6	611890	611895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196642
14555	NC_020536	AAT	2	6	611985	611990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196642
14556	NC_020536	ATT	2	6	612039	612044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14557	NC_020536	TAC	2	6	612055	612060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196642
14558	NC_020536	ATT	2	6	612115	612120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14559	NC_020536	TG	3	6	612123	612128	0 %	50 %	50 %	0 %	470196642
14560	NC_020536	TCG	2	6	612139	612144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196642
14561	NC_020536	TAT	2	6	612145	612150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14562	NC_020536	TAA	2	6	612176	612181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196642
14563	NC_020536	ATA	2	6	612286	612291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196642
14564	NC_020536	CAG	2	6	612301	612306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196642
14565	NC_020536	AGC	2	6	612362	612367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196642
14566	NC_020536	TGT	2	6	612380	612385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196642
14567	NC_020536	TGGT	2	8	612401	612408	0 %	50 %	50 %	0 %	470196642
14568	NC_020536	CAA	2	6	612412	612417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196642
14569	NC_020536	TCA	2	6	612419	612424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196642
14570	NC_020536	CAT	2	6	612469	612474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196642
14571	NC_020536	GCAATT	2	12	612501	612512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196642
14572	NC_020536	ATG	2	6	612513	612518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196642
14573	NC_020536	TGA	2	6	612547	612552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196642
14574	NC_020536	TAT	2	6	612590	612595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14575	NC_020536	CAA	2	6	612598	612603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196642
14576	NC_020536	TAG	2	6	612658	612663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196642
14577	NC_020536	GT	3	6	612664	612669	0 %	50 %	50 %	0 %	470196642
14578	NC_020536	GAA	2	6	612691	612696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196642
14579	NC_020536	TTA	2	6	612751	612756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14580	NC_020536	ATT	2	6	612776	612781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14581	NC_020536	AACA	2	8	612789	612796	75 %	0 %	0 %	25 %	470196642
14582	NC_020536	TAT	2	6	612833	612838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196642
14583	NC_020536	TCAT	2	8	612852	612859	25 %	50 %	0 %	25 %	470196642
14584	NC_020536	GTT	2	6	612869	612874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196642
14585	NC_020536	GCA	2	6	612894	612899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196642
14586	NC_020536	ATTGC	2	10	612918	612927	20 %	40 %	20 %	20 %	470196642
14587	NC_020536	ATC	2	6	612939	612944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196642
14588	NC_020536	ATG	2	6	612994	612999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196642
14589	NC_020536	TGA	2	6	613040	613045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196642
14590	NC_020536	GAA	2	6	613053	613058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196642
14591	NC_020536	GAAAAA	2	12	613062	613073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196642
14592	NC_020536	ATA	2	6	613079	613084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196642
14593	NC_020536	CTT	2	6	613104	613109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_020536	T	6	6	613132	613137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_020536	TAT	2	6	613139	613144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_020536	TA	4	8	613177	613184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_020536	AATT	2	8	613259	613266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_020536	AAT	2	6	613284	613289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020536	ATTG	2	8	613337	613344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_020536	TAA	2	6	613358	613363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_020536	T	6	6	613371	613376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_020536	ATG	2	6	613434	613439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_020536	TA	3	6	613512	613517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020536	GAA	2	6	613538	613543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020536	CCAT	2	8	613555	613562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14606	NC_020536	GATA	2	8	613587	613594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020536	AGA	2	6	613624	613629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_020536	CCA	2	6	613782	613787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196643
14609	NC_020536	TTA	2	6	613810	613815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196643
14610	NC_020536	ATA	2	6	613851	613856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196643
14611	NC_020536	ATCA	2	8	614018	614025	50 %	25 %	0 %	25 %	470196643
14612	NC_020536	ACC	2	6	614030	614035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196643
14613	NC_020536	TGC	2	6	614066	614071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196643
14614	NC_020536	CTG	2	6	614094	614099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196643
14615	NC_020536	AT	3	6	614114	614119	50 %	50 %	0 %	0 %	470196643
14616	NC_020536	T	6	6	614119	614124	0 %	100 %	0 %	0 %	470196643
14617	NC_020536	ATT	2	6	614159	614164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196643
14618	NC_020536	TTA	2	6	614184	614189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196643
14619	NC_020536	TTA	2	6	614203	614208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196643
14620	NC_020536	T	7	7	614318	614324	0 %	100 %	0 %	0 %	470196643
14621	NC_020536	TCT	2	6	614343	614348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196643
14622	NC_020536	AGC	2	6	614387	614392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196643
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14624	NC_020536	TTC	2	6	614432	614437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196643
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14994	NC_020536	ATT	2	6	629785	629790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196656
14995	NC_020536	TGG	2	6	629931	629936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196656
14996	NC_020536	TAT	2	6	630021	630026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196656
14997	NC_020536	CTG	2	6	630032	630037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196656
14998	NC_020536	CAT	2	6	630051	630056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196656
14999	NC_020536	T	6	6	630138	630143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15000	NC_020536	TTATTT	2	12	630150	630161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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