MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020536	GACT	2	8	568149	568156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13502	NC_020536	ATA	2	6	568174	568179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_020536	TAAA	2	8	568185	568192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_020536	TTG	2	6	568194	568199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_020536	T	6	6	568239	568244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_020536	AATT	2	8	568302	568309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_020536	TACAGC	2	12	568362	568373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196613
13508	NC_020536	TCA	2	6	568390	568395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196613
13509	NC_020536	AGAA	2	8	568459	568466	75 %	0 %	25 %	0 %	470196613
13510	NC_020536	AAT	2	6	568487	568492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196613
13511	NC_020536	TCT	2	6	568501	568506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196613
13512	NC_020536	ATC	2	6	568510	568515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196613
13513	NC_020536	CTT	2	6	568559	568564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196613
13514	NC_020536	TAA	2	6	568565	568570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196613
13515	NC_020536	TTA	2	6	568588	568593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196613
13516	NC_020536	TTGCTA	2	12	568643	568654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196613
13517	NC_020536	GATC	2	8	568811	568818	25 %	25 %	25 %	25 %	470196613
13518	NC_020536	ATT	2	6	568828	568833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196613
13519	NC_020536	T	6	6	568832	568837	0 %	100 %	0 %	0 %	470196613
13520	NC_020536	ACC	2	6	568905	568910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196613
13521	NC_020536	TGAA	2	8	568968	568975	50 %	25 %	25 %	0 %	470196613
13522	NC_020536	TCTA	2	8	569019	569026	25 %	50 %	0 %	25 %	470196613
13523	NC_020536	ACC	2	6	569064	569069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196613
13524	NC_020536	TTC	2	6	569079	569084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196613
13525	NC_020536	ACA	2	6	569104	569109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196613
13526	NC_020536	TAA	2	6	569118	569123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196613
13527	NC_020536	AGTA	2	8	569154	569161	50 %	25 %	25 %	0 %	470196613
13528	NC_020536	CAT	2	6	569177	569182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196613
13529	NC_020536	GCAT	2	8	569191	569198	25 %	25 %	25 %	25 %	470196613
13530	NC_020536	TTC	2	6	569397	569402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196613
13531	NC_020536	TAT	2	6	569462	569467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196613
13532	NC_020536	ACT	2	6	569500	569505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196613
13533	NC_020536	AAT	2	6	569512	569517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_020536	ATGA	2	8	569580	569587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_020536	TA	3	6	569655	569660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_020536	AAATCA	2	12	569766	569777	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470196614
13537	NC_020536	ATT	2	6	569811	569816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196614
13538	NC_020536	CAA	2	6	569826	569831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196614
13539	NC_020536	AGC	2	6	569857	569862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196614
13540	NC_020536	CAAT	2	8	569901	569908	50 %	25 %	0 %	25 %	470196614
13541	NC_020536	ACG	2	6	569925	569930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196614
13542	NC_020536	AGA	2	6	569935	569940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196614
13543	NC_020536	TCAG	2	8	569983	569990	25 %	25 %	25 %	25 %	470196614
13544	NC_020536	GCT	2	6	570008	570013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196614
13545	NC_020536	ATG	2	6	570036	570041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196614
13546	NC_020536	ATT	2	6	570074	570079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196614
13547	NC_020536	GATG	2	8	570080	570087	25 %	25 %	50 %	0 %	470196614
13548	NC_020536	ATT	2	6	570107	570112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196614
13549	NC_020536	GAT	2	6	570134	570139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196614
13550	NC_020536	AAG	2	6	570156	570161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196614
13551	NC_020536	CAATA	2	10	570176	570185	60 %	20 %	0 %	20 %	470196614
13552	NC_020536	ATGG	2	8	570218	570225	25 %	25 %	50 %	0 %	470196614
13553	NC_020536	AGA	2	6	570262	570267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196614
13554	NC_020536	TTA	2	6	570275	570280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196614
13555	NC_020536	GAC	2	6	570290	570295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196614
13556	NC_020536	GGC	2	6	570407	570412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470196614
13557	NC_020536	CAT	2	6	570480	570485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196614
13558	NC_020536	A	6	6	570583	570588	100 %	0 %	0 %	0 %	470196614
13559	NC_020536	ATT	2	6	570647	570652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196614
13560	NC_020536	TGA	2	6	570655	570660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196614
13561	NC_020536	A	6	6	570660	570665	100 %	0 %	0 %	0 %	470196614
13562	NC_020536	ATTT	3	12	570852	570863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_020536	T	7	7	570891	570897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_020536	GTTTA	2	10	570901	570910	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_020536	T	6	6	570996	571001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_020536	ATT	2	6	571020	571025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_020536	GT	3	6	571064	571069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_020536	TAG	2	6	571085	571090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_020536	TA	3	6	571095	571100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_020536	TAAG	2	8	571142	571149	50 %	25 %	25 %	0 %	470196615
13571	NC_020536	CAAC	2	8	571150	571157	50 %	0 %	0 %	50 %	470196615
13572	NC_020536	AGA	2	6	571170	571175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196615
13573	NC_020536	TGA	2	6	571286	571291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196615
13574	NC_020536	TGC	2	6	571293	571298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196615
13575	NC_020536	AG	3	6	571302	571307	50 %	0 %	50 %	0 %	470196615
13576	NC_020536	TAT	2	6	571313	571318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196615
13577	NC_020536	ATC	2	6	571349	571354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196615
13578	NC_020536	TTA	2	6	571366	571371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196615
13579	NC_020536	CAT	2	6	571378	571383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196615
13580	NC_020536	TAA	2	6	571491	571496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196615
13581	NC_020536	GAAA	2	8	571500	571507	75 %	0 %	25 %	0 %	470196615
13582	NC_020536	A	7	7	571521	571527	100 %	0 %	0 %	0 %	470196615
13583	NC_020536	TGC	2	6	571599	571604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196615
13584	NC_020536	GTT	2	6	571606	571611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196615
13585	NC_020536	CAA	2	6	571636	571641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196615
13586	NC_020536	CAG	2	6	571697	571702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196615
13587	NC_020536	ACT	2	6	571704	571709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196615
13588	NC_020536	CAG	2	6	571712	571717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196615
13589	NC_020536	TTA	2	6	571843	571848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196615
13590	NC_020536	AGT	2	6	571866	571871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196615
13591	NC_020536	ACG	2	6	571874	571879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196615
13592	NC_020536	GAA	2	6	571889	571894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196615
13593	NC_020536	ATT	2	6	571911	571916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196615
13594	NC_020536	ATAA	2	8	571991	571998	75 %	25 %	0 %	0 %	470196615
13595	NC_020536	ATTA	2	8	572005	572012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_020536	GAG	2	6	572013	572018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_020536	T	8	8	572045	572052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_020536	TAT	2	6	572087	572092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_020536	TAA	2	6	572123	572128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_020536	GGA	2	6	572145	572150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_020536	ATG	2	6	572154	572159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196616
13602	NC_020536	GT	3	6	572200	572205	0 %	50 %	50 %	0 %	470196616
13603	NC_020536	TAAT	2	8	572209	572216	50 %	50 %	0 %	0 %	470196616
13604	NC_020536	AGT	2	6	572231	572236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196616
13605	NC_020536	CATA	2	8	572304	572311	50 %	25 %	0 %	25 %	470196616
13606	NC_020536	ATT	2	6	572332	572337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196616
13607	NC_020536	GAA	2	6	572349	572354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196616
13608	NC_020536	AT	3	6	572363	572368	50 %	50 %	0 %	0 %	470196616
13609	NC_020536	TAG	2	6	572401	572406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196616
13610	NC_020536	CTA	2	6	572431	572436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196616
13611	NC_020536	CAT	2	6	572523	572528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196616
13612	NC_020536	AAG	2	6	572539	572544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196616
13613	NC_020536	ATA	3	9	572575	572583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196616
13614	NC_020536	TAG	2	6	572612	572617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196616
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13617	NC_020536	A	6	6	572674	572679	100 %	0 %	0 %	0 %	470196616
13618	NC_020536	TAT	2	6	572687	572692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196616
13619	NC_020536	GATTG	2	10	572703	572712	20 %	40 %	40 %	0 %	470196616
13620	NC_020536	TAAA	2	8	572713	572720	75 %	25 %	0 %	0 %	470196616
13621	NC_020536	TAA	2	6	572726	572731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196616
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