MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020536	TCA	2	6	547706	547711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196600
13003	NC_020536	AGA	2	6	547763	547768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196600
13004	NC_020536	A	6	6	547791	547796	100 %	0 %	0 %	0 %	470196600
13005	NC_020536	GGT	2	6	547914	547919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196600
13006	NC_020536	CAT	2	6	547938	547943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196600
13007	NC_020536	ATT	2	6	547993	547998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196600
13008	NC_020536	A	6	6	548032	548037	100 %	0 %	0 %	0 %	470196600
13009	NC_020536	ATT	2	6	548076	548081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196600
13010	NC_020536	AAG	2	6	548083	548088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196600
13011	NC_020536	AATT	2	8	548209	548216	50 %	50 %	0 %	0 %	470196600
13012	NC_020536	GC	3	6	548222	548227	0 %	0 %	50 %	50 %	470196600
13013	NC_020536	CTA	2	6	548236	548241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196600
13014	NC_020536	AT	3	6	548261	548266	50 %	50 %	0 %	0 %	470196600
13015	NC_020536	ATGA	2	8	548307	548314	50 %	25 %	25 %	0 %	470196600
13016	NC_020536	AATA	2	8	548370	548377	75 %	25 %	0 %	0 %	470196600
13017	NC_020536	ACA	2	6	548391	548396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196600
13018	NC_020536	ATT	2	6	548486	548491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196600
13019	NC_020536	AGA	2	6	548603	548608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196600
13020	NC_020536	CAA	2	6	548644	548649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_020536	ATT	2	6	548664	548669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_020536	AT	3	6	548688	548693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020536	GTAC	2	8	548719	548726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_020536	TAA	2	6	548757	548762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_020536	A	6	6	548779	548784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020536	GAA	2	6	548851	548856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_020536	TTTA	2	8	548966	548973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020536	A	6	6	548975	548980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020536	GAA	2	6	548983	548988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020536	ATT	2	6	549000	549005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_020536	AAATA	2	10	549006	549015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020536	TTG	2	6	549063	549068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196601
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13035	NC_020536	AAG	2	6	549129	549134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196601
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13038	NC_020536	A	6	6	549183	549188	100 %	0 %	0 %	0 %	470196601
13039	NC_020536	T	6	6	549223	549228	0 %	100 %	0 %	0 %	470196601
13040	NC_020536	CAC	2	6	549237	549242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196601
13041	NC_020536	AAAAAG	2	12	549309	549320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470196601
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13043	NC_020536	TTA	2	6	549417	549422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196601
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13046	NC_020536	GCA	2	6	549734	549739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196601
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13050	NC_020536	ATT	2	6	549940	549945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196602
13051	NC_020536	TGAG	2	8	550115	550122	25 %	25 %	50 %	0 %	470196602
13052	NC_020536	ATC	2	6	550158	550163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196602
13053	NC_020536	GA	3	6	550176	550181	50 %	0 %	50 %	0 %	470196602
13054	NC_020536	GAT	2	6	550219	550224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196602
13055	NC_020536	TCT	2	6	550261	550266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196602
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13057	NC_020536	CAT	2	6	550303	550308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196602
13058	NC_020536	TAGA	2	8	550373	550380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020536	ATTA	2	8	550493	550500	50 %	50 %	0 %	0 %	470196603
13060	NC_020536	AGA	2	6	550541	550546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196603
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13062	NC_020536	AGC	2	6	550609	550614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196603
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13064	NC_020536	ATT	2	6	550765	550770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196603
13065	NC_020536	TG	3	6	550849	550854	0 %	50 %	50 %	0 %	470196603
13066	NC_020536	GA	3	6	550868	550873	50 %	0 %	50 %	0 %	470196603
13067	NC_020536	ATAAA	2	10	550936	550945	80 %	20 %	0 %	0 %	470196603
13068	NC_020536	TGAAT	2	10	550984	550993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020536	TTAC	2	8	551003	551010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_020536	GTATA	2	10	551041	551050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_020536	TAT	2	6	551055	551060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_020536	ATT	2	6	551076	551081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_020536	AAG	2	6	551143	551148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13075	NC_020536	CA	3	6	551199	551204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13078	NC_020536	ATA	2	6	551248	551253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_020536	A	6	6	551287	551292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020536	A	6	6	551327	551332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13082	NC_020536	AAG	2	6	551348	551353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_020536	TTC	2	6	551395	551400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_020536	TAT	2	6	551450	551455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_020536	GAA	2	6	551482	551487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196604
13086	NC_020536	CATA	2	8	551515	551522	50 %	25 %	0 %	25 %	470196604
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13090	NC_020536	A	7	7	551662	551668	100 %	0 %	0 %	0 %	470196604
13091	NC_020536	TGCAGG	2	12	551763	551774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470196604
13092	NC_020536	AGA	2	6	551799	551804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196604
13093	NC_020536	AAAGA	2	10	551836	551845	80 %	0 %	20 %	0 %	470196604
13094	NC_020536	TAG	2	6	551960	551965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196604
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13096	NC_020536	TTA	2	6	552038	552043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_020536	A	6	6	552059	552064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_020536	T	6	6	552074	552079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_020536	AGG	2	6	552191	552196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020536	A	6	6	552211	552216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_020536	GTT	2	6	552226	552231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020536	CAC	2	6	552266	552271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_020536	CAT	2	6	552306	552311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_020536	ATT	2	6	552361	552366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_020536	CATTTA	2	12	552398	552409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13106	NC_020536	A	6	6	552442	552447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_020536	CAAA	2	8	552479	552486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_020536	GCT	2	6	552556	552561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_020536	GAA	2	6	552565	552570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_020536	TAT	2	6	552582	552587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020536	GTA	2	6	552602	552607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_020536	AAT	2	6	552623	552628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_020536	ATA	2	6	552683	552688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020536	ATG	2	6	552689	552694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_020536	TGAT	2	8	552727	552734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020536	TTC	2	6	552751	552756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_020536	TGT	2	6	552757	552762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020536	GGA	2	6	552795	552800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_020536	AGG	2	6	552821	552826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_020536	A	6	6	552841	552846	100 %	0 %	0 %	0 %	470196605
13121	NC_020536	AAG	2	6	552860	552865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196605
13122	NC_020536	GAA	2	6	552904	552909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196605
13123	NC_020536	AATTA	2	10	552912	552921	60 %	40 %	0 %	0 %	470196605
13124	NC_020536	CAA	2	6	553003	553008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196605
13125	NC_020536	GTG	2	6	553013	553018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196605
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13127	NC_020536	GCA	2	6	553099	553104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196605
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13251	NC_020536	CGA	2	6	558371	558376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196608
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13357	NC_020536	TA	3	6	562997	563002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13359	NC_020536	GGA	2	6	563116	563121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_020536	ATT	2	6	563125	563130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_020536	AACA	2	8	563156	563163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13362	NC_020536	AAAG	2	8	563203	563210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_020536	ATT	2	6	563228	563233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13364	NC_020536	ATCA	2	8	563279	563286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13365	NC_020536	T	6	6	563305	563310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13366	NC_020536	TAG	2	6	563364	563369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_020536	TACT	2	8	563400	563407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13368	NC_020536	TTTA	2	8	563412	563419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13369	NC_020536	ACC	2	6	563432	563437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13494	NC_020536	AAT	2	6	568031	568036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196612
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13497	NC_020536	T	7	7	568088	568094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_020536	AGA	2	6	568127	568132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_020536	AAT	2	6	568135	568140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_020536	TGA	2	6	568141	568146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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