MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020536	TAA	2	6	482104	482109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_020536	TAAT	2	8	482116	482123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_020536	A	6	6	482137	482142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020536	A	6	6	482185	482190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_020536	ATT	2	6	482211	482216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020536	CAT	2	6	482239	482244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_020536	GGC	2	6	482286	482291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_020536	GCTT	2	8	482329	482336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11509	NC_020536	GCG	2	6	482348	482353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_020536	ACCT	2	8	482377	482384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11511	NC_020536	ATA	2	6	482426	482431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_020536	GCA	2	6	482606	482611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_020536	CGC	2	6	482653	482658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_020536	GTGA	2	8	482659	482666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_020536	TTA	2	6	482694	482699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020536	GAA	2	6	482702	482707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020536	GTAA	2	8	482715	482722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020536	CAG	2	6	482774	482779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_020536	ATT	2	6	482815	482820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_020536	GC	3	6	482830	482835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_020536	T	6	6	482844	482849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_020536	AGA	2	6	482915	482920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_020536	GGA	2	6	482965	482970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020536	TGC	2	6	483110	483115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_020536	GAA	2	6	483229	483234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_020536	GGT	2	6	483305	483310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020536	GTC	2	6	483319	483324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_020536	TCGTG	2	10	483328	483337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11529	NC_020536	CAT	2	6	483387	483392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_020536	GGA	2	6	483431	483436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020536	ATC	2	6	483455	483460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_020536	AC	3	6	483482	483487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_020536	GTT	2	6	483547	483552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_020536	AC	3	6	483651	483656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11535	NC_020536	CAC	2	6	483666	483671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_020536	CCT	2	6	483793	483798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_020536	AT	3	6	483807	483812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_020536	TCT	2	6	483821	483826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_020536	GAA	2	6	483827	483832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020536	TGTT	2	8	483871	483878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020536	GGT	2	6	483941	483946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_020536	TTAAT	2	10	483969	483978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020536	AGG	2	6	484027	484032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020536	CCA	2	6	484057	484062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_020536	TAAG	2	8	484086	484093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020536	AAT	2	6	484162	484167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_020536	TAA	2	6	484198	484203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020536	TGG	2	6	484263	484268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020536	TTA	2	6	484283	484288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020536	ACG	2	6	484340	484345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_020536	GTAA	2	8	484363	484370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_020536	GGA	2	6	484489	484494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020536	AGAA	2	8	484497	484504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020536	TAG	2	6	484518	484523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11556	NC_020536	CAA	2	6	484552	484557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_020536	GCTT	2	8	484558	484565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11558	NC_020536	GAC	2	6	484603	484608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11560	NC_020536	TAA	2	6	484646	484651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_020536	TGT	2	6	484667	484672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_020536	CT	3	6	484673	484678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_020536	ACG	2	6	484695	484700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_020536	GGA	2	6	484728	484733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020536	CT	3	6	484754	484759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_020536	AGT	2	6	484849	484854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_020536	GGA	2	6	485045	485050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020536	TC	3	6	485131	485136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_020536	TGA	2	6	485164	485169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11571	NC_020536	ACC	2	6	485309	485314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_020536	AT	3	6	485330	485335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11575	NC_020536	ACC	2	6	485715	485720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_020536	G	6	6	485740	485745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_020536	GATTG	2	10	485771	485780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11581	NC_020536	CGG	2	6	486204	486209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_020536	GA	3	6	486302	486307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020536	TAGG	2	8	486420	486427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_020536	TGG	2	6	486466	486471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11588	NC_020536	CCT	2	6	486562	486567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_020536	TCAT	2	8	486614	486621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11590	NC_020536	GGT	2	6	486698	486703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11593	NC_020536	GAG	2	6	486942	486947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020536	TG	3	6	487028	487033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020536	C	6	6	487069	487074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11598	NC_020536	AAAT	2	8	487198	487205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020536	TACT	2	8	487229	487236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_020536	AGG	2	6	487287	487292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_020536	A	6	6	487386	487391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_020536	T	8	8	487428	487435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020536	AAAG	2	8	487467	487474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020536	TAG	2	6	487535	487540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11606	NC_020536	A	6	6	487662	487667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020536	T	7	7	487704	487710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020536	TAG	2	6	487811	487816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_020536	AAGC	2	8	487854	487861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11610	NC_020536	AATG	2	8	487944	487951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020536	TAA	2	6	487985	487990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020536	ATT	2	6	488003	488008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_020536	TAT	2	6	488049	488054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020536	CAG	2	6	488065	488070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_020536	ATC	2	6	488092	488097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_020536	CTG	2	6	488101	488106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_020536	ATTA	2	8	488156	488163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020536	AAG	2	6	488210	488215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020536	TA	3	6	488222	488227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_020536	TAAA	2	8	488265	488272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020536	TAAA	2	8	488302	488309	75 %	25 %	0 %	0 %	470196562
11622	NC_020536	AAG	3	9	488326	488334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196562
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11628	NC_020536	A	6	6	488565	488570	100 %	0 %	0 %	0 %	470196562
11629	NC_020536	CAA	2	6	488631	488636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196562
11630	NC_020536	TAA	2	6	488684	488689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196562
11631	NC_020536	AAT	2	6	488709	488714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196562
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11633	NC_020536	GC	3	6	488836	488841	0 %	0 %	50 %	50 %	470196562
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