MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020536	TCA	2	6	2216177	2216182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197770
53002	NC_020536	AGC	2	6	2216218	2216223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470197770
53003	NC_020536	AAT	2	6	2216336	2216341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197770
53004	NC_020536	TGC	2	6	2216386	2216391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470197770
53005	NC_020536	AAT	2	6	2216525	2216530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197770
53006	NC_020536	TGT	2	6	2216595	2216600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470197770
53007	NC_020536	AAG	2	6	2216621	2216626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470197770
53008	NC_020536	TCT	2	6	2216636	2216641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197770
53009	NC_020536	CTTT	2	8	2216676	2216683	0 %	75 %	0 %	25 %	470197770
53010	NC_020536	CAT	2	6	2216703	2216708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197770
53011	NC_020536	CAT	2	6	2216712	2216717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197770
53012	NC_020536	AGTAA	2	10	2216718	2216727	60 %	20 %	20 %	0 %	470197770
53013	NC_020536	CTA	2	6	2216778	2216783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197770
53014	NC_020536	T	6	6	2216826	2216831	0 %	100 %	0 %	0 %	470197770
53015	NC_020536	AAT	2	6	2216843	2216848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197770
53016	NC_020536	TAA	2	6	2216899	2216904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197770
53017	NC_020536	TTC	2	6	2216929	2216934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197770
53018	NC_020536	CAT	2	6	2216998	2217003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197770
53019	NC_020536	CAC	2	6	2217015	2217020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470197770
53020	NC_020536	TTA	2	6	2217056	2217061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197770
53021	NC_020536	T	6	6	2217084	2217089	0 %	100 %	0 %	0 %	470197770
53022	NC_020536	ATT	2	6	2217104	2217109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197770
53023	NC_020536	AAT	2	6	2217137	2217142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197771
53024	NC_020536	TCA	2	6	2217143	2217148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197771
53025	NC_020536	ATT	2	6	2217151	2217156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197771
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53027	NC_020536	T	7	7	2217214	2217220	0 %	100 %	0 %	0 %	470197771
53028	NC_020536	AACC	2	8	2217288	2217295	50 %	0 %	0 %	50 %	470197771
53029	NC_020536	AAT	2	6	2217382	2217387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197771
53030	NC_020536	TCA	2	6	2217446	2217451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197771
53031	NC_020536	AAT	2	6	2217592	2217597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197771
53032	NC_020536	ATA	2	6	2217604	2217609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197771
53033	NC_020536	TAA	2	6	2217667	2217672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197771
53034	NC_020536	TAA	2	6	2217687	2217692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197771
53035	NC_020536	TGTT	2	8	2217742	2217749	0 %	75 %	25 %	0 %	470197771
53036	NC_020536	ATGC	2	8	2217804	2217811	25 %	25 %	25 %	25 %	470197771
53037	NC_020536	T	6	6	2217832	2217837	0 %	100 %	0 %	0 %	470197771
53038	NC_020536	ACC	2	6	2217931	2217936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470197771
53039	NC_020536	TACT	2	8	2217945	2217952	25 %	50 %	0 %	25 %	470197771
53040	NC_020536	CAT	2	6	2217969	2217974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197771
53041	NC_020536	GGAT	2	8	2218012	2218019	25 %	25 %	50 %	0 %	470197771
53042	NC_020536	GTTAAA	2	12	2218025	2218036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470197771
53043	NC_020536	GTC	2	6	2218046	2218051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53044	NC_020536	TCA	2	6	2218094	2218099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197772
53045	NC_020536	T	6	6	2218162	2218167	0 %	100 %	0 %	0 %	470197772
53046	NC_020536	TAA	2	6	2218197	2218202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197772
53047	NC_020536	ATA	2	6	2218211	2218216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197772
53048	NC_020536	TAA	2	6	2218225	2218230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197772
53049	NC_020536	CCA	2	6	2218247	2218252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470197772
53050	NC_020536	TTC	2	6	2218276	2218281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197772
53051	NC_020536	GAAC	2	8	2218322	2218329	50 %	0 %	25 %	25 %	470197772
53052	NC_020536	TTTA	2	8	2218339	2218346	25 %	75 %	0 %	0 %	470197772
53053	NC_020536	AAC	2	6	2218408	2218413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470197772
53054	NC_020536	T	6	6	2218426	2218431	0 %	100 %	0 %	0 %	470197772
53055	NC_020536	TCC	2	6	2218579	2218584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53056	NC_020536	TTA	2	6	2218595	2218600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53057	NC_020536	ACC	2	6	2218627	2218632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53058	NC_020536	CAA	2	6	2218647	2218652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53059	NC_020536	CAA	2	6	2218686	2218691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53060	NC_020536	AT	3	6	2218739	2218744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53061	NC_020536	CAG	2	6	2218767	2218772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53062	NC_020536	CTT	2	6	2218848	2218853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53063	NC_020536	CAA	2	6	2218890	2218895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53064	NC_020536	CAA	2	6	2218923	2218928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53065	NC_020536	CAT	2	6	2218929	2218934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53066	NC_020536	TAA	2	6	2218945	2218950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53067	NC_020536	TGA	2	6	2218959	2218964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53068	NC_020536	CTT	2	6	2218965	2218970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53069	NC_020536	AAT	3	9	2218999	2219007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53070	NC_020536	ATA	2	6	2219012	2219017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53071	NC_020536	ATTT	2	8	2219067	2219074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_020536	TAAACA	2	12	2219128	2219139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53073	NC_020536	ATA	2	6	2219154	2219159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_020536	TGTT	2	8	2219171	2219178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53075	NC_020536	GTT	2	6	2219222	2219227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53076	NC_020536	GTA	2	6	2219252	2219257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53077	NC_020536	A	7	7	2219293	2219299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53078	NC_020536	ATTCAC	2	12	2219320	2219331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53079	NC_020536	ACT	2	6	2219387	2219392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197773
53080	NC_020536	AT	3	6	2219396	2219401	50 %	50 %	0 %	0 %	470197773
53081	NC_020536	TCTTCA	2	12	2219423	2219434	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470197773
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53083	NC_020536	TCT	2	6	2219486	2219491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197773
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53087	NC_020536	TAC	2	6	2219610	2219615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197773
53088	NC_020536	CAC	2	6	2219700	2219705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470197773
53089	NC_020536	TGTT	2	8	2219731	2219738	0 %	75 %	25 %	0 %	470197773
53090	NC_020536	TAA	2	6	2219775	2219780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197773
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53093	NC_020536	TGT	2	6	2219824	2219829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470197773
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53095	NC_020536	TA	3	6	2219887	2219892	50 %	50 %	0 %	0 %	470197773
53096	NC_020536	T	6	6	2219895	2219900	0 %	100 %	0 %	0 %	470197773
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53099	NC_020536	CCT	2	6	2220146	2220151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470197773
53100	NC_020536	TAA	2	6	2220218	2220223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53101	NC_020536	TAA	2	6	2220332	2220337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53102	NC_020536	TCAT	2	8	2220357	2220364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53103	NC_020536	TGA	2	6	2220511	2220516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470197774
53104	NC_020536	ATT	2	6	2220561	2220566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197774
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53106	NC_020536	GATTG	2	10	2220647	2220656	20 %	40 %	40 %	0 %	470197774
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53114	NC_020536	TTG	2	6	2220945	2220950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470197774
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53117	NC_020536	GAC	2	6	2221076	2221081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470197774
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53119	NC_020536	TGA	2	6	2221293	2221298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53484	NC_020536	TCA	2	6	2235166	2235171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197784
53485	NC_020536	GAT	2	6	2235175	2235180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470197784
53486	NC_020536	TTAT	2	8	2235181	2235188	25 %	75 %	0 %	0 %	470197784
53487	NC_020536	TTA	2	6	2235199	2235204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197784
53488	NC_020536	TAA	2	6	2235209	2235214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197784
53489	NC_020536	CAC	2	6	2235251	2235256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53490	NC_020536	TAT	2	6	2235263	2235268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53491	NC_020536	AAT	2	6	2235288	2235293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53492	NC_020536	AATAT	2	10	2235300	2235309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53493	NC_020536	TAAT	2	8	2235311	2235318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53494	NC_020536	TTA	2	6	2235319	2235324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53495	NC_020536	TAT	2	6	2235345	2235350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53496	NC_020536	AT	3	6	2235444	2235449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53497	NC_020536	ATT	2	6	2235517	2235522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53499	NC_020536	GTT	2	6	2235703	2235708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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