MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020533	CTTT	2	8	609758	609765	0 %	75 %	0 %	25 %	470194674
14502	NC_020533	ATA	3	9	609790	609798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194674
14503	NC_020533	TCA	2	6	609805	609810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194674
14504	NC_020533	TGA	2	6	609854	609859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_020533	TTG	2	6	609860	609865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_020533	TCAT	2	8	609873	609880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14507	NC_020533	GAATG	2	10	609955	609964	40 %	20 %	40 %	0 %	470194675
14508	NC_020533	AAC	2	6	609986	609991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194675
14509	NC_020533	T	6	6	610019	610024	0 %	100 %	0 %	0 %	470194675
14510	NC_020533	AT	4	8	610069	610076	50 %	50 %	0 %	0 %	470194675
14511	NC_020533	GTT	2	6	610113	610118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194675
14512	NC_020533	GAT	2	6	610233	610238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194675
14513	NC_020533	TTGG	2	8	610351	610358	0 %	50 %	50 %	0 %	470194675
14514	NC_020533	TGA	2	6	610370	610375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194675
14515	NC_020533	ATT	2	6	610377	610382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194675
14516	NC_020533	TGT	2	6	610409	610414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194675
14517	NC_020533	A	6	6	610444	610449	100 %	0 %	0 %	0 %	470194675
14518	NC_020533	TAT	2	6	610478	610483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194675
14519	NC_020533	AATT	2	8	610586	610593	50 %	50 %	0 %	0 %	470194675
14520	NC_020533	AGCAG	2	10	610664	610673	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14521	NC_020533	CATGAC	2	12	610680	610691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_020533	CATA	2	8	610712	610719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14523	NC_020533	AAC	2	6	610768	610773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_020533	TCG	2	6	610781	610786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_020533	TCA	2	6	610835	610840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_020533	GCT	2	6	610848	610853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_020533	GTAAA	2	10	610873	610882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020533	CAT	3	9	610896	610904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_020533	CAA	3	9	610932	610940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_020533	GAT	2	6	610953	610958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_020533	CAA	2	6	610999	611004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_020533	TAA	2	6	611044	611049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_020533	TTA	2	6	611093	611098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020533	TA	3	6	611108	611113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020533	ATT	2	6	611132	611137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_020533	TAT	2	6	611138	611143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020533	GAT	2	6	611162	611167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_020533	ACG	2	6	611250	611255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_020533	ATT	2	6	611279	611284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_020533	TCAA	2	8	611313	611320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14541	NC_020533	GCTG	2	8	611331	611338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14542	NC_020533	TAT	2	6	611354	611359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_020533	TA	3	6	611377	611382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020533	TGG	2	6	611429	611434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_020533	TCA	2	6	611443	611448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14546	NC_020533	TAA	2	6	611540	611545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_020533	AAT	2	6	611547	611552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_020533	A	7	7	611620	611626	100 %	0 %	0 %	0 %	470194676
14549	NC_020533	ATAG	2	8	611637	611644	50 %	25 %	25 %	0 %	470194676
14550	NC_020533	AAAAC	2	10	611654	611663	80 %	0 %	0 %	20 %	470194676
14551	NC_020533	GCA	2	6	611763	611768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194676
14552	NC_020533	ATT	2	6	611792	611797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14553	NC_020533	GTTA	2	8	611814	611821	25 %	50 %	25 %	0 %	470194676
14554	NC_020533	TAG	2	6	611830	611835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194676
14555	NC_020533	AG	3	6	611834	611839	50 %	0 %	50 %	0 %	470194676
14556	NC_020533	TCT	2	6	611902	611907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194676
14557	NC_020533	CAT	2	6	611908	611913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194676
14558	NC_020533	AAT	2	6	612003	612008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194676
14559	NC_020533	ATT	2	6	612057	612062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14560	NC_020533	TAC	2	6	612073	612078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194676
14561	NC_020533	ATT	2	6	612133	612138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14562	NC_020533	TG	3	6	612141	612146	0 %	50 %	50 %	0 %	470194676
14563	NC_020533	TCG	2	6	612157	612162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194676
14564	NC_020533	TAT	2	6	612163	612168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14565	NC_020533	TAA	2	6	612194	612199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194676
14566	NC_020533	ATA	2	6	612304	612309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194676
14567	NC_020533	CAG	2	6	612319	612324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194676
14568	NC_020533	AGC	2	6	612380	612385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194676
14569	NC_020533	TGT	2	6	612398	612403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194676
14570	NC_020533	TGGT	2	8	612419	612426	0 %	50 %	50 %	0 %	470194676
14571	NC_020533	CAA	2	6	612430	612435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194676
14572	NC_020533	TCA	2	6	612437	612442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194676
14573	NC_020533	CAT	2	6	612487	612492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194676
14574	NC_020533	GCAATT	2	12	612519	612530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194676
14575	NC_020533	ATG	2	6	612531	612536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194676
14576	NC_020533	TGA	2	6	612565	612570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194676
14577	NC_020533	TAT	2	6	612608	612613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14578	NC_020533	CAA	2	6	612616	612621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194676
14579	NC_020533	TAG	2	6	612676	612681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194676
14580	NC_020533	GT	3	6	612682	612687	0 %	50 %	50 %	0 %	470194676
14581	NC_020533	GAA	2	6	612709	612714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194676
14582	NC_020533	TTA	2	6	612769	612774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14583	NC_020533	ATT	2	6	612794	612799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14584	NC_020533	AACA	2	8	612807	612814	75 %	0 %	0 %	25 %	470194676
14585	NC_020533	TAT	2	6	612851	612856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194676
14586	NC_020533	TCAT	2	8	612870	612877	25 %	50 %	0 %	25 %	470194676
14587	NC_020533	GTT	2	6	612887	612892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194676
14588	NC_020533	GCA	2	6	612912	612917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194676
14589	NC_020533	ATTGC	2	10	612936	612945	20 %	40 %	20 %	20 %	470194676
14590	NC_020533	ATC	2	6	612957	612962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194676
14591	NC_020533	ATG	2	6	613012	613017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194676
14592	NC_020533	TGA	2	6	613058	613063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194676
14593	NC_020533	GAA	2	6	613071	613076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194676
14594	NC_020533	GAAAAA	2	12	613080	613091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470194676
14595	NC_020533	ATA	2	6	613097	613102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194676
14596	NC_020533	CTT	2	6	613122	613127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_020533	T	6	6	613150	613155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_020533	TAT	2	6	613157	613162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020533	TA	4	8	613195	613202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_020533	AATT	2	8	613277	613284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_020533	AAT	2	6	613302	613307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_020533	ATTG	2	8	613355	613362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_020533	TAA	2	6	613376	613381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020533	T	6	6	613389	613394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020533	ATG	2	6	613452	613457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_020533	TA	3	6	613530	613535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020533	GAA	2	6	613556	613561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_020533	CCAT	2	8	613573	613580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14609	NC_020533	GATA	2	8	613605	613612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_020533	AGA	2	6	613642	613647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_020533	CCA	2	6	613800	613805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194677
14612	NC_020533	TTA	2	6	613828	613833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194677
14613	NC_020533	ATA	2	6	613869	613874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194677
14614	NC_020533	ATCA	2	8	614036	614043	50 %	25 %	0 %	25 %	470194677
14615	NC_020533	ACC	2	6	614048	614053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194677
14616	NC_020533	TGC	2	6	614084	614089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194677
14617	NC_020533	CTG	2	6	614112	614117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194677
14618	NC_020533	AT	3	6	614132	614137	50 %	50 %	0 %	0 %	470194677
14619	NC_020533	T	6	6	614137	614142	0 %	100 %	0 %	0 %	470194677
14620	NC_020533	ATT	2	6	614177	614182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194677
14621	NC_020533	TTA	2	6	614202	614207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194677
14622	NC_020533	TTA	2	6	614221	614226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194677
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14624	NC_020533	TCT	2	6	614361	614366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194677
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