MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020533	TTA	2	6	547630	547635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194634
13003	NC_020533	TGG	2	6	547642	547647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194634
13004	NC_020533	GTG	2	6	547669	547674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194634
13005	NC_020533	TCA	2	6	547724	547729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194634
13006	NC_020533	AGA	2	6	547781	547786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194634
13007	NC_020533	A	6	6	547809	547814	100 %	0 %	0 %	0 %	470194634
13008	NC_020533	GGT	2	6	547932	547937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194634
13009	NC_020533	CAT	2	6	547956	547961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194634
13010	NC_020533	ATT	2	6	548011	548016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194634
13011	NC_020533	A	6	6	548050	548055	100 %	0 %	0 %	0 %	470194634
13012	NC_020533	ATT	2	6	548094	548099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194634
13013	NC_020533	AAG	2	6	548101	548106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194634
13014	NC_020533	AATT	2	8	548227	548234	50 %	50 %	0 %	0 %	470194634
13015	NC_020533	GC	3	6	548240	548245	0 %	0 %	50 %	50 %	470194634
13016	NC_020533	CTA	2	6	548254	548259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194634
13017	NC_020533	AT	3	6	548279	548284	50 %	50 %	0 %	0 %	470194634
13018	NC_020533	ATGA	2	8	548325	548332	50 %	25 %	25 %	0 %	470194634
13019	NC_020533	AATA	2	8	548388	548395	75 %	25 %	0 %	0 %	470194634
13020	NC_020533	ACA	2	6	548409	548414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194634
13021	NC_020533	ATT	2	6	548504	548509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194634
13022	NC_020533	AGA	2	6	548621	548626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194634
13023	NC_020533	CAA	2	6	548662	548667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_020533	ATT	2	6	548682	548687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_020533	AT	3	6	548706	548711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020533	GTAC	2	8	548737	548744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_020533	TAA	2	6	548775	548780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020533	A	6	6	548797	548802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020533	GAA	2	6	548869	548874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020533	TTTA	2	8	548984	548991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_020533	A	6	6	548993	548998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020533	GAA	2	6	549001	549006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020533	ATT	2	6	549018	549023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020533	AAATA	2	10	549024	549033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_020533	TTG	2	6	549081	549086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194635
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13038	NC_020533	AAG	2	6	549147	549152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194635
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13041	NC_020533	A	6	6	549201	549206	100 %	0 %	0 %	0 %	470194635
13042	NC_020533	T	6	6	549241	549246	0 %	100 %	0 %	0 %	470194635
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13046	NC_020533	TTA	2	6	549435	549440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194635
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13049	NC_020533	GCA	2	6	549752	549757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194635
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13051	NC_020533	ATG	2	6	549792	549797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194635
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13053	NC_020533	ATT	2	6	549958	549963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194636
13054	NC_020533	TGAG	2	8	550133	550140	25 %	25 %	50 %	0 %	470194636
13055	NC_020533	ATC	2	6	550176	550181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194636
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13057	NC_020533	GAT	2	6	550237	550242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194636
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13060	NC_020533	CAT	2	6	550321	550326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194636
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13062	NC_020533	ATTA	2	8	550511	550518	50 %	50 %	0 %	0 %	470194637
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13072	NC_020533	TTAC	2	8	551021	551028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13073	NC_020533	GTATA	2	10	551059	551068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_020533	TAT	2	6	551073	551078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_020533	ATT	2	6	551094	551099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_020533	AAG	2	6	551161	551166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13081	NC_020533	ATA	2	6	551266	551271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_020533	A	6	6	551305	551310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_020533	A	6	6	551345	551350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13087	NC_020533	TAT	2	6	551468	551473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13099	NC_020533	TTA	2	6	552056	552061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020533	A	6	6	552077	552082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_020533	T	6	6	552092	552097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020533	AGG	2	6	552209	552214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_020533	A	6	6	552229	552234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_020533	GTT	2	6	552244	552249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_020533	CAC	2	6	552284	552289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_020533	CAT	2	6	552324	552329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_020533	ATT	2	6	552379	552384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_020533	CATTTA	2	12	552416	552427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13109	NC_020533	A	6	6	552460	552465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_020533	CAAA	2	8	552497	552504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_020533	GCT	2	6	552574	552579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_020533	GAA	2	6	552583	552588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_020533	TAT	2	6	552600	552605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020533	GTA	2	6	552620	552625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_020533	AAT	2	6	552641	552646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020533	ATA	2	6	552701	552706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_020533	ATG	2	6	552707	552712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020533	TGAT	2	8	552745	552752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_020533	TTC	2	6	552769	552774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_020533	TGT	2	6	552775	552780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_020533	GGA	2	6	552813	552818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_020533	AGG	2	6	552839	552844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_020533	A	6	6	552859	552864	100 %	0 %	0 %	0 %	470194639
13124	NC_020533	AAG	2	6	552878	552883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194639
13125	NC_020533	GAA	2	6	552922	552927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194639
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13360	NC_020533	TA	3	6	563015	563020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_020533	ATT	2	6	563061	563066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_020533	GGA	2	6	563134	563139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_020533	ATT	2	6	563143	563148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13365	NC_020533	AAAG	2	8	563221	563228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13366	NC_020533	ATT	2	6	563246	563251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_020533	ATCA	2	8	563297	563304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13368	NC_020533	T	6	6	563323	563328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13494	NC_020533	TAC	2	6	567870	567875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194646
13495	NC_020533	GTT	2	6	567889	567894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194646
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13499	NC_020533	AGA	2	6	568082	568087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_020533	T	7	7	568106	568112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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