MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020533	CAACT	2	10	482053	482062	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11502	NC_020533	AATT	2	8	482090	482097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_020533	GTT	2	6	482105	482110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020533	TAA	2	6	482122	482127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_020533	TAAT	2	8	482134	482141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020533	A	6	6	482155	482160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_020533	A	6	6	482203	482208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_020533	ATT	2	6	482229	482234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_020533	CAT	2	6	482257	482262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_020533	GGC	2	6	482304	482309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_020533	GCTT	2	8	482347	482354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_020533	GCG	2	6	482366	482371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_020533	ACCT	2	8	482395	482402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11514	NC_020533	ATA	2	6	482444	482449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_020533	GCA	2	6	482624	482629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_020533	CGC	2	6	482671	482676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_020533	GTGA	2	8	482677	482684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020533	TTA	2	6	482712	482717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020533	GAA	2	6	482720	482725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_020533	GTAA	2	8	482733	482740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020533	CAG	2	6	482792	482797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_020533	ATT	2	6	482833	482838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_020533	GC	3	6	482848	482853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_020533	T	6	6	482862	482867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_020533	AGA	2	6	482933	482938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_020533	GGA	2	6	482983	482988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020533	TGC	2	6	483128	483133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_020533	GAA	2	6	483247	483252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_020533	GGT	2	6	483323	483328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020533	GTC	2	6	483337	483342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_020533	TCGTG	2	10	483346	483355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11532	NC_020533	CAT	2	6	483405	483410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_020533	GGA	2	6	483449	483454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_020533	ATC	2	6	483473	483478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11536	NC_020533	GTT	2	6	483565	483570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020533	AC	3	6	483669	483674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11538	NC_020533	CAC	2	6	483684	483689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_020533	CCT	2	6	483811	483816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_020533	AT	3	6	483825	483830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020533	TCT	2	6	483839	483844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_020533	GAA	2	6	483845	483850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020533	TGTT	2	8	483889	483896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020533	GGT	2	6	483959	483964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_020533	TTAAT	2	10	483987	483996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020533	AGG	2	6	484045	484050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_020533	CCA	2	6	484075	484080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11548	NC_020533	TAAG	2	8	484104	484111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020533	AAT	2	6	484180	484185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020533	TAA	2	6	484216	484221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_020533	TGG	2	6	484281	484286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_020533	TTA	2	6	484301	484306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020533	ACG	2	6	484358	484363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11555	NC_020533	GGA	2	6	484507	484512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_020533	AGAA	2	8	484515	484522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020533	TAG	2	6	484536	484541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11559	NC_020533	CAA	2	6	484570	484575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_020533	GCTT	2	8	484576	484583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_020533	GAC	2	6	484621	484626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_020533	ATC	2	6	484636	484641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_020533	TAA	2	6	484664	484669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020533	TGT	2	6	484685	484690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020533	CT	3	6	484691	484696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_020533	ACG	2	6	484713	484718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_020533	GGA	2	6	484746	484751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020533	CT	3	6	484772	484777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_020533	AGT	2	6	484867	484872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11571	NC_020533	TC	3	6	485149	485154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11572	NC_020533	TGA	2	6	485182	485187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11580	NC_020533	GATTG	2	10	485789	485798	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_020533	TAGA	2	8	485918	485925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11584	NC_020533	CGG	2	6	486222	486227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_020533	GA	3	6	486320	486325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_020533	TAGG	2	8	486438	486445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_020533	TGG	2	6	486484	486489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020533	TAC	2	6	486492	486497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11593	NC_020533	GGT	2	6	486716	486721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020533	CGT	2	6	486911	486916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11596	NC_020533	GAG	2	6	486960	486965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020533	TG	3	6	487046	487051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_020533	C	6	6	487087	487092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11601	NC_020533	AAAT	2	8	487216	487223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_020533	TACT	2	8	487247	487254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11603	NC_020533	AGG	2	6	487305	487310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020533	A	6	6	487404	487409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020533	T	8	8	487446	487453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_020533	AAAG	2	8	487485	487492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020533	TAG	2	6	487553	487558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11609	NC_020533	A	6	6	487680	487685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_020533	T	7	7	487722	487728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020533	TAG	2	6	487829	487834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020533	AAGC	2	8	487872	487879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11613	NC_020533	AATG	2	8	487962	487969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020533	TAA	2	6	488003	488008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_020533	ATT	2	6	488021	488026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020533	TAT	2	6	488067	488072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_020533	CAG	2	6	488083	488088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11619	NC_020533	CTG	2	6	488119	488124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11621	NC_020533	AAG	2	6	488228	488233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_020533	TA	3	6	488240	488245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_020533	TAAA	2	8	488283	488290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_020533	TAAA	2	8	488320	488327	75 %	25 %	0 %	0 %	470194596
11625	NC_020533	AAG	3	9	488344	488352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194596
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11631	NC_020533	A	6	6	488583	488588	100 %	0 %	0 %	0 %	470194596
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