MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020533	A	6	6	420598	420603	100 %	0 %	0 %	0 %	470194549
10003	NC_020533	AAT	2	6	420671	420676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194549
10004	NC_020533	AAG	2	6	420715	420720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020533	CTT	2	6	420751	420756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_020533	GAT	2	6	420768	420773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020533	CTAT	2	8	420841	420848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_020533	TTTA	2	8	420875	420882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020533	TAA	2	6	420911	420916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020533	ATT	2	6	420927	420932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020533	TAA	2	6	420971	420976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_020533	TAA	2	6	421012	421017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_020533	GCA	2	6	421048	421053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194550
10014	NC_020533	TGT	2	6	421356	421361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194550
10015	NC_020533	AAG	2	6	421364	421369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194550
10016	NC_020533	TGG	2	6	421401	421406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194550
10017	NC_020533	TTA	2	6	421431	421436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194550
10018	NC_020533	TA	3	6	421441	421446	50 %	50 %	0 %	0 %	470194550
10019	NC_020533	AG	3	6	421469	421474	50 %	0 %	50 %	0 %	470194550
10020	NC_020533	TACG	2	8	421494	421501	25 %	25 %	25 %	25 %	470194550
10021	NC_020533	AGA	2	6	421524	421529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194550
10022	NC_020533	GGC	2	6	421639	421644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194550
10023	NC_020533	TAT	2	6	421645	421650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194550
10024	NC_020533	TAA	2	6	421662	421667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194550
10025	NC_020533	A	6	6	421666	421671	100 %	0 %	0 %	0 %	470194550
10026	NC_020533	ACAA	2	8	421674	421681	75 %	0 %	0 %	25 %	470194550
10027	NC_020533	A	6	6	421718	421723	100 %	0 %	0 %	0 %	470194550
10028	NC_020533	ATA	2	6	421759	421764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020533	GAG	2	6	421784	421789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020533	CTT	2	6	421812	421817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_020533	T	6	6	421816	421821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020533	AAT	2	6	421855	421860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020533	A	6	6	421976	421981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020533	A	6	6	421997	422002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020533	TAAT	2	8	422003	422010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020533	TAAC	2	8	422027	422034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_020533	TA	3	6	422092	422097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020533	TAG	2	6	422102	422107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_020533	AT	3	6	422145	422150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020533	TTA	2	6	422231	422236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194551
10041	NC_020533	ACT	2	6	422237	422242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194551
10042	NC_020533	AAAAG	2	10	422278	422287	80 %	0 %	20 %	0 %	470194551
10043	NC_020533	AG	4	8	422290	422297	50 %	0 %	50 %	0 %	470194551
10044	NC_020533	ACA	2	6	422299	422304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194551
10045	NC_020533	TAC	2	6	422333	422338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194551
10046	NC_020533	TCA	2	6	422339	422344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194551
10047	NC_020533	ATT	2	6	422437	422442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194551
10048	NC_020533	TTA	2	6	422444	422449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194551
10049	NC_020533	AGATAA	2	12	422455	422466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470194551
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10051	NC_020533	AATT	2	8	422511	422518	50 %	50 %	0 %	0 %	470194551
10052	NC_020533	TGG	2	6	422545	422550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194551
10053	NC_020533	TCT	2	6	422573	422578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194551
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10055	NC_020533	TAA	2	6	422602	422607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194551
10056	NC_020533	TAAT	2	8	422649	422656	50 %	50 %	0 %	0 %	470194551
10057	NC_020533	AGA	2	6	422659	422664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194551
10058	NC_020533	TA	3	6	422724	422729	50 %	50 %	0 %	0 %	470194551
10059	NC_020533	CAAT	2	8	422891	422898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_020533	TAA	2	6	422909	422914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020533	AGC	2	6	422921	422926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_020533	AATA	2	8	422944	422951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020533	TCC	2	6	422958	422963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_020533	ATTA	2	8	423077	423084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020533	TTC	2	6	423086	423091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_020533	TTTAAT	2	12	423103	423114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020533	GTCT	2	8	423134	423141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_020533	TAA	2	6	423154	423159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020533	TAT	2	6	423165	423170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020533	TAA	2	6	423181	423186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020533	AT	3	6	423197	423202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020533	ATATGA	2	12	423215	423226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470194552
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10080	NC_020533	A	6	6	423509	423514	100 %	0 %	0 %	0 %	470194552
10081	NC_020533	TAG	2	6	423548	423553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194552
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10088	NC_020533	A	6	6	423754	423759	100 %	0 %	0 %	0 %	470194552
10089	NC_020533	TTA	2	6	423800	423805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194552
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10092	NC_020533	AAG	2	6	423947	423952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020533	TAA	2	6	423958	423963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020533	TAA	3	9	423994	424002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020533	TTA	2	6	424026	424031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020533	GCT	2	6	424033	424038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_020533	T	6	6	424038	424043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020533	A	7	7	424105	424111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020533	TAA	2	6	424169	424174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020533	TTTA	2	8	424184	424191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020533	TAA	2	6	424229	424234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020533	AT	3	6	424272	424277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_020533	AAAT	2	8	424290	424297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020533	CATTAG	2	12	424326	424337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194553
10105	NC_020533	GT	3	6	424353	424358	0 %	50 %	50 %	0 %	470194553
10106	NC_020533	CAG	2	6	424362	424367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194553
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10109	NC_020533	CAA	2	6	424467	424472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194553
10110	NC_020533	AAAT	2	8	424570	424577	75 %	25 %	0 %	0 %	470194553
10111	NC_020533	A	6	6	424584	424589	100 %	0 %	0 %	0 %	470194553
10112	NC_020533	AT	3	6	424643	424648	50 %	50 %	0 %	0 %	470194553
10113	NC_020533	GTAA	2	8	424697	424704	50 %	25 %	25 %	0 %	470194553
10114	NC_020533	A	6	6	424721	424726	100 %	0 %	0 %	0 %	470194553
10115	NC_020533	GTT	2	6	424759	424764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194553
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10119	NC_020533	ATA	2	6	425011	425016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_020533	AAG	2	6	425021	425026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020533	TA	3	6	425065	425070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020533	TGT	2	6	425094	425099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_020533	GTT	2	6	425103	425108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020533	CAT	2	6	425138	425143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_020533	GTA	2	6	425149	425154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10127	NC_020533	AAT	2	6	425184	425189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10498	NC_020533	TGA	3	9	440264	440272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194568
10499	NC_020533	A	7	7	440279	440285	100 %	0 %	0 %	0 %	470194568
10500	NC_020533	GAA	2	6	440292	440297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194568

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