MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_020533	TGA	2	6	2698646	2698651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196162
64502	NC_020533	TAAT	2	8	2698652	2698659	50 %	50 %	0 %	0 %	470196162
64503	NC_020533	TCA	2	6	2698694	2698699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196162
64504	NC_020533	ATA	2	6	2698861	2698866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196162
64505	NC_020533	CCA	2	6	2698885	2698890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196162
64506	NC_020533	CCT	2	6	2698935	2698940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470196163
64507	NC_020533	AAATAT	2	12	2698977	2698988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196163
64508	NC_020533	AAAT	2	8	2699049	2699056	75 %	25 %	0 %	0 %	470196163
64509	NC_020533	ACAA	2	8	2699076	2699083	75 %	0 %	0 %	25 %	470196163
64510	NC_020533	AAT	2	6	2699105	2699110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196163
64511	NC_020533	CTTG	2	8	2699148	2699155	0 %	50 %	25 %	25 %	470196163
64512	NC_020533	AAT	2	6	2699203	2699208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196163
64513	NC_020533	A	6	6	2699265	2699270	100 %	0 %	0 %	0 %	470196163
64514	NC_020533	TTA	2	6	2699358	2699363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196163
64515	NC_020533	ATAAA	2	10	2699371	2699380	80 %	20 %	0 %	0 %	470196163
64516	NC_020533	TCA	2	6	2699419	2699424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196163
64517	NC_020533	CTGC	2	8	2699436	2699443	0 %	25 %	25 %	50 %	470196163
64518	NC_020533	ATAA	2	8	2699461	2699468	75 %	25 %	0 %	0 %	470196163
64519	NC_020533	TTG	2	6	2699479	2699484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196163
64520	NC_020533	AT	3	6	2699505	2699510	50 %	50 %	0 %	0 %	470196163
64521	NC_020533	CTA	2	6	2699524	2699529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196163
64522	NC_020533	AAT	2	6	2699538	2699543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196163
64523	NC_020533	GAT	2	6	2699570	2699575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196163
64524	NC_020533	AAC	2	6	2699577	2699582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196163
64525	NC_020533	TA	3	6	2699606	2699611	50 %	50 %	0 %	0 %	470196163
64526	NC_020533	T	6	6	2699617	2699622	0 %	100 %	0 %	0 %	470196163
64527	NC_020533	CAT	2	6	2699627	2699632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196163
64528	NC_020533	TAA	2	6	2699638	2699643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196163
64529	NC_020533	TAA	2	6	2699711	2699716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196163
64530	NC_020533	TGA	2	6	2699763	2699768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196163
64531	NC_020533	TTGT	2	8	2699866	2699873	0 %	75 %	25 %	0 %	470196163
64532	NC_020533	A	6	6	2700005	2700010	100 %	0 %	0 %	0 %	470196163
64533	NC_020533	AT	3	6	2700067	2700072	50 %	50 %	0 %	0 %	470196163
64534	NC_020533	AAAT	2	8	2700073	2700080	75 %	25 %	0 %	0 %	470196163
64535	NC_020533	TA	4	8	2700109	2700116	50 %	50 %	0 %	0 %	470196163
64536	NC_020533	TTG	2	6	2700131	2700136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196163
64537	NC_020533	TCA	2	6	2700195	2700200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64538	NC_020533	ATT	2	6	2700204	2700209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64539	NC_020533	ATC	2	6	2700293	2700298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196164
64540	NC_020533	TCTT	2	8	2700312	2700319	0 %	75 %	0 %	25 %	470196164
64541	NC_020533	TTTC	2	8	2700320	2700327	0 %	75 %	0 %	25 %	470196164
64542	NC_020533	TAAACC	2	12	2700335	2700346	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470196164
64543	NC_020533	TAA	2	6	2700350	2700355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196164
64544	NC_020533	T	6	6	2700415	2700420	0 %	100 %	0 %	0 %	470196164
64545	NC_020533	GTT	2	6	2700498	2700503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196164
64546	NC_020533	ATG	2	6	2700542	2700547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196164
64547	NC_020533	TTG	2	6	2700595	2700600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196164
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64550	NC_020533	TTG	2	6	2700781	2700786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196164
64551	NC_020533	TGAACC	2	12	2700827	2700838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470196164
64552	NC_020533	TTG	2	6	2700865	2700870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196164
64553	NC_020533	TTG	2	6	2700883	2700888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196164
64554	NC_020533	TGTCGA	2	12	2700902	2700913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196164
64555	NC_020533	GATTCT	2	12	2700972	2700983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196164
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64599	NC_020533	ATG	2	6	2703346	2703351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196164
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64602	NC_020533	CGTTGA	2	12	2703572	2703583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196164
64603	NC_020533	TCAC	2	8	2703627	2703634	25 %	25 %	0 %	50 %	470196164
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64605	NC_020533	GTAC	2	8	2703849	2703856	25 %	25 %	25 %	25 %	470196164
64606	NC_020533	TTG	2	6	2703883	2703888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196164
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64610	NC_020533	ACT	2	6	2703998	2704003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196164
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64978	NC_020533	TTC	2	6	2720061	2720066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196176
64979	NC_020533	TGC	2	6	2720184	2720189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196176
64980	NC_020533	TGC	2	6	2720193	2720198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196176
64981	NC_020533	ATA	3	9	2720226	2720234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196176
64982	NC_020533	TCT	2	6	2720305	2720310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196176
64983	NC_020533	TTA	2	6	2720332	2720337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196176
64984	NC_020533	AAT	2	6	2720345	2720350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196176
64985	NC_020533	ATC	2	6	2720373	2720378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196176
64986	NC_020533	ATC	2	6	2720460	2720465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196176
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64989	NC_020533	TTG	2	6	2720564	2720569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196176
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64991	NC_020533	T	6	6	2720618	2720623	0 %	100 %	0 %	0 %	470196176
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65000	NC_020533	CAT	2	6	2720885	2720890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196176

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