MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020533	ATC	2	6	2216227	2216232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53002	NC_020533	CTT	2	6	2216241	2216246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53003	NC_020533	TTGT	2	8	2216259	2216266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53004	NC_020533	GCAAT	2	10	2216282	2216291	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53005	NC_020533	CTT	2	6	2216298	2216303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53006	NC_020533	CAAT	2	8	2216304	2216311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53007	NC_020533	GCT	2	6	2216342	2216347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53008	NC_020533	CAA	2	6	2216391	2216396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53009	NC_020533	TAA	2	6	2216407	2216412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53010	NC_020533	CTT	2	6	2216418	2216423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53011	NC_020533	TTTA	2	8	2216497	2216504	25 %	75 %	0 %	0 %	470195805
53012	NC_020533	TCA	2	6	2216507	2216512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195805
53013	NC_020533	AGC	2	6	2216548	2216553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470195805
53014	NC_020533	AAT	2	6	2216666	2216671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195805
53015	NC_020533	TGC	2	6	2216716	2216721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470195805
53016	NC_020533	AAT	2	6	2216855	2216860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195805
53017	NC_020533	TGT	2	6	2216925	2216930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470195805
53018	NC_020533	AAG	2	6	2216951	2216956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470195805
53019	NC_020533	TCT	2	6	2216966	2216971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195805
53020	NC_020533	CTTT	2	8	2217006	2217013	0 %	75 %	0 %	25 %	470195805
53021	NC_020533	CAT	2	6	2217033	2217038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195805
53022	NC_020533	CAT	2	6	2217042	2217047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195805
53023	NC_020533	AGTAA	2	10	2217048	2217057	60 %	20 %	20 %	0 %	470195805
53024	NC_020533	CTA	2	6	2217108	2217113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195805
53025	NC_020533	T	6	6	2217156	2217161	0 %	100 %	0 %	0 %	470195805
53026	NC_020533	AAT	2	6	2217173	2217178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195805
53027	NC_020533	TAA	2	6	2217229	2217234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195805
53028	NC_020533	TTC	2	6	2217259	2217264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195805
53029	NC_020533	CAT	2	6	2217328	2217333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195805
53030	NC_020533	CAC	2	6	2217345	2217350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470195805
53031	NC_020533	TTA	2	6	2217386	2217391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195805
53032	NC_020533	T	6	6	2217414	2217419	0 %	100 %	0 %	0 %	470195805
53033	NC_020533	ATT	2	6	2217434	2217439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195805
53034	NC_020533	AAT	2	6	2217467	2217472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195806
53035	NC_020533	TCA	2	6	2217473	2217478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195806
53036	NC_020533	ATT	2	6	2217481	2217486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195806
53037	NC_020533	CTT	2	6	2217510	2217515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195806
53038	NC_020533	T	7	7	2217544	2217550	0 %	100 %	0 %	0 %	470195806
53039	NC_020533	AACC	2	8	2217618	2217625	50 %	0 %	0 %	50 %	470195806
53040	NC_020533	AAT	2	6	2217712	2217717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195806
53041	NC_020533	TCA	2	6	2217776	2217781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195806
53042	NC_020533	AAT	2	6	2217922	2217927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195806
53043	NC_020533	ATA	2	6	2217934	2217939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195806
53044	NC_020533	TAA	2	6	2217997	2218002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195806
53045	NC_020533	TAA	2	6	2218017	2218022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195806
53046	NC_020533	TGTT	2	8	2218072	2218079	0 %	75 %	25 %	0 %	470195806
53047	NC_020533	ATGC	2	8	2218134	2218141	25 %	25 %	25 %	25 %	470195806
53048	NC_020533	T	6	6	2218162	2218167	0 %	100 %	0 %	0 %	470195806
53049	NC_020533	ACC	2	6	2218261	2218266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470195806
53050	NC_020533	TACT	2	8	2218275	2218282	25 %	50 %	0 %	25 %	470195806
53051	NC_020533	CAT	2	6	2218299	2218304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195806
53052	NC_020533	GGAT	2	8	2218342	2218349	25 %	25 %	50 %	0 %	470195806
53053	NC_020533	GTTAAA	2	12	2218355	2218366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470195806
53054	NC_020533	GTC	2	6	2218376	2218381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53055	NC_020533	TCA	2	6	2218424	2218429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195807
53056	NC_020533	T	6	6	2218492	2218497	0 %	100 %	0 %	0 %	470195807
53057	NC_020533	TAA	2	6	2218527	2218532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195807
53058	NC_020533	ATA	2	6	2218541	2218546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195807
53059	NC_020533	TAA	2	6	2218555	2218560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195807
53060	NC_020533	CCA	2	6	2218577	2218582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470195807
53061	NC_020533	TTC	2	6	2218606	2218611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195807
53062	NC_020533	GAAC	2	8	2218652	2218659	50 %	0 %	25 %	25 %	470195807
53063	NC_020533	TTTA	2	8	2218669	2218676	25 %	75 %	0 %	0 %	470195807
53064	NC_020533	AAC	2	6	2218738	2218743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470195807
53065	NC_020533	T	6	6	2218756	2218761	0 %	100 %	0 %	0 %	470195807
53066	NC_020533	TCC	2	6	2218909	2218914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53067	NC_020533	TTA	2	6	2218925	2218930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53068	NC_020533	ACC	2	6	2218957	2218962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53069	NC_020533	CAA	2	6	2218977	2218982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53070	NC_020533	CAA	2	6	2219016	2219021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53071	NC_020533	AT	3	6	2219069	2219074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_020533	CAG	2	6	2219097	2219102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53073	NC_020533	CTT	2	6	2219178	2219183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53074	NC_020533	CAA	2	6	2219220	2219225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53075	NC_020533	CAA	2	6	2219253	2219258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53076	NC_020533	CAT	2	6	2219259	2219264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53077	NC_020533	TAA	2	6	2219275	2219280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53078	NC_020533	TGA	2	6	2219289	2219294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53079	NC_020533	CTT	2	6	2219295	2219300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53080	NC_020533	AAT	3	9	2219329	2219337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53081	NC_020533	ATA	2	6	2219342	2219347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53082	NC_020533	ATTT	2	8	2219397	2219404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53083	NC_020533	TAAACA	2	12	2219458	2219469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53084	NC_020533	ATA	2	6	2219484	2219489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53085	NC_020533	TGTT	2	8	2219501	2219508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53086	NC_020533	GTT	2	6	2219552	2219557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53087	NC_020533	GTA	2	6	2219582	2219587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53088	NC_020533	A	7	7	2219623	2219629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53089	NC_020533	ATTCAC	2	12	2219650	2219661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53090	NC_020533	ACT	2	6	2219717	2219722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195808
53091	NC_020533	AT	3	6	2219726	2219731	50 %	50 %	0 %	0 %	470195808
53092	NC_020533	TCTTCA	2	12	2219753	2219764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470195808
53093	NC_020533	ATG	2	6	2219805	2219810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470195808
53094	NC_020533	TCT	2	6	2219816	2219821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195808
53095	NC_020533	TTG	2	6	2219881	2219886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470195808
53096	NC_020533	TCA	2	6	2219913	2219918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195808
53097	NC_020533	TTTA	2	8	2219926	2219933	25 %	75 %	0 %	0 %	470195808
53098	NC_020533	TAC	2	6	2219940	2219945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195808
53099	NC_020533	CAC	2	6	2220030	2220035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470195808
53100	NC_020533	TGTT	2	8	2220061	2220068	0 %	75 %	25 %	0 %	470195808
53101	NC_020533	TAA	2	6	2220105	2220110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195808
53102	NC_020533	ATG	2	6	2220121	2220126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470195808
53103	NC_020533	CTT	2	6	2220132	2220137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195808
53104	NC_020533	TGT	2	6	2220154	2220159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470195808
53105	NC_020533	ATG	2	6	2220198	2220203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470195808
53106	NC_020533	TA	3	6	2220217	2220222	50 %	50 %	0 %	0 %	470195808
53107	NC_020533	T	6	6	2220225	2220230	0 %	100 %	0 %	0 %	470195808
53108	NC_020533	CAC	2	6	2220300	2220305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470195808
53109	NC_020533	CGA	2	6	2220387	2220392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470195808
53110	NC_020533	CCT	2	6	2220476	2220481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470195808
53111	NC_020533	TAA	2	6	2220548	2220553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_020533	TAA	2	6	2220662	2220667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53113	NC_020533	TCAT	2	8	2220687	2220694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53114	NC_020533	TGA	2	6	2220841	2220846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470195809
53115	NC_020533	ATT	2	6	2220891	2220896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195809
53116	NC_020533	AGA	2	6	2220898	2220903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470195809
53117	NC_020533	GATTG	2	10	2220977	2220986	20 %	40 %	40 %	0 %	470195809
53118	NC_020533	CAA	2	6	2221004	2221009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470195809
53119	NC_020533	TCA	2	6	2221020	2221025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195809
53120	NC_020533	TGA	2	6	2221072	2221077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470195809
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53123	NC_020533	CAT	2	6	2221234	2221239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470195809
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53139	NC_020533	CATT	2	8	2221964	2221971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53140	NC_020533	ATT	2	6	2222006	2222011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53230	NC_020533	TTAT	2	8	2225388	2225395	25 %	75 %	0 %	0 %	470195812
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53485	NC_020533	AT	3	6	2235270	2235275	50 %	50 %	0 %	0 %	470195819
53486	NC_020533	TTGAT	2	10	2235293	2235302	20 %	60 %	20 %	0 %	470195819
53487	NC_020533	TTA	2	6	2235345	2235350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195819
53488	NC_020533	TTC	2	6	2235356	2235361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470195819
53489	NC_020533	ATA	4	12	2235376	2235387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195819
53490	NC_020533	TAA	2	6	2235396	2235401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195819
53491	NC_020533	ATT	2	6	2235427	2235432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195819
53492	NC_020533	A	6	6	2235440	2235445	100 %	0 %	0 %	0 %	470195819
53493	NC_020533	ATTT	2	8	2235468	2235475	25 %	75 %	0 %	0 %	470195819
53494	NC_020533	T	7	7	2235481	2235487	0 %	100 %	0 %	0 %	470195819
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53497	NC_020533	TTAT	2	8	2235509	2235516	25 %	75 %	0 %	0 %	470195819
53498	NC_020533	TTA	2	6	2235527	2235532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470195819
53499	NC_020533	TAA	2	6	2235537	2235542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470195819
53500	NC_020533	CAC	2	6	2235579	2235584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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