MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020530	AAAT	2	8	18649	18656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020530	AT	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020530	CAAA	2	8	18671	18678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_020530	T	6	6	18703	18708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020530	ATA	2	6	18873	18878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020530	TACA	2	8	18965	18972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_020530	T	6	6	19000	19005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020530	A	6	6	19008	19013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020530	A	6	6	19019	19024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020530	TCA	2	6	19033	19038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_020530	ATA	2	6	19051	19056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455765
512	NC_020530	CTT	2	6	19104	19109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455765
513	NC_020530	TCA	2	6	19127	19132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455765
514	NC_020530	ATTA	2	8	19138	19145	50 %	50 %	0 %	0 %	472455765
515	NC_020530	CCA	2	6	19202	19207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455765
516	NC_020530	T	7	7	19265	19271	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
517	NC_020530	A	6	6	19286	19291	100 %	0 %	0 %	0 %	472455765
518	NC_020530	ACA	2	6	19385	19390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455765
519	NC_020530	TTC	2	6	19435	19440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455765
520	NC_020530	TA	3	6	19447	19452	50 %	50 %	0 %	0 %	472455765
521	NC_020530	T	7	7	19459	19465	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
522	NC_020530	TTA	2	6	19529	19534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455765
523	NC_020530	CAA	2	6	19563	19568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455765
524	NC_020530	TTAG	2	8	19613	19620	25 %	50 %	25 %	0 %	472455765
525	NC_020530	T	6	6	19661	19666	0 %	100 %	0 %	0 %	472455765
526	NC_020530	CAAC	2	8	19684	19691	50 %	0 %	0 %	50 %	472455765
527	NC_020530	CTT	2	6	19716	19721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455765
528	NC_020530	TCGG	2	8	19832	19839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_020530	T	6	6	19883	19888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020530	CAA	2	6	19964	19969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020530	A	6	6	19968	19973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020530	ATT	2	6	19991	19996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455766
533	NC_020530	CTA	2	6	20043	20048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455766
534	NC_020530	AT	3	6	20075	20080	50 %	50 %	0 %	0 %	472455766
535	NC_020530	GA	3	6	20091	20096	50 %	0 %	50 %	0 %	472455766
536	NC_020530	CAA	2	6	20120	20125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455766
537	NC_020530	GAA	2	6	20172	20177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455766
538	NC_020530	A	8	8	20176	20183	100 %	0 %	0 %	0 %	472455766
539	NC_020530	AAGC	2	8	20185	20192	50 %	0 %	25 %	25 %	472455766
540	NC_020530	TTA	2	6	20193	20198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455766
541	NC_020530	ATT	2	6	20246	20251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455766
542	NC_020530	TTA	2	6	20333	20338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455766
543	NC_020530	TTA	2	6	20345	20350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455766
544	NC_020530	AAT	2	6	20473	20478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455766
545	NC_020530	ATC	2	6	20492	20497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455766
546	NC_020530	TA	3	6	20582	20587	50 %	50 %	0 %	0 %	472455766
547	NC_020530	TTC	2	6	20603	20608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455766
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549	NC_020530	GCTA	2	8	20649	20656	25 %	25 %	25 %	25 %	472455766
550	NC_020530	TAT	2	6	20669	20674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020530	T	6	6	20699	20704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020530	TAT	2	6	20757	20762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020530	GAA	3	9	20811	20819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020530	A	7	7	20824	20830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020530	ACC	2	6	20853	20858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_020530	GTGG	2	8	20882	20889	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020530	ATTT	2	8	20902	20909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020530	ATTT	2	8	20917	20924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020530	GTT	2	6	20925	20930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_020530	A	6	6	20951	20956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020530	T	7	7	20984	20990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020530	TTA	2	6	20997	21002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020530	A	6	6	21154	21159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020530	A	6	6	21167	21172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020530	TAAAAT	2	12	21173	21184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_020530	T	7	7	21363	21369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020530	A	8	8	21428	21435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020530	TA	3	6	21436	21441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020530	A	7	7	21462	21468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020530	ATG	2	6	21478	21483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_020530	T	7	7	21591	21597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_020530	T	6	6	21760	21765	0 %	100 %	0 %	0 %	472455767
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592	NC_020530	AAAT	2	8	21999	22006	75 %	25 %	0 %	0 %	472455767
593	NC_020530	AAT	2	6	22028	22033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455767
594	NC_020530	ATT	2	6	22060	22065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455767
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600	NC_020530	ATA	2	6	22244	22249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455767
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602	NC_020530	TAA	3	9	22278	22286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_020530	GAA	2	6	22326	22331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455768
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610	NC_020530	AT	3	6	22491	22496	50 %	50 %	0 %	0 %	472455768
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616	NC_020530	CTT	2	6	22715	22720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455768
617	NC_020530	TGG	2	6	22728	22733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472455768
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619	NC_020530	AAGA	2	8	22800	22807	75 %	0 %	25 %	0 %	472455768
620	NC_020530	AAG	2	6	22884	22889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455768
621	NC_020530	T	7	7	22979	22985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020530	T	6	6	22987	22992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020530	AGT	2	6	23006	23011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020530	TGA	2	6	23033	23038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020530	TAA	2	6	23060	23065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020530	GA	3	6	23077	23082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020530	AT	3	6	23117	23122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020530	TATT	2	8	23197	23204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020530	T	6	6	23211	23216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020530	TGA	2	6	23238	23243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_020530	A	6	6	23280	23285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020530	TA	3	6	23292	23297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020530	GAC	2	6	23304	23309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020530	TAA	2	6	23349	23354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020530	TC	3	6	23367	23372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_020530	AG	3	6	23392	23397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020530	TCA	2	6	23444	23449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_020530	TTG	2	6	23459	23464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020530	A	6	6	23524	23529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020530	TAG	2	6	23606	23611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020530	ATT	2	6	23658	23663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020530	TCT	2	6	23734	23739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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775	NC_020530	TACC	2	8	30325	30332	25 %	25 %	0 %	50 %	472455775
776	NC_020530	CAG	2	6	30358	30363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455775
777	NC_020530	T	7	7	30385	30391	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
778	NC_020530	TGC	2	6	30470	30475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472455775
779	NC_020530	TTAC	2	8	30504	30511	25 %	50 %	0 %	25 %	472455775
780	NC_020530	T	6	6	30545	30550	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
781	NC_020530	T	7	7	30647	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	472455775
782	NC_020530	TCT	2	6	30829	30834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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