MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_020529	TTC	2	6	2299230	2299235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55002	NC_020529	TATT	2	8	2299264	2299271	25 %	75 %	0 %	0 %	470191937
55003	NC_020529	TC	3	6	2299392	2299397	0 %	50 %	0 %	50 %	470191937
55004	NC_020529	T	6	6	2299398	2299403	0 %	100 %	0 %	0 %	470191937
55005	NC_020529	AAT	2	6	2299582	2299587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191937
55006	NC_020529	GAC	2	6	2299594	2299599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191937
55007	NC_020529	AATA	2	8	2299600	2299607	75 %	25 %	0 %	0 %	470191937
55008	NC_020529	ATT	2	6	2299677	2299682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191937
55009	NC_020529	AT	3	6	2299684	2299689	50 %	50 %	0 %	0 %	470191937
55010	NC_020529	TTA	2	6	2299711	2299716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191937
55011	NC_020529	TGA	2	6	2299771	2299776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191937
55012	NC_020529	GAA	2	6	2299799	2299804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191937
55013	NC_020529	TTTC	2	8	2299823	2299830	0 %	75 %	0 %	25 %	470191937
55014	NC_020529	TAA	2	6	2299836	2299841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191937
55015	NC_020529	CTAT	2	8	2299843	2299850	25 %	50 %	0 %	25 %	470191937
55016	NC_020529	ATGAA	2	10	2299923	2299932	60 %	20 %	20 %	0 %	470191937
55017	NC_020529	TG	3	6	2299970	2299975	0 %	50 %	50 %	0 %	470191937
55018	NC_020529	CT	3	6	2300016	2300021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55019	NC_020529	GAT	2	6	2300043	2300048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191938
55020	NC_020529	AATG	2	8	2300084	2300091	50 %	25 %	25 %	0 %	470191938
55021	NC_020529	TTTC	2	8	2300102	2300109	0 %	75 %	0 %	25 %	470191938
55022	NC_020529	TGT	2	6	2300135	2300140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191938
55023	NC_020529	ATA	2	6	2300144	2300149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55024	NC_020529	TTATCT	2	12	2300183	2300194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470191938
55025	NC_020529	TTG	2	6	2300233	2300238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191938
55026	NC_020529	CAAA	2	8	2300296	2300303	75 %	0 %	0 %	25 %	470191938
55027	NC_020529	ATC	2	6	2300339	2300344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55028	NC_020529	ATAA	2	8	2300356	2300363	75 %	25 %	0 %	0 %	470191938
55029	NC_020529	ATTT	2	8	2300425	2300432	25 %	75 %	0 %	0 %	470191938
55030	NC_020529	ATA	2	6	2300465	2300470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55031	NC_020529	TTA	2	6	2300513	2300518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191938
55032	NC_020529	T	6	6	2300535	2300540	0 %	100 %	0 %	0 %	470191938
55033	NC_020529	ATT	2	6	2300551	2300556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191938
55034	NC_020529	GAT	2	6	2300649	2300654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191938
55035	NC_020529	GAT	2	6	2300697	2300702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191938
55036	NC_020529	AT	3	6	2300701	2300706	50 %	50 %	0 %	0 %	470191938
55037	NC_020529	TA	3	6	2300722	2300727	50 %	50 %	0 %	0 %	470191938
55038	NC_020529	AGT	2	6	2300761	2300766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191938
55039	NC_020529	TTAA	2	8	2300777	2300784	50 %	50 %	0 %	0 %	470191938
55040	NC_020529	CTA	2	6	2300835	2300840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55041	NC_020529	TAC	2	6	2300905	2300910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55042	NC_020529	TAA	2	6	2300941	2300946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55043	NC_020529	TAA	2	6	2301050	2301055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55044	NC_020529	TCCA	2	8	2301056	2301063	25 %	25 %	0 %	50 %	470191938
55045	NC_020529	GAA	2	6	2301158	2301163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191938
55046	NC_020529	TAT	2	6	2301174	2301179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191938
55047	NC_020529	AAT	2	6	2301182	2301187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55048	NC_020529	TAAT	2	8	2301261	2301268	50 %	50 %	0 %	0 %	470191938
55049	NC_020529	AAT	2	6	2301315	2301320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55050	NC_020529	ACT	2	6	2301334	2301339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55051	NC_020529	TTC	2	6	2301346	2301351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191938
55052	NC_020529	CTT	2	6	2301358	2301363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191938
55053	NC_020529	TTTG	2	8	2301463	2301470	0 %	75 %	25 %	0 %	470191938
55054	NC_020529	TGG	2	6	2301515	2301520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191938
55055	NC_020529	TTGT	2	8	2301521	2301528	0 %	75 %	25 %	0 %	470191938
55056	NC_020529	AAT	2	6	2301531	2301536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55057	NC_020529	CTT	2	6	2301543	2301548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191938
55058	NC_020529	CTA	2	6	2301552	2301557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55059	NC_020529	GAC	2	6	2301561	2301566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191938
55060	NC_020529	GTAT	2	8	2301574	2301581	25 %	50 %	25 %	0 %	470191938
55061	NC_020529	AC	3	6	2301599	2301604	50 %	0 %	0 %	50 %	470191938
55062	NC_020529	TAAT	2	8	2301608	2301615	50 %	50 %	0 %	0 %	470191938
55063	NC_020529	TGT	2	6	2301641	2301646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191938
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55066	NC_020529	CAA	2	6	2301774	2301779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191938
55067	NC_020529	ATC	2	6	2301793	2301798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55068	NC_020529	ATA	2	6	2301830	2301835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55069	NC_020529	CAT	2	6	2301843	2301848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55070	NC_020529	CAT	2	6	2301858	2301863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55071	NC_020529	TTG	2	6	2301865	2301870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191938
55072	NC_020529	GATT	2	8	2301873	2301880	25 %	50 %	25 %	0 %	470191938
55073	NC_020529	AT	3	6	2301907	2301912	50 %	50 %	0 %	0 %	470191938
55074	NC_020529	CTTC	2	8	2301927	2301934	0 %	50 %	0 %	50 %	470191938
55075	NC_020529	ACT	2	6	2301937	2301942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191938
55076	NC_020529	AAT	2	6	2301972	2301977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191938
55077	NC_020529	AT	3	6	2302009	2302014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55078	NC_020529	T	6	6	2302089	2302094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55079	NC_020529	ATA	2	6	2302127	2302132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55080	NC_020529	TTA	2	6	2302136	2302141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55081	NC_020529	T	7	7	2302147	2302153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55082	NC_020529	AT	4	8	2302183	2302190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55083	NC_020529	TCGT	2	8	2302233	2302240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55084	NC_020529	TAT	2	6	2302277	2302282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55085	NC_020529	A	6	6	2302438	2302443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55086	NC_020529	CA	3	6	2302463	2302468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55087	NC_020529	TCTT	2	8	2302491	2302498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55088	NC_020529	GA	3	6	2302512	2302517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55089	NC_020529	AGG	2	6	2302580	2302585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55090	NC_020529	GAA	2	6	2302599	2302604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191939
55091	NC_020529	CTA	2	6	2302616	2302621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55092	NC_020529	CAT	2	6	2302718	2302723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55093	NC_020529	CTA	2	6	2302815	2302820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55094	NC_020529	TAC	3	9	2302828	2302836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55095	NC_020529	ACA	2	6	2302853	2302858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191939
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55099	NC_020529	ACT	2	6	2302904	2302909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55100	NC_020529	ATA	2	6	2302913	2302918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191939
55101	NC_020529	ATCA	2	8	2302919	2302926	50 %	25 %	0 %	25 %	470191939
55102	NC_020529	ACA	2	6	2302952	2302957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191939
55103	NC_020529	TGG	2	6	2302974	2302979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191939
55104	NC_020529	CAA	2	6	2303007	2303012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191939
55105	NC_020529	CAT	2	6	2303039	2303044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55106	NC_020529	TAC	2	6	2303113	2303118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191939
55107	NC_020529	GGT	2	6	2303134	2303139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191939
55108	NC_020529	AAC	2	6	2303241	2303246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191939
55109	NC_020529	GCT	2	6	2303374	2303379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191939
55110	NC_020529	TTCA	2	8	2303389	2303396	25 %	50 %	0 %	25 %	470191939
55111	NC_020529	CAA	2	6	2303424	2303429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55112	NC_020529	TTG	2	6	2303443	2303448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55113	NC_020529	T	6	6	2303451	2303456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55114	NC_020529	A	7	7	2303467	2303473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55115	NC_020529	TAA	2	6	2303527	2303532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55116	NC_020529	ACA	2	6	2303540	2303545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55117	NC_020529	AC	3	6	2303557	2303562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55118	NC_020529	AATT	2	8	2303646	2303653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55242	NC_020529	TCG	2	6	2308661	2308666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191943
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