MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_020529	CCT	2	6	2277683	2277688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54502	NC_020529	AAT	2	6	2277784	2277789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191916
54503	NC_020529	AT	4	8	2277806	2277813	50 %	50 %	0 %	0 %	470191916
54504	NC_020529	TTG	2	6	2277886	2277891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191916
54505	NC_020529	TCT	2	6	2277906	2277911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191916
54506	NC_020529	A	6	6	2278019	2278024	100 %	0 %	0 %	0 %	470191916
54507	NC_020529	TTC	3	9	2278028	2278036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191916
54508	NC_020529	TCA	2	6	2278095	2278100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191916
54509	NC_020529	AAC	2	6	2278106	2278111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191916
54510	NC_020529	TAA	3	9	2278153	2278161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191916
54511	NC_020529	TTG	2	6	2278177	2278182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191916
54512	NC_020529	CTA	2	6	2278203	2278208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191916
54513	NC_020529	ACC	2	6	2278268	2278273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191916
54514	NC_020529	ATT	2	6	2278281	2278286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191916
54515	NC_020529	TGAA	2	8	2278347	2278354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54516	NC_020529	TAT	2	6	2278402	2278407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54517	NC_020529	TTG	2	6	2278445	2278450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54518	NC_020529	AT	3	6	2278498	2278503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54519	NC_020529	AAGTA	2	10	2278518	2278527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54520	NC_020529	TC	3	6	2278534	2278539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54521	NC_020529	TCC	2	6	2278544	2278549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54522	NC_020529	CTT	2	6	2278557	2278562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54523	NC_020529	T	6	6	2278615	2278620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54524	NC_020529	GAA	2	6	2278694	2278699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_020529	ATTT	2	8	2278783	2278790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54526	NC_020529	ACT	2	6	2278901	2278906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54527	NC_020529	TCAT	2	8	2278983	2278990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54528	NC_020529	TAA	2	6	2279039	2279044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191917
54529	NC_020529	AACA	2	8	2279095	2279102	75 %	0 %	0 %	25 %	470191917
54530	NC_020529	TTG	2	6	2279111	2279116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191917
54531	NC_020529	CTT	2	6	2279131	2279136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191917
54532	NC_020529	AAT	2	6	2279225	2279230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191917
54533	NC_020529	ATG	2	6	2279375	2279380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191917
54534	NC_020529	TAG	2	6	2279386	2279391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191917
54535	NC_020529	AAGA	2	8	2279415	2279422	75 %	0 %	25 %	0 %	470191917
54536	NC_020529	TCA	2	6	2279434	2279439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191917
54537	NC_020529	TGT	2	6	2279441	2279446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54538	NC_020529	AAG	2	6	2279488	2279493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191918
54539	NC_020529	CAG	2	6	2279502	2279507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191918
54540	NC_020529	AATAT	2	10	2279522	2279531	60 %	40 %	0 %	0 %	470191918
54541	NC_020529	CCT	2	6	2279564	2279569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470191918
54542	NC_020529	TAC	2	6	2279638	2279643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191918
54543	NC_020529	ATT	2	6	2279735	2279740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191918
54544	NC_020529	CA	3	6	2279763	2279768	50 %	0 %	0 %	50 %	470191918
54545	NC_020529	CAAA	2	8	2279838	2279845	75 %	0 %	0 %	25 %	470191918
54546	NC_020529	GTT	2	6	2279870	2279875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191918
54547	NC_020529	TTA	2	6	2279900	2279905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191918
54548	NC_020529	TAA	2	6	2279982	2279987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191918
54549	NC_020529	CTT	2	6	2280009	2280014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191918
54550	NC_020529	ATC	2	6	2280040	2280045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191918
54551	NC_020529	TCT	2	6	2280134	2280139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191918
54552	NC_020529	CAT	2	6	2280144	2280149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191918
54553	NC_020529	TAA	2	6	2280157	2280162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191918
54554	NC_020529	TAA	2	6	2280201	2280206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191918
54555	NC_020529	T	7	7	2280271	2280277	0 %	100 %	0 %	0 %	470191918
54556	NC_020529	AAC	2	6	2280280	2280285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191918
54557	NC_020529	TTC	2	6	2280301	2280306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191918
54558	NC_020529	AT	3	6	2280318	2280323	50 %	50 %	0 %	0 %	470191918
54559	NC_020529	T	6	6	2280329	2280334	0 %	100 %	0 %	0 %	470191918
54560	NC_020529	TCT	2	6	2280362	2280367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191918
54561	NC_020529	AAC	2	6	2280391	2280396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191918
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54563	NC_020529	ATCA	2	8	2280493	2280500	50 %	25 %	0 %	25 %	470191918
54564	NC_020529	CAT	2	6	2280564	2280569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191918
54565	NC_020529	TCT	2	6	2280614	2280619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191918
54566	NC_020529	T	6	6	2280639	2280644	0 %	100 %	0 %	0 %	470191918
54567	NC_020529	CTG	2	6	2280676	2280681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191918
54568	NC_020529	CTT	2	6	2280702	2280707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191918
54569	NC_020529	T	6	6	2280726	2280731	0 %	100 %	0 %	0 %	470191918
54570	NC_020529	CTA	2	6	2280732	2280737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191918
54571	NC_020529	ATC	2	6	2280747	2280752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54572	NC_020529	T	6	6	2280766	2280771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54573	NC_020529	AGG	2	6	2280792	2280797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54574	NC_020529	CAA	2	6	2280828	2280833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191919
54575	NC_020529	ACAA	2	8	2280862	2280869	75 %	0 %	0 %	25 %	470191919
54576	NC_020529	CTG	2	6	2280883	2280888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191919
54577	NC_020529	TGAA	2	8	2280910	2280917	50 %	25 %	25 %	0 %	470191919
54578	NC_020529	TAA	2	6	2280938	2280943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191919
54579	NC_020529	TAT	2	6	2280989	2280994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191919
54580	NC_020529	CAA	2	6	2281012	2281017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191919
54581	NC_020529	CCAT	2	8	2281031	2281038	25 %	25 %	0 %	50 %	470191919
54582	NC_020529	AAC	2	6	2281112	2281117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191919
54583	NC_020529	ATT	2	6	2281224	2281229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191919
54584	NC_020529	ACCT	2	8	2281236	2281243	25 %	25 %	0 %	50 %	470191919
54585	NC_020529	ATT	2	6	2281299	2281304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191920
54586	NC_020529	GAT	2	6	2281323	2281328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191920
54587	NC_020529	TAT	2	6	2281404	2281409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191920
54588	NC_020529	AAT	2	6	2281436	2281441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191920
54589	NC_020529	CCA	2	6	2281565	2281570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191920
54590	NC_020529	ATG	2	6	2281577	2281582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191920
54591	NC_020529	TCT	3	9	2281592	2281600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191920
54592	NC_020529	CTT	2	6	2281606	2281611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191920
54593	NC_020529	CGT	2	6	2281618	2281623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191920
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54595	NC_020529	ACC	2	6	2281711	2281716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191920
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54598	NC_020529	T	7	7	2281832	2281838	0 %	100 %	0 %	0 %	470191921
54599	NC_020529	TG	3	6	2281862	2281867	0 %	50 %	50 %	0 %	470191921
54600	NC_020529	CAA	2	6	2281920	2281925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191921
54601	NC_020529	TGT	2	6	2281985	2281990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
54602	NC_020529	GT	3	6	2282014	2282019	0 %	50 %	50 %	0 %	470191921
54603	NC_020529	CA	3	6	2282055	2282060	50 %	0 %	0 %	50 %	470191921
54604	NC_020529	GTT	2	6	2282073	2282078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
54605	NC_020529	AAT	2	6	2282160	2282165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
54606	NC_020529	GTT	2	6	2282211	2282216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
54607	NC_020529	TTG	2	6	2282253	2282258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
54608	NC_020529	ACA	2	6	2282390	2282395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191921
54609	NC_020529	CCA	2	6	2282396	2282401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191921
54610	NC_020529	AAT	2	6	2282476	2282481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
54611	NC_020529	AACGTC	2	12	2282482	2282493	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470191921
54612	NC_020529	A	6	6	2282510	2282515	100 %	0 %	0 %	0 %	470191921
54613	NC_020529	TAA	2	6	2282516	2282521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
54614	NC_020529	CAT	2	6	2282602	2282607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191921
54615	NC_020529	TCT	2	6	2282618	2282623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191921
54616	NC_020529	CAA	2	6	2282676	2282681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191921
54617	NC_020529	AAT	2	6	2282749	2282754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
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54619	NC_020529	TAAA	2	8	2282805	2282812	75 %	25 %	0 %	0 %	470191921
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