MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_020529	GTT	2	6	2235717	2235722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53502	NC_020529	TAA	2	6	2235779	2235784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53503	NC_020529	ATG	2	6	2235846	2235851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53504	NC_020529	CTT	2	6	2235899	2235904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53505	NC_020529	T	6	6	2235951	2235956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53506	NC_020529	TTG	2	6	2236039	2236044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53507	NC_020529	TTTGT	2	10	2236055	2236064	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53508	NC_020529	TTTATA	2	12	2236105	2236116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53509	NC_020529	TTC	2	6	2236120	2236125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53510	NC_020529	T	6	6	2236136	2236141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53511	NC_020529	T	7	7	2236168	2236174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53512	NC_020529	CTC	2	6	2236190	2236195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53513	NC_020529	ATGG	2	8	2236216	2236223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53514	NC_020529	ATTA	2	8	2236228	2236235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53515	NC_020529	T	6	6	2236360	2236365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53516	NC_020529	TAC	2	6	2236392	2236397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53517	NC_020529	ATG	2	6	2236404	2236409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53518	NC_020529	ATC	2	6	2236446	2236451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53519	NC_020529	TCT	2	6	2236505	2236510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53520	NC_020529	GAA	2	6	2236534	2236539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53521	NC_020529	TCA	2	6	2236580	2236585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53522	NC_020529	TAA	2	6	2236591	2236596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53523	NC_020529	ATG	2	6	2236672	2236677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53524	NC_020529	TAA	2	6	2236683	2236688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53525	NC_020529	AGTA	2	8	2236689	2236696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53526	NC_020529	TTG	2	6	2236789	2236794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191889
53527	NC_020529	TCAA	2	8	2236873	2236880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53528	NC_020529	ATTTTG	2	12	2236894	2236905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53529	NC_020529	TTAAT	2	10	2236913	2236922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53530	NC_020529	ATGA	2	8	2236933	2236940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53531	NC_020529	CAT	2	6	2236966	2236971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53532	NC_020529	ATC	2	6	2236983	2236988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53533	NC_020529	ATT	2	6	2237042	2237047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53534	NC_020529	CAT	2	6	2237048	2237053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53535	NC_020529	TATC	2	8	2237078	2237085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53536	NC_020529	ATC	2	6	2237100	2237105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53537	NC_020529	AAT	2	6	2237144	2237149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53538	NC_020529	TAATT	2	10	2237161	2237170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53539	NC_020529	TG	3	6	2237176	2237181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53540	NC_020529	GTT	2	6	2237222	2237227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53541	NC_020529	ATTG	2	8	2237285	2237292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53542	NC_020529	ACATTC	2	12	2237362	2237373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53543	NC_020529	CTTTTT	2	12	2237391	2237402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53544	NC_020529	AAT	2	6	2237410	2237415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53545	NC_020529	AGT	2	6	2237445	2237450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53546	NC_020529	ATA	2	6	2237499	2237504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53547	NC_020529	TAAA	2	8	2237557	2237564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53548	NC_020529	TAAA	2	8	2237566	2237573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53549	NC_020529	AGT	2	6	2237628	2237633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53550	NC_020529	CTT	2	6	2237689	2237694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53551	NC_020529	TGA	2	6	2237712	2237717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53552	NC_020529	ACA	2	6	2237793	2237798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53553	NC_020529	TAG	2	6	2237883	2237888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53554	NC_020529	TAT	2	6	2237892	2237897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53555	NC_020529	GAT	2	6	2237922	2237927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53556	NC_020529	ATA	2	6	2237931	2237936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53557	NC_020529	AAT	2	6	2237943	2237948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53558	NC_020529	CTT	2	6	2237964	2237969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53559	NC_020529	ATT	2	6	2237990	2237995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53560	NC_020529	TTC	2	6	2238005	2238010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53561	NC_020529	ATC	2	6	2238012	2238017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53562	NC_020529	TAA	2	6	2238103	2238108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53563	NC_020529	TTG	2	6	2238145	2238150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53564	NC_020529	ATT	2	6	2238217	2238222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53565	NC_020529	A	7	7	2238267	2238273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53566	NC_020529	GATA	2	8	2238291	2238298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53567	NC_020529	TAAA	2	8	2238314	2238321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53568	NC_020529	AGA	2	6	2238336	2238341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53570	NC_020529	CATAC	2	10	2238410	2238419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53571	NC_020529	TAG	2	6	2238421	2238426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53572	NC_020529	TAT	2	6	2238544	2238549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53573	NC_020529	CAA	2	6	2238562	2238567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53574	NC_020529	AAG	2	6	2238572	2238577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53575	NC_020529	GAC	2	6	2238608	2238613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53576	NC_020529	ATC	2	6	2238641	2238646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53577	NC_020529	AGG	2	6	2238691	2238696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53578	NC_020529	TA	3	6	2238738	2238743	50 %	50 %	0 %	0 %	470191890
53579	NC_020529	A	6	6	2238852	2238857	100 %	0 %	0 %	0 %	470191890
53580	NC_020529	AGA	2	6	2238893	2238898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191890
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53583	NC_020529	TAAGT	2	10	2238968	2238977	40 %	40 %	20 %	0 %	470191890
53584	NC_020529	AAT	2	6	2239020	2239025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191890
53585	NC_020529	TGAC	2	8	2239096	2239103	25 %	25 %	25 %	25 %	470191890
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53588	NC_020529	AATT	2	8	2239235	2239242	50 %	50 %	0 %	0 %	470191890
53589	NC_020529	AAT	2	6	2239290	2239295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191890
53590	NC_020529	CAT	2	6	2239303	2239308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191890
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53592	NC_020529	TCCT	2	8	2239384	2239391	0 %	50 %	0 %	50 %	470191890
53593	NC_020529	ATT	2	6	2239470	2239475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191890
53594	NC_020529	ATTAA	2	10	2239542	2239551	60 %	40 %	0 %	0 %	470191890
53595	NC_020529	ATT	2	6	2239554	2239559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191890
53596	NC_020529	AT	3	6	2239562	2239567	50 %	50 %	0 %	0 %	470191890
53597	NC_020529	TGA	2	6	2239601	2239606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191890
53598	NC_020529	A	7	7	2239623	2239629	100 %	0 %	0 %	0 %	470191890
53599	NC_020529	TTA	2	6	2239630	2239635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191890
53600	NC_020529	A	6	6	2239672	2239677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53601	NC_020529	AAT	2	6	2239754	2239759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53602	NC_020529	AC	3	6	2239766	2239771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53603	NC_020529	A	7	7	2239778	2239784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53604	NC_020529	ATA	2	6	2239794	2239799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53605	NC_020529	TA	3	6	2239813	2239818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53606	NC_020529	ACG	2	6	2239854	2239859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53607	NC_020529	GCT	2	6	2239861	2239866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53608	NC_020529	T	6	6	2239878	2239883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53609	NC_020529	AGTA	2	8	2239908	2239915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53610	NC_020529	TAA	2	6	2239959	2239964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53611	NC_020529	AGCTTG	2	12	2239989	2240000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53612	NC_020529	ACC	3	9	2240010	2240018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53613	NC_020529	CAT	2	6	2240036	2240041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53614	NC_020529	TGGT	2	8	2240070	2240077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53615	NC_020529	TTA	2	6	2240128	2240133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53616	NC_020529	ACG	2	6	2240187	2240192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53617	NC_020529	TCC	2	6	2240230	2240235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53618	NC_020529	GTT	2	6	2240268	2240273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53619	NC_020529	CCA	2	6	2240297	2240302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53620	NC_020529	T	6	6	2240314	2240319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53621	NC_020529	TTC	2	6	2240394	2240399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53622	NC_020529	CAG	2	6	2240409	2240414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53623	NC_020529	TGAT	2	8	2240415	2240422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53624	NC_020529	ACC	2	6	2240428	2240433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53625	NC_020529	GAT	2	6	2240436	2240441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53626	NC_020529	GTA	2	6	2240452	2240457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53627	NC_020529	TAA	2	6	2240505	2240510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53628	NC_020529	GTGTG	2	10	2240536	2240545	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53629	NC_020529	AGAT	2	8	2240571	2240578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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