MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020529	CTT	2	6	2216102	2216107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53002	NC_020529	TTTA	2	8	2216181	2216188	25 %	75 %	0 %	0 %	470191874
53003	NC_020529	TCA	2	6	2216191	2216196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191874
53004	NC_020529	AGC	2	6	2216232	2216237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191874
53005	NC_020529	AAT	2	6	2216350	2216355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191874
53006	NC_020529	TGC	2	6	2216400	2216405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191874
53007	NC_020529	AAT	2	6	2216539	2216544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191874
53008	NC_020529	TGT	2	6	2216609	2216614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191874
53009	NC_020529	AAG	2	6	2216635	2216640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191874
53010	NC_020529	TCT	2	6	2216650	2216655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191874
53011	NC_020529	CTTT	2	8	2216690	2216697	0 %	75 %	0 %	25 %	470191874
53012	NC_020529	CAT	2	6	2216717	2216722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191874
53013	NC_020529	CAT	2	6	2216726	2216731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191874
53014	NC_020529	AGTAA	2	10	2216732	2216741	60 %	20 %	20 %	0 %	470191874
53015	NC_020529	CTA	2	6	2216792	2216797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191874
53016	NC_020529	T	6	6	2216840	2216845	0 %	100 %	0 %	0 %	470191874
53017	NC_020529	AAT	2	6	2216857	2216862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191874
53018	NC_020529	TAA	2	6	2216913	2216918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191874
53019	NC_020529	TTC	2	6	2216943	2216948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191874
53020	NC_020529	CAT	2	6	2217012	2217017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191874
53021	NC_020529	CAC	2	6	2217029	2217034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191874
53022	NC_020529	TTA	2	6	2217070	2217075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191874
53023	NC_020529	T	6	6	2217098	2217103	0 %	100 %	0 %	0 %	470191874
53024	NC_020529	ATT	2	6	2217118	2217123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191874
53025	NC_020529	AAT	2	6	2217151	2217156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191875
53026	NC_020529	TCA	2	6	2217157	2217162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191875
53027	NC_020529	ATT	2	6	2217165	2217170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191875
53028	NC_020529	CTT	2	6	2217194	2217199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191875
53029	NC_020529	T	7	7	2217228	2217234	0 %	100 %	0 %	0 %	470191875
53030	NC_020529	AACC	2	8	2217302	2217309	50 %	0 %	0 %	50 %	470191875
53031	NC_020529	AAT	2	6	2217396	2217401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191875
53032	NC_020529	TCA	2	6	2217460	2217465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191875
53033	NC_020529	AAT	2	6	2217606	2217611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191875
53034	NC_020529	ATA	2	6	2217618	2217623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191875
53035	NC_020529	TAA	2	6	2217681	2217686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191875
53036	NC_020529	TAA	2	6	2217701	2217706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191875
53037	NC_020529	TGTT	2	8	2217756	2217763	0 %	75 %	25 %	0 %	470191875
53038	NC_020529	ATGC	2	8	2217818	2217825	25 %	25 %	25 %	25 %	470191875
53039	NC_020529	T	6	6	2217846	2217851	0 %	100 %	0 %	0 %	470191875
53040	NC_020529	ACC	2	6	2217945	2217950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191875
53041	NC_020529	TACT	2	8	2217959	2217966	25 %	50 %	0 %	25 %	470191875
53042	NC_020529	CAT	2	6	2217983	2217988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191875
53043	NC_020529	GGAT	2	8	2218026	2218033	25 %	25 %	50 %	0 %	470191875
53044	NC_020529	GTTAAA	2	12	2218039	2218050	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470191875
53045	NC_020529	GTC	2	6	2218060	2218065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53046	NC_020529	TCA	2	6	2218108	2218113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191876
53047	NC_020529	T	6	6	2218176	2218181	0 %	100 %	0 %	0 %	470191876
53048	NC_020529	TAA	2	6	2218211	2218216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191876
53049	NC_020529	ATA	2	6	2218225	2218230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191876
53050	NC_020529	TAA	2	6	2218239	2218244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191876
53051	NC_020529	CCA	2	6	2218261	2218266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191876
53052	NC_020529	TTC	2	6	2218290	2218295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191876
53053	NC_020529	GAAC	2	8	2218336	2218343	50 %	0 %	25 %	25 %	470191876
53054	NC_020529	TTTA	2	8	2218353	2218360	25 %	75 %	0 %	0 %	470191876
53055	NC_020529	AAC	2	6	2218422	2218427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191876
53056	NC_020529	T	6	6	2218440	2218445	0 %	100 %	0 %	0 %	470191876
53057	NC_020529	TCC	2	6	2218593	2218598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53058	NC_020529	TTA	2	6	2218609	2218614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53059	NC_020529	ACC	2	6	2218641	2218646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53060	NC_020529	CAA	2	6	2218661	2218666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53061	NC_020529	CAA	2	6	2218700	2218705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53062	NC_020529	AT	3	6	2218753	2218758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53063	NC_020529	CAG	2	6	2218781	2218786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53064	NC_020529	CTT	2	6	2218862	2218867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53065	NC_020529	CAA	2	6	2218904	2218909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53066	NC_020529	CAA	2	6	2218937	2218942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53067	NC_020529	CAT	2	6	2218943	2218948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53068	NC_020529	TAA	2	6	2218959	2218964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53069	NC_020529	TGA	2	6	2218973	2218978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53070	NC_020529	CTT	2	6	2218979	2218984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53071	NC_020529	AAT	3	9	2219013	2219021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_020529	ATA	2	6	2219026	2219031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53073	NC_020529	ATTT	2	8	2219081	2219088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_020529	TAAACA	2	12	2219142	2219153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53075	NC_020529	ATA	2	6	2219168	2219173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53076	NC_020529	TGTT	2	8	2219185	2219192	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53077	NC_020529	GTT	2	6	2219236	2219241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53078	NC_020529	GTA	2	6	2219266	2219271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53079	NC_020529	A	7	7	2219307	2219313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53080	NC_020529	ATTCAC	2	12	2219334	2219345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53081	NC_020529	ACT	2	6	2219401	2219406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191877
53082	NC_020529	AT	3	6	2219410	2219415	50 %	50 %	0 %	0 %	470191877
53083	NC_020529	TCTTCA	2	12	2219437	2219448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470191877
53084	NC_020529	ATG	2	6	2219489	2219494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191877
53085	NC_020529	TCT	2	6	2219500	2219505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191877
53086	NC_020529	TTG	2	6	2219565	2219570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191877
53087	NC_020529	TCA	2	6	2219597	2219602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191877
53088	NC_020529	TTTA	2	8	2219610	2219617	25 %	75 %	0 %	0 %	470191877
53089	NC_020529	TAC	2	6	2219624	2219629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191877
53090	NC_020529	CAC	2	6	2219714	2219719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191877
53091	NC_020529	TGTT	2	8	2219745	2219752	0 %	75 %	25 %	0 %	470191877
53092	NC_020529	TAA	2	6	2219789	2219794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191877
53093	NC_020529	ATG	2	6	2219805	2219810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191877
53094	NC_020529	CTT	2	6	2219816	2219821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191877
53095	NC_020529	TGT	2	6	2219838	2219843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191877
53096	NC_020529	ATG	2	6	2219882	2219887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191877
53097	NC_020529	TA	3	6	2219901	2219906	50 %	50 %	0 %	0 %	470191877
53098	NC_020529	T	6	6	2219909	2219914	0 %	100 %	0 %	0 %	470191877
53099	NC_020529	CAC	2	6	2219984	2219989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191877
53100	NC_020529	CGA	2	6	2220071	2220076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191877
53101	NC_020529	CCT	2	6	2220160	2220165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470191877
53102	NC_020529	TAA	2	6	2220232	2220237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53103	NC_020529	TAA	2	6	2220346	2220351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53104	NC_020529	TCAT	2	8	2220371	2220378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53105	NC_020529	TGA	2	6	2220525	2220530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191878
53106	NC_020529	ATT	2	6	2220575	2220580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191878
53107	NC_020529	AGA	2	6	2220582	2220587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191878
53108	NC_020529	GATTG	2	10	2220661	2220670	20 %	40 %	40 %	0 %	470191878
53109	NC_020529	CAA	2	6	2220688	2220693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191878
53110	NC_020529	TCA	2	6	2220704	2220709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191878
53111	NC_020529	TGA	2	6	2220756	2220761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191878
53112	NC_020529	TGG	2	6	2220861	2220866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191878
53113	NC_020529	TAT	2	6	2220887	2220892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191878
53114	NC_020529	CAT	2	6	2220918	2220923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191878
53115	NC_020529	TAAA	2	8	2220932	2220939	75 %	25 %	0 %	0 %	470191878
53116	NC_020529	TTG	2	6	2220959	2220964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191878
53117	NC_020529	TCA	2	6	2220973	2220978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191878
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53119	NC_020529	GAC	2	6	2221090	2221095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191878
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53484	NC_020529	ATTT	2	8	2235154	2235161	25 %	75 %	0 %	0 %	470191888
53485	NC_020529	T	7	7	2235167	2235173	0 %	100 %	0 %	0 %	470191888
53486	NC_020529	TCA	2	6	2235180	2235185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191888
53487	NC_020529	GAT	2	6	2235189	2235194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191888
53488	NC_020529	TTAT	2	8	2235195	2235202	25 %	75 %	0 %	0 %	470191888
53489	NC_020529	TTA	2	6	2235213	2235218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191888
53490	NC_020529	TAA	2	6	2235223	2235228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191888
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53492	NC_020529	TAT	2	6	2235277	2235282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53493	NC_020529	AAT	2	6	2235302	2235307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53494	NC_020529	AATAT	2	10	2235314	2235323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53495	NC_020529	TAAT	2	8	2235325	2235332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53496	NC_020529	TTA	2	6	2235333	2235338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53497	NC_020529	TAT	2	6	2235359	2235364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53498	NC_020529	AT	3	6	2235458	2235463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53499	NC_020529	ATT	2	6	2235531	2235536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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