MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_020307	TTA	2	6	877931	877936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120428
18503	NC_020307	TTTTC	2	10	877946	877955	0 %	80 %	0 %	20 %	452120428
18504	NC_020307	T	6	6	878072	878077	0 %	100 %	0 %	0 %	452120428
18505	NC_020307	T	6	6	878110	878115	0 %	100 %	0 %	0 %	452120428
18506	NC_020307	CTT	2	6	878132	878137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120428
18507	NC_020307	CTT	2	6	878156	878161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120428
18508	NC_020307	GCT	2	6	878167	878172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120428
18509	NC_020307	ATT	2	6	878229	878234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120428
18510	NC_020307	CTC	2	6	878262	878267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120428
18511	NC_020307	CTT	2	6	878336	878341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120428
18512	NC_020307	CTC	2	6	878361	878366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120428
18513	NC_020307	ACCA	2	8	878385	878392	50 %	0 %	0 %	50 %	452120428
18514	NC_020307	TCG	2	6	878459	878464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120428
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18517	NC_020307	TA	3	6	878634	878639	50 %	50 %	0 %	0 %	452120428
18518	NC_020307	CGC	2	6	878645	878650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120428
18519	NC_020307	TCC	2	6	878776	878781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120428
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18521	NC_020307	GTC	2	6	878917	878922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120428
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18523	NC_020307	ATG	2	6	878969	878974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120428
18524	NC_020307	TTGC	2	8	879022	879029	0 %	50 %	25 %	25 %	452120428
18525	NC_020307	GCG	2	6	879064	879069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120428
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18533	NC_020307	CG	3	6	879404	879409	0 %	0 %	50 %	50 %	452120429
18534	NC_020307	C	6	6	879430	879435	0 %	0 %	0 %	100 %	452120429
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18539	NC_020307	CAA	2	6	879608	879613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120429
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18543	NC_020307	T	6	6	879680	879685	0 %	100 %	0 %	0 %	452120429
18544	NC_020307	C	6	6	879723	879728	0 %	0 %	0 %	100 %	452120430
18545	NC_020307	T	6	6	879783	879788	0 %	100 %	0 %	0 %	452120430
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18554	NC_020307	GTT	2	6	880332	880337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120431
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18560	NC_020307	TC	3	6	880452	880457	0 %	50 %	0 %	50 %	452120431
18561	NC_020307	CT	3	6	880472	880477	0 %	50 %	0 %	50 %	452120431
18562	NC_020307	T	6	6	880525	880530	0 %	100 %	0 %	0 %	452120431
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18565	NC_020307	CTAA	2	8	880642	880649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18566	NC_020307	TAC	2	6	880716	880721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18568	NC_020307	GGCT	2	8	880758	880765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18569	NC_020307	TGG	2	6	880781	880786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18589	NC_020307	ATA	2	6	881443	881448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120433
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18602	NC_020307	AAT	2	6	882114	882119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120433
18603	NC_020307	T	6	6	882119	882124	0 %	100 %	0 %	0 %	452120433
18604	NC_020307	TTCA	2	8	882183	882190	25 %	50 %	0 %	25 %	452120433
18605	NC_020307	A	6	6	882223	882228	100 %	0 %	0 %	0 %	452120433
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18608	NC_020307	A	7	7	882296	882302	100 %	0 %	0 %	0 %	452120434
18609	NC_020307	TTTTG	2	10	882381	882390	0 %	80 %	20 %	0 %	452120434
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18622	NC_020307	ACGA	2	8	883009	883016	50 %	0 %	25 %	25 %	452120434
18623	NC_020307	GCA	2	6	883040	883045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120434
18624	NC_020307	TCG	2	6	883083	883088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120434
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18638	NC_020307	T	6	6	883791	883796	0 %	100 %	0 %	0 %	452120435
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18646	NC_020307	CTT	2	6	884225	884230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18651	NC_020307	CGC	2	6	884386	884391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18652	NC_020307	TTA	2	6	884393	884398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18653	NC_020307	TA	3	6	884426	884431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18654	NC_020307	GAA	2	6	884433	884438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18655	NC_020307	TCT	2	6	884472	884477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18690	NC_020307	CT	3	6	886054	886059	0 %	50 %	0 %	50 %	452120436
18691	NC_020307	CAG	3	9	886218	886226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120436
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18739	NC_020307	ACC	2	6	888802	888807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120438
18740	NC_020307	A	6	6	888829	888834	100 %	0 %	0 %	0 %	452120438
18741	NC_020307	TCGCT	2	10	888860	888869	0 %	40 %	20 %	40 %	452120438
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18987	NC_020307	TC	3	6	901027	901032	0 %	50 %	0 %	50 %	452120450
18988	NC_020307	CGT	2	6	901040	901045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120450
18989	NC_020307	TAT	2	6	901082	901087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120450
18990	NC_020307	T	6	6	901104	901109	0 %	100 %	0 %	0 %	452120450
18991	NC_020307	GCA	2	6	901136	901141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120450
18992	NC_020307	TCG	2	6	901149	901154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120450
18993	NC_020307	CCG	2	6	901192	901197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120450
18994	NC_020307	GGAT	2	8	901212	901219	25 %	25 %	50 %	0 %	452120450
18995	NC_020307	CTG	2	6	901224	901229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120450
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18999	NC_020307	AGT	2	6	901461	901466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120450
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