MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18006	NC_020307	AG	3	6	854823	854828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18009	NC_020307	GTA	2	6	854925	854930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120399
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18013	NC_020307	GT	4	8	855189	855196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18021	NC_020307	GC	3	6	855566	855571	0 %	0 %	50 %	50 %	452120400
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18122	NC_020307	ATC	2	6	859964	859969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120403
18123	NC_020307	GATC	2	8	860092	860099	25 %	25 %	25 %	25 %	452120404
18124	NC_020307	T	7	7	860123	860129	0 %	100 %	0 %	0 %	452120404
18125	NC_020307	GTA	2	6	860139	860144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120404
18126	NC_020307	TCA	2	6	860254	860259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120404
18127	NC_020307	CCG	2	6	860326	860331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120404
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18131	NC_020307	GC	3	6	860388	860393	0 %	0 %	50 %	50 %	452120404
18132	NC_020307	TCA	2	6	860406	860411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120404
18133	NC_020307	TTTC	2	8	860449	860456	0 %	75 %	0 %	25 %	452120404
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18135	NC_020307	TCA	2	6	860598	860603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120404
18136	NC_020307	AAAT	2	8	860662	860669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18137	NC_020307	AAC	2	6	860731	860736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18138	NC_020307	T	6	6	860739	860744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18139	NC_020307	CGG	2	6	860816	860821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18140	NC_020307	AAC	2	6	860840	860845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18141	NC_020307	TTA	2	6	860894	860899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120405
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18144	NC_020307	TTTG	2	8	861037	861044	0 %	75 %	25 %	0 %	452120405
18145	NC_020307	CTG	2	6	861056	861061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120405
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18151	NC_020307	GC	3	6	861273	861278	0 %	0 %	50 %	50 %	452120405
18152	NC_020307	TTTC	2	8	861289	861296	0 %	75 %	0 %	25 %	452120405
18153	NC_020307	AAACC	2	10	861330	861339	60 %	0 %	0 %	40 %	452120405
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18165	NC_020307	CGG	2	6	861741	861746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120405
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18184	NC_020307	TGG	2	6	862514	862519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18212	NC_020307	CATA	2	8	863970	863977	50 %	25 %	0 %	25 %	452120407
18213	NC_020307	AT	3	6	864037	864042	50 %	50 %	0 %	0 %	452120407
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18229	NC_020307	CCA	2	6	864740	864745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120408
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18231	NC_020307	TCAT	2	8	864814	864821	25 %	50 %	0 %	25 %	452120408
18232	NC_020307	AGC	2	6	864882	864887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120409
18233	NC_020307	CAT	3	9	864920	864928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120409
18234	NC_020307	CAG	2	6	864938	864943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120409
18235	NC_020307	ATAA	2	8	864983	864990	75 %	25 %	0 %	0 %	452120409
18236	NC_020307	AATCC	2	10	864993	865002	40 %	20 %	0 %	40 %	452120409
18237	NC_020307	TCTT	2	8	865069	865076	0 %	75 %	0 %	25 %	452120409
18238	NC_020307	AAT	2	6	865117	865122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120409
18239	NC_020307	TTC	2	6	865133	865138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120409
18240	NC_020307	T	7	7	865143	865149	0 %	100 %	0 %	0 %	452120409
18241	NC_020307	TTG	2	6	865322	865327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120409
18242	NC_020307	ACC	2	6	865359	865364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120409
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18244	NC_020307	TAT	2	6	865497	865502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18485	NC_020307	ATA	2	6	877249	877254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120427
18486	NC_020307	TAT	2	6	877268	877273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120427
18487	NC_020307	TTG	2	6	877290	877295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120427
18488	NC_020307	TG	3	6	877371	877376	0 %	50 %	50 %	0 %	452120427
18489	NC_020307	CCCAG	2	10	877538	877547	20 %	0 %	20 %	60 %	452120427
18490	NC_020307	GTT	2	6	877550	877555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120427
18491	NC_020307	TAC	2	6	877557	877562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120427
18492	NC_020307	ATC	2	6	877623	877628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120427
18493	NC_020307	TCCC	2	8	877659	877666	0 %	25 %	0 %	75 %	452120427
18494	NC_020307	GGAG	2	8	877668	877675	25 %	0 %	75 %	0 %	452120427
18495	NC_020307	GAA	2	6	877684	877689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120427
18496	NC_020307	AAGG	2	8	877699	877706	50 %	0 %	50 %	0 %	452120427
18497	NC_020307	CAGC	2	8	877768	877775	25 %	0 %	25 %	50 %	452120428
18498	NC_020307	CTA	2	6	877792	877797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120428
18499	NC_020307	CTC	2	6	877854	877859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120428
18500	NC_020307	T	7	7	877879	877885	0 %	100 %	0 %	0 %	452120428

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