MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_020307	GGC	2	6	710279	710284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120254
15003	NC_020307	GAT	2	6	710318	710323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120254
15004	NC_020307	CGG	2	6	710344	710349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120254
15005	NC_020307	GGC	2	6	710408	710413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120254
15006	NC_020307	ATC	2	6	710453	710458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120254
15007	NC_020307	TCA	2	6	710475	710480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120254
15008	NC_020307	GCT	2	6	710554	710559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120254
15009	NC_020307	TCG	2	6	710577	710582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120254
15010	NC_020307	ATA	2	6	710591	710596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120254
15011	NC_020307	TCG	2	6	710601	710606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120254
15012	NC_020307	TTG	2	6	710661	710666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120254
15013	NC_020307	GCC	2	6	710711	710716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120254
15014	NC_020307	CCG	2	6	710760	710765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120254
15015	NC_020307	CAC	2	6	710807	710812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120254
15016	NC_020307	TGT	2	6	710824	710829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120254
15017	NC_020307	GTC	2	6	710852	710857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120254
15018	NC_020307	CGC	2	6	710890	710895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120254
15019	NC_020307	GC	3	6	710894	710899	0 %	0 %	50 %	50 %	452120254
15020	NC_020307	CAT	2	6	710963	710968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120254
15021	NC_020307	TTC	2	6	711098	711103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120254
15022	NC_020307	TCGAC	2	10	711106	711115	20 %	20 %	20 %	40 %	452120254
15023	NC_020307	GCA	2	6	711124	711129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120254
15024	NC_020307	GCG	2	6	711149	711154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120254
15025	NC_020307	ACTC	2	8	711266	711273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15026	NC_020307	CGT	2	6	711299	711304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_020307	ATC	2	6	711307	711312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_020307	AT	3	6	711313	711318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_020307	CCA	2	6	711325	711330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15030	NC_020307	CGGCG	2	10	711453	711462	0 %	0 %	60 %	40 %	452120255
15031	NC_020307	CAC	2	6	711484	711489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120255
15032	NC_020307	GCT	2	6	711490	711495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120255
15033	NC_020307	AAC	2	6	711511	711516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120255
15034	NC_020307	CTC	2	6	711588	711593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15035	NC_020307	GAAA	2	8	711632	711639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_020307	TGC	2	6	711690	711695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120256
15037	NC_020307	CTG	2	6	711719	711724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120256
15038	NC_020307	ATC	2	6	711788	711793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120256
15039	NC_020307	CG	3	6	711815	711820	0 %	0 %	50 %	50 %	452120256
15040	NC_020307	TGC	2	6	711857	711862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120256
15041	NC_020307	TATT	2	8	711913	711920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_020307	AATT	2	8	711938	711945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_020307	AGA	2	6	712037	712042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_020307	AT	3	6	712045	712050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020307	TTA	2	6	712134	712139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_020307	GAA	2	6	712199	712204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_020307	AGG	2	6	712219	712224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_020307	AT	3	6	712226	712231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_020307	AAAG	2	8	712237	712244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_020307	ACA	2	6	712319	712324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_020307	CATC	2	8	712330	712337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15052	NC_020307	AGC	2	6	712357	712362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_020307	T	6	6	712378	712383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_020307	GCG	2	6	712480	712485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120257
15055	NC_020307	CAA	2	6	712494	712499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120257
15056	NC_020307	GC	3	6	712528	712533	0 %	0 %	50 %	50 %	452120257
15057	NC_020307	ACC	2	6	712641	712646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120257
15058	NC_020307	CAAAG	2	10	712704	712713	60 %	0 %	20 %	20 %	452120257
15059	NC_020307	ATC	2	6	712752	712757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120257
15060	NC_020307	CT	3	6	712897	712902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15061	NC_020307	TTC	2	6	712907	712912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_020307	TCT	2	6	712982	712987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_020307	TTG	2	6	712998	713003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_020307	AAAG	2	8	713050	713057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_020307	ATC	2	6	713064	713069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_020307	GTT	2	6	713089	713094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_020307	TGC	2	6	713121	713126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_020307	GCA	2	6	713269	713274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_020307	TAAT	2	8	713288	713295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_020307	GCA	3	9	713320	713328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_020307	ACT	2	6	713376	713381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_020307	T	6	6	713381	713386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_020307	CAG	2	6	713421	713426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_020307	GTT	2	6	713439	713444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_020307	GA	3	6	713466	713471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_020307	TTCA	2	8	713481	713488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15077	NC_020307	CAT	2	6	713501	713506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15078	NC_020307	TGA	2	6	713516	713521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_020307	T	6	6	713544	713549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_020307	TCA	2	6	713560	713565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_020307	ACACC	2	10	713602	713611	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15082	NC_020307	TCA	2	6	713743	713748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15083	NC_020307	ATT	2	6	713869	713874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_020307	AT	3	6	713886	713891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_020307	CTG	2	6	714026	714031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120258
15086	NC_020307	CCATC	2	10	714082	714091	20 %	20 %	0 %	60 %	452120258
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15089	NC_020307	AT	3	6	714262	714267	50 %	50 %	0 %	0 %	452120258
15090	NC_020307	GTT	2	6	714295	714300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120258
15091	NC_020307	GTT	2	6	714461	714466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120258
15092	NC_020307	TGC	2	6	714469	714474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120258
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15094	NC_020307	A	7	7	714660	714666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_020307	ACA	2	6	714698	714703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_020307	ATTT	2	8	714736	714743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_020307	TAA	2	6	714748	714753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_020307	AAT	2	6	714770	714775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_020307	ATT	2	6	714782	714787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_020307	T	6	6	714871	714876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_020307	ATTGT	2	10	714925	714934	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_020307	TGA	2	6	714956	714961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_020307	TGGT	2	8	714977	714984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_020307	GCG	2	6	715007	715012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_020307	TGG	2	6	715042	715047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_020307	TGTT	2	8	715084	715091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_020307	CTGG	2	8	715109	715116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15108	NC_020307	TCA	2	6	715153	715158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_020307	TCA	2	6	715242	715247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_020307	AAT	2	6	715276	715281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_020307	GA	3	6	715313	715318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_020307	TAT	2	6	715326	715331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_020307	TTAT	2	8	715375	715382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_020307	ATT	2	6	715386	715391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_020307	CAA	3	9	715396	715404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120259
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15120	NC_020307	TTG	2	6	715531	715536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120259
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15122	NC_020307	GAC	2	6	715634	715639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120259
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15124	NC_020307	TG	3	6	715760	715765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15126	NC_020307	AAT	2	6	715933	715938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120260
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15248	NC_020307	TTCGC	2	10	722157	722166	0 %	40 %	20 %	40 %	452120263
15249	NC_020307	AG	3	6	722249	722254	50 %	0 %	50 %	0 %	452120263
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15491	NC_020307	AGC	2	6	732861	732866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_020307	C	6	6	732866	732871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15493	NC_020307	GGT	2	6	732992	732997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120274
15494	NC_020307	TGT	2	6	733012	733017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120274
15495	NC_020307	A	7	7	733054	733060	100 %	0 %	0 %	0 %	452120274
15496	NC_020307	CATC	2	8	733062	733069	25 %	25 %	0 %	50 %	452120274
15497	NC_020307	TCA	2	6	733082	733087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120274
15498	NC_020307	T	6	6	733135	733140	0 %	100 %	0 %	0 %	452120274
15499	NC_020307	CAT	2	6	733158	733163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120274
15500	NC_020307	CTT	2	6	733166	733171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120274

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