MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020307	GACCA	2	10	660762	660771	40 %	0 %	20 %	40 %	452120215
14002	NC_020307	ATA	2	6	660773	660778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120215
14003	NC_020307	GTCA	2	8	660834	660841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14004	NC_020307	G	6	6	660891	660896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020307	AC	3	6	660913	660918	50 %	0 %	0 %	50 %	452120216
14006	NC_020307	TCC	2	6	661122	661127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120216
14007	NC_020307	CAG	2	6	661141	661146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120216
14008	NC_020307	CGC	2	6	661244	661249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120216
14009	NC_020307	TGG	2	6	661274	661279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120216
14010	NC_020307	TGG	2	6	661308	661313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120216
14011	NC_020307	AGT	2	6	661384	661389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120216
14012	NC_020307	GCC	2	6	661480	661485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_020307	GCT	2	6	661491	661496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_020307	AAGA	2	8	661504	661511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_020307	CGC	2	6	661563	661568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120217
14016	NC_020307	GC	3	6	661631	661636	0 %	0 %	50 %	50 %	452120217
14017	NC_020307	ATG	3	9	661736	661744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120217
14018	NC_020307	ACA	2	6	661781	661786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120217
14019	NC_020307	CCG	2	6	661840	661845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120217
14020	NC_020307	GC	3	6	661936	661941	0 %	0 %	50 %	50 %	452120217
14021	NC_020307	TCA	2	6	661971	661976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120217
14022	NC_020307	TTC	2	6	661999	662004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120217
14023	NC_020307	GC	3	6	662012	662017	0 %	0 %	50 %	50 %	452120217
14024	NC_020307	TG	3	6	662018	662023	0 %	50 %	50 %	0 %	452120217
14025	NC_020307	TC	3	6	662048	662053	0 %	50 %	0 %	50 %	452120217
14026	NC_020307	GGT	2	6	662139	662144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120217
14027	NC_020307	GCGT	2	8	662334	662341	0 %	25 %	50 %	25 %	452120217
14028	NC_020307	T	6	6	662362	662367	0 %	100 %	0 %	0 %	452120217
14029	NC_020307	GCA	2	6	662399	662404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120217
14030	NC_020307	CG	3	6	662421	662426	0 %	0 %	50 %	50 %	452120217
14031	NC_020307	GTG	2	6	662575	662580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120217
14032	NC_020307	TGCC	2	8	662645	662652	0 %	25 %	25 %	50 %	452120217
14033	NC_020307	GTCC	2	8	662665	662672	0 %	25 %	25 %	50 %	452120217
14034	NC_020307	CAT	2	6	662674	662679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120217
14035	NC_020307	GCA	2	6	662709	662714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120217
14036	NC_020307	GGC	2	6	662767	662772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120217
14037	NC_020307	TAC	2	6	662920	662925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120217
14038	NC_020307	CGG	2	6	662951	662956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120217
14039	NC_020307	GTT	2	6	662958	662963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120217
14040	NC_020307	CGCGG	2	10	663018	663027	0 %	0 %	60 %	40 %	452120217
14041	NC_020307	GTC	2	6	663047	663052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120217
14042	NC_020307	ATTG	2	8	663162	663169	25 %	50 %	25 %	0 %	452120217
14043	NC_020307	GCC	2	6	663347	663352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120217
14044	NC_020307	TGA	2	6	663446	663451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120217
14045	NC_020307	TTAA	2	8	663477	663484	50 %	50 %	0 %	0 %	452120217
14046	NC_020307	CT	3	6	663494	663499	0 %	50 %	0 %	50 %	452120218
14047	NC_020307	TTC	2	6	663550	663555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120218
14048	NC_020307	GCC	2	6	663560	663565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120218
14049	NC_020307	TCA	2	6	663572	663577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120218
14050	NC_020307	ACT	2	6	663686	663691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120218
14051	NC_020307	CAT	2	6	663709	663714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120218
14052	NC_020307	CGT	2	6	663730	663735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_020307	ATG	2	6	663742	663747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_020307	AAT	2	6	663750	663755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_020307	TTA	2	6	663765	663770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020307	ATT	2	6	663894	663899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_020307	TA	3	6	663909	663914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_020307	TGA	2	6	663994	663999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120219
14059	NC_020307	T	6	6	664006	664011	0 %	100 %	0 %	0 %	452120219
14060	NC_020307	GTT	2	6	664012	664017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120219
14061	NC_020307	A	6	6	664043	664048	100 %	0 %	0 %	0 %	452120219
14062	NC_020307	CAA	2	6	664079	664084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120219
14063	NC_020307	AAAC	2	8	664152	664159	75 %	0 %	0 %	25 %	452120219
14064	NC_020307	GGT	2	6	664279	664284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120219
14065	NC_020307	CCTG	2	8	664288	664295	0 %	25 %	25 %	50 %	452120219
14066	NC_020307	GGA	2	6	664317	664322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120219
14067	NC_020307	GGC	2	6	664326	664331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120219
14068	NC_020307	TTCC	2	8	664344	664351	0 %	50 %	0 %	50 %	452120219
14069	NC_020307	T	6	6	664402	664407	0 %	100 %	0 %	0 %	452120219
14070	NC_020307	CCG	2	6	664429	664434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120219
14071	NC_020307	AGT	2	6	664444	664449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120219
14072	NC_020307	ATA	2	6	664578	664583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120219
14073	NC_020307	ATG	2	6	664700	664705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120219
14074	NC_020307	TGA	2	6	664707	664712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120219
14075	NC_020307	AAAT	2	8	664731	664738	75 %	25 %	0 %	0 %	452120219
14076	NC_020307	TA	3	6	664788	664793	50 %	50 %	0 %	0 %	452120219
14077	NC_020307	A	6	6	664825	664830	100 %	0 %	0 %	0 %	452120219
14078	NC_020307	AAG	2	6	664858	664863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120219
14079	NC_020307	GA	3	6	664871	664876	50 %	0 %	50 %	0 %	452120219
14080	NC_020307	TA	3	6	664954	664959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020307	GGT	2	6	664979	664984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020307	CCT	2	6	665094	665099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14083	NC_020307	CAT	3	9	665157	665165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_020307	ATTA	2	8	665181	665188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_020307	TAT	2	6	665196	665201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020307	TTG	2	6	665218	665223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_020307	AAG	2	6	665249	665254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_020307	TAT	2	6	665267	665272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_020307	AAC	2	6	665279	665284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_020307	TGT	2	6	665376	665381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_020307	ATTT	2	8	665398	665405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020307	GAG	2	6	665437	665442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020307	GAA	2	6	665452	665457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120220
14094	NC_020307	TAT	2	6	665535	665540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120220
14095	NC_020307	T	7	7	665575	665581	0 %	100 %	0 %	0 %	452120220
14096	NC_020307	TTA	2	6	665627	665632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120220
14097	NC_020307	ATA	2	6	665642	665647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120220
14098	NC_020307	ATC	2	6	665738	665743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120220
14099	NC_020307	TTC	2	6	665833	665838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120220
14100	NC_020307	CCG	2	6	665850	665855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_020307	AAT	2	6	665877	665882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_020307	CAG	2	6	665892	665897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_020307	AAC	2	6	665937	665942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_020307	TA	3	6	666014	666019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_020307	ACA	2	6	666066	666071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_020307	TAC	2	6	666076	666081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_020307	ACTC	2	8	666155	666162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_020307	GCC	2	6	666167	666172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14109	NC_020307	ATT	2	6	666187	666192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_020307	GGC	2	6	666207	666212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_020307	TAA	2	6	666251	666256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_020307	G	6	6	666270	666275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_020307	ATG	2	6	666277	666282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_020307	TCT	2	6	666388	666393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120221
14115	NC_020307	CCA	2	6	666453	666458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120221
14116	NC_020307	TAC	2	6	666480	666485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120221
14117	NC_020307	ACTTC	2	10	666518	666527	20 %	40 %	0 %	40 %	452120221
14118	NC_020307	AT	3	6	666652	666657	50 %	50 %	0 %	0 %	452120221
14119	NC_020307	GCC	2	6	666787	666792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120221
14120	NC_020307	GAC	2	6	666872	666877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120221
14121	NC_020307	ATA	2	6	666920	666925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120221
14122	NC_020307	ATCCC	2	10	666966	666975	20 %	20 %	0 %	60 %	452120221
14123	NC_020307	GTT	2	6	667014	667019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120221
14124	NC_020307	TGG	2	6	667069	667074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120221
14125	NC_020307	TTG	2	6	667153	667158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_020307	GTT	2	6	667210	667215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_020307	AAC	2	6	667222	667227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_020307	AGC	2	6	667255	667260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14240	NC_020307	CG	3	6	672680	672685	0 %	0 %	50 %	50 %	452120226
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14355	NC_020307	TCG	2	6	678127	678132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120230
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14361	NC_020307	CGGCG	2	10	678238	678247	0 %	0 %	60 %	40 %	452120231
14362	NC_020307	TCA	2	6	678251	678256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120231
14363	NC_020307	CGGTAA	2	12	678324	678335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452120231
14364	NC_020307	ATG	2	6	678346	678351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120231
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14366	NC_020307	CCA	2	6	678390	678395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120231
14367	NC_020307	TCG	2	6	678422	678427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120231
14368	NC_020307	CTG	2	6	678434	678439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120231
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14377	NC_020307	TCG	2	6	678976	678981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120232
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14399	NC_020307	T	6	6	680248	680253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14403	NC_020307	A	6	6	680337	680342	100 %	0 %	0 %	0 %	452120233
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14462	NC_020307	ATT	3	9	683333	683341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14484	NC_020307	CAGG	2	8	684302	684309	25 %	0 %	50 %	25 %	452120235
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14486	NC_020307	GAT	2	6	684464	684469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120235
14487	NC_020307	CCG	2	6	684557	684562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14488	NC_020307	TGA	2	6	684569	684574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_020307	TTAT	2	8	684644	684651	25 %	75 %	0 %	0 %	452120236
14490	NC_020307	ATG	2	6	684668	684673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120236
14491	NC_020307	T	6	6	684674	684679	0 %	100 %	0 %	0 %	452120236
14492	NC_020307	CAAC	2	8	684696	684703	50 %	0 %	0 %	50 %	452120236
14493	NC_020307	TGA	2	6	684708	684713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120236
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