MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12007	NC_020307	AT	3	6	561537	561542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12248	NC_020307	GGC	2	6	573207	573212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120126
12249	NC_020307	CGA	2	6	573221	573226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120126
12250	NC_020307	GCT	2	6	573234	573239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120126
12251	NC_020307	ACT	2	6	573351	573356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120126
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12253	NC_020307	GTC	2	6	573489	573494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12254	NC_020307	TGG	2	6	573547	573552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120127
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12257	NC_020307	CTG	2	6	573600	573605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120127
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12261	NC_020307	CGG	2	6	573713	573718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120127
12262	NC_020307	CTG	2	6	573766	573771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120127
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12280	NC_020307	TAT	2	6	574571	574576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12325	NC_020307	A	6	6	576298	576303	100 %	0 %	0 %	0 %	452120132
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12331	NC_020307	GTT	2	6	576654	576659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12332	NC_020307	TC	3	6	576662	576667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12333	NC_020307	ATA	2	6	576678	576683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12334	NC_020307	TTA	2	6	576716	576721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12336	NC_020307	GC	4	8	576900	576907	0 %	0 %	50 %	50 %	452120133
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12353	NC_020307	CGC	2	6	577756	577761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120133
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12358	NC_020307	A	6	6	577932	577937	100 %	0 %	0 %	0 %	452120133
12359	NC_020307	GC	3	6	577971	577976	0 %	0 %	50 %	50 %	452120133
12360	NC_020307	GATG	2	8	578074	578081	25 %	25 %	50 %	0 %	452120133
12361	NC_020307	CGCTG	2	10	578113	578122	0 %	20 %	40 %	40 %	452120133
12362	NC_020307	GAGC	2	8	578151	578158	25 %	0 %	50 %	25 %	452120133
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12366	NC_020307	AATG	2	8	578418	578425	50 %	25 %	25 %	0 %	452120134
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12368	NC_020307	GC	3	6	578471	578476	0 %	0 %	50 %	50 %	452120134
12369	NC_020307	GGT	2	6	578502	578507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120134
12370	NC_020307	GGC	2	6	578516	578521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120134
12371	NC_020307	CATAGC	2	12	578578	578589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452120134
12372	NC_020307	GCA	2	6	578625	578630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120134
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12374	NC_020307	TCG	2	6	578708	578713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120134
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12376	NC_020307	TGA	2	6	578795	578800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120134
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12381	NC_020307	TCG	2	6	579144	579149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120134
12382	NC_020307	GTC	2	6	579192	579197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120134
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12384	NC_020307	TTG	2	6	579279	579284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12385	NC_020307	TCCT	2	8	579291	579298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12386	NC_020307	ATC	2	6	579318	579323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12388	NC_020307	CAG	2	6	579510	579515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120135
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12397	NC_020307	GC	3	6	580037	580042	0 %	0 %	50 %	50 %	452120135
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12413	NC_020307	CTT	2	6	580927	580932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12414	NC_020307	CAG	2	6	580975	580980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12461	NC_020307	AAT	2	6	583428	583433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12480	NC_020307	GGGT	2	8	584775	584782	0 %	25 %	75 %	0 %	452120139
12481	NC_020307	TTA	2	6	584813	584818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120139
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12483	NC_020307	CCG	2	6	584901	584906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120139
12484	NC_020307	TTAA	2	8	584996	585003	50 %	50 %	0 %	0 %	452120139
12485	NC_020307	CGCC	2	8	585117	585124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12486	NC_020307	GCC	2	6	585169	585174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12487	NC_020307	GT	3	6	585185	585190	0 %	50 %	50 %	0 %	452120140
12488	NC_020307	GGC	2	6	585200	585205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120140
12489	NC_020307	GAT	2	6	585223	585228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120140
12490	NC_020307	CCA	2	6	585257	585262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120140
12491	NC_020307	CAC	2	6	585271	585276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120140
12492	NC_020307	GCA	2	6	585298	585303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120140
12493	NC_020307	GCT	2	6	585328	585333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120140
12494	NC_020307	TGC	2	6	585375	585380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120140
12495	NC_020307	GAC	2	6	585440	585445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120140
12496	NC_020307	CCG	2	6	585537	585542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120140
12497	NC_020307	T	7	7	585556	585562	0 %	100 %	0 %	0 %	452120140
12498	NC_020307	CGCC	2	8	585760	585767	0 %	0 %	25 %	75 %	452120140
12499	NC_020307	CG	3	6	585776	585781	0 %	0 %	50 %	50 %	452120140
12500	NC_020307	TGA	2	6	585829	585834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120140

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