MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020307	TCG	2	6	536857	536862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120090
11503	NC_020307	CGT	3	9	536884	536892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120090
11504	NC_020307	TAA	2	6	536967	536972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120090
11505	NC_020307	ATC	2	6	537009	537014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_020307	GGC	2	6	537038	537043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_020307	TAA	2	6	537070	537075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120091
11508	NC_020307	TAA	2	6	537185	537190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120091
11509	NC_020307	GC	3	6	537210	537215	0 %	0 %	50 %	50 %	452120091
11510	NC_020307	GC	3	6	537221	537226	0 %	0 %	50 %	50 %	452120091
11511	NC_020307	CCA	2	6	537260	537265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120091
11512	NC_020307	TAC	2	6	537285	537290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120091
11513	NC_020307	AGC	2	6	537298	537303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120091
11514	NC_020307	TGC	2	6	537328	537333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120091
11515	NC_020307	TGC	2	6	537348	537353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120091
11516	NC_020307	CAG	2	6	537429	537434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120091
11517	NC_020307	TAA	2	6	537464	537469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120091
11518	NC_020307	CAC	2	6	537474	537479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120091
11519	NC_020307	GCGG	2	8	537507	537514	0 %	0 %	75 %	25 %	452120091
11520	NC_020307	GCC	2	6	537526	537531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120091
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11522	NC_020307	CTG	2	6	537627	537632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120091
11523	NC_020307	GCT	2	6	537635	537640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120091
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11526	NC_020307	ATA	2	6	537753	537758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120092
11527	NC_020307	GC	3	6	537807	537812	0 %	0 %	50 %	50 %	452120092
11528	NC_020307	GCC	2	6	537827	537832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120092
11529	NC_020307	CAT	2	6	537890	537895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120092
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11531	NC_020307	TGA	2	6	537962	537967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120092
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11533	NC_020307	GCG	2	6	538155	538160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120092
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11535	NC_020307	TGC	2	6	538254	538259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120092
11536	NC_020307	CAG	2	6	538292	538297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120092
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11538	NC_020307	CTC	2	6	538423	538428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_020307	T	8	8	538503	538510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020307	TTC	2	6	538561	538566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_020307	AG	3	6	538587	538592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_020307	TGT	2	6	538608	538613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020307	TTG	2	6	538661	538666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120093
11544	NC_020307	TGG	2	6	538707	538712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120093
11545	NC_020307	ACGCA	2	10	538748	538757	40 %	0 %	20 %	40 %	452120093
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11550	NC_020307	A	8	8	538877	538884	100 %	0 %	0 %	0 %	452120093
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11554	NC_020307	CG	3	6	538953	538958	0 %	0 %	50 %	50 %	452120093
11555	NC_020307	CGG	2	6	539025	539030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120093
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11557	NC_020307	GGC	2	6	539110	539115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120093
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11566	NC_020307	GATC	2	8	539614	539621	25 %	25 %	25 %	25 %	452120093
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11582	NC_020307	TCG	2	6	540328	540333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11588	NC_020307	TGC	2	6	540650	540655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_020307	GTC	2	6	540670	540675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_020307	ATCT	2	8	540712	540719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11592	NC_020307	CGG	2	6	540777	540782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_020307	CG	3	6	540789	540794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_020307	GC	3	6	540895	540900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_020307	CGC	2	6	540935	540940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11598	NC_020307	GCC	2	6	541162	541167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11599	NC_020307	TTG	2	6	541174	541179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11601	NC_020307	GC	3	6	541238	541243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_020307	CAG	2	6	541264	541269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_020307	ATG	2	6	541303	541308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020307	ATG	3	9	541318	541326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020307	CCA	2	6	541376	541381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11606	NC_020307	TGG	2	6	541406	541411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020307	CTA	2	6	541635	541640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_020307	TGCC	2	8	541755	541762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_020307	GTC	2	6	541881	541886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_020307	A	6	6	541965	541970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020307	GAA	2	6	541997	542002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020307	TGA	2	6	542016	542021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11614	NC_020307	CAG	2	6	542123	542128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_020307	GAA	2	6	542153	542158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020307	G	6	6	542159	542164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_020307	CGA	2	6	542350	542355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_020307	GC	3	6	542374	542379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_020307	GATC	2	8	542425	542432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_020307	TG	4	8	542449	542456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020307	TAA	2	6	542458	542463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_020307	GAA	2	6	542489	542494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_020307	ACG	2	6	542604	542609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11625	NC_020307	GAAG	2	8	542659	542666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11749	NC_020307	TTC	2	6	548607	548612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120100
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11869	NC_020307	TCT	2	6	554380	554385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120110
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11993	NC_020307	CCG	2	6	560781	560786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11994	NC_020307	CCA	2	6	560985	560990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11995	NC_020307	AAT	2	6	561097	561102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_020307	T	6	6	561106	561111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_020307	TATT	2	8	561131	561138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_020307	AGT	2	6	561188	561193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_020307	TAT	2	6	561225	561230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12000	NC_020307	A	6	6	561331	561336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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