MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_020307	CTCGC	2	10	4400777	4400786	0 %	20 %	20 %	60 %	452123701
93002	NC_020307	GC	3	6	4400785	4400790	0 %	0 %	50 %	50 %	452123701
93003	NC_020307	TGA	2	6	4400844	4400849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123701
93004	NC_020307	CTT	2	6	4400854	4400859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452123701
93005	NC_020307	CG	3	6	4400871	4400876	0 %	0 %	50 %	50 %	452123701
93006	NC_020307	ATG	2	6	4400940	4400945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123701
93007	NC_020307	GAA	2	6	4400975	4400980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123701
93008	NC_020307	GTT	2	6	4401047	4401052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93009	NC_020307	CAC	2	6	4401150	4401155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93010	NC_020307	ATAA	2	8	4401175	4401182	75 %	25 %	0 %	0 %	452123702
93011	NC_020307	TAT	2	6	4401191	4401196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123702
93012	NC_020307	TTA	2	6	4401222	4401227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123702
93013	NC_020307	GGC	2	6	4401243	4401248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123702
93014	NC_020307	AAG	2	6	4401269	4401274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123702
93015	NC_020307	GCG	2	6	4401283	4401288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123702
93016	NC_020307	A	8	8	4401313	4401320	100 %	0 %	0 %	0 %	452123702
93017	NC_020307	TGA	2	6	4401351	4401356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123702
93018	NC_020307	GTC	2	6	4401358	4401363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123702
93019	NC_020307	CGG	2	6	4401484	4401489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123703
93020	NC_020307	AGT	2	6	4401611	4401616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123703
93021	NC_020307	CCG	2	6	4401761	4401766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123703
93022	NC_020307	ATTTCC	2	12	4401778	4401789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452123703
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93024	NC_020307	CCG	2	6	4401847	4401852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123703
93025	NC_020307	GCGT	2	8	4401878	4401885	0 %	25 %	50 %	25 %	452123703
93026	NC_020307	GA	3	6	4401910	4401915	50 %	0 %	50 %	0 %	452123703
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93030	NC_020307	CGC	2	6	4402131	4402136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123703
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93032	NC_020307	GTG	2	6	4402194	4402199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123703
93033	NC_020307	CCG	2	6	4402325	4402330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123703
93034	NC_020307	TAA	2	6	4402430	4402435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452123703
93035	NC_020307	CCG	2	6	4402471	4402476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123703
93036	NC_020307	CGG	2	6	4402483	4402488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123703
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93038	NC_020307	CTG	3	9	4402548	4402556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123703
93039	NC_020307	CG	3	6	4402587	4402592	0 %	0 %	50 %	50 %	452123703
93040	NC_020307	GAT	2	6	4402622	4402627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123703
93041	NC_020307	CTT	2	6	4402661	4402666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452123703
93042	NC_020307	GCGCC	2	10	4402673	4402682	0 %	0 %	40 %	60 %	452123703
93043	NC_020307	CTC	2	6	4402689	4402694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452123703
93044	NC_020307	T	6	6	4402788	4402793	0 %	100 %	0 %	0 %	452123703
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93048	NC_020307	CCGG	2	8	4403045	4403052	0 %	0 %	50 %	50 %	452123703
93049	NC_020307	GGT	3	9	4403127	4403135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123703
93050	NC_020307	T	6	6	4403200	4403205	0 %	100 %	0 %	0 %	452123703
93051	NC_020307	CTC	2	6	4403208	4403213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452123703
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93054	NC_020307	GC	3	6	4403378	4403383	0 %	0 %	50 %	50 %	452123703
93055	NC_020307	GGC	2	6	4403491	4403496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123704
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93062	NC_020307	GC	4	8	4403939	4403946	0 %	0 %	50 %	50 %	452123704
93063	NC_020307	AAC	3	9	4403960	4403968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452123704
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93070	NC_020307	CG	3	6	4404137	4404142	0 %	0 %	50 %	50 %	452123704
93071	NC_020307	GCTG	2	8	4404214	4404221	0 %	25 %	50 %	25 %	452123704
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93074	NC_020307	TCAA	2	8	4404278	4404285	50 %	25 %	0 %	25 %	452123704
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93078	NC_020307	AAAGT	2	10	4404449	4404458	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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93082	NC_020307	AAC	2	6	4404695	4404700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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93086	NC_020307	CG	4	8	4404886	4404893	0 %	0 %	50 %	50 %	452123705
93087	NC_020307	GC	3	6	4404951	4404956	0 %	0 %	50 %	50 %	452123705
93088	NC_020307	A	6	6	4404998	4405003	100 %	0 %	0 %	0 %	452123705
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93109	NC_020307	GC	3	6	4406060	4406065	0 %	0 %	50 %	50 %	452123705
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93112	NC_020307	ATCCG	2	10	4406209	4406218	20 %	20 %	20 %	40 %	452123705
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93345	NC_020307	TCT	2	6	4416377	4416382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452123717
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93347	NC_020307	CGG	2	6	4416536	4416541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123717
93348	NC_020307	AGC	2	6	4416647	4416652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123717
93349	NC_020307	CGG	3	9	4416681	4416689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123717
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93351	NC_020307	GGT	2	6	4416751	4416756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123717
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93421	NC_020307	TCA	2	6	4420039	4420044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123720
93422	NC_020307	TGA	2	6	4420055	4420060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123720
93423	NC_020307	TGA	2	6	4420079	4420084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123720
93424	NC_020307	TGG	2	6	4420102	4420107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123720
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93444	NC_020307	GCT	2	6	4420940	4420945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123721
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93448	NC_020307	AGT	2	6	4421064	4421069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123721
93449	NC_020307	GGCG	2	8	4421114	4421121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93450	NC_020307	AGA	2	6	4421130	4421135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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93454	NC_020307	TGA	2	6	4421350	4421355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123722
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93456	NC_020307	GC	3	6	4421469	4421474	0 %	0 %	50 %	50 %	452123722
93457	NC_020307	GAT	2	6	4421540	4421545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123722
93458	NC_020307	CGT	2	6	4421560	4421565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123722
93459	NC_020307	TGC	2	6	4421622	4421627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123722
93460	NC_020307	TGC	2	6	4421631	4421636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123722
93461	NC_020307	AGC	2	6	4421664	4421669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123722
93462	NC_020307	GCG	2	6	4421675	4421680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123722
93463	NC_020307	GCA	2	6	4421695	4421700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123722
93464	NC_020307	TTG	2	6	4421774	4421779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123722
93465	NC_020307	CGCGGG	2	12	4421865	4421876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123722
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