MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_020307	GCC	2	6	4262240	4262245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123601
90002	NC_020307	GCT	2	6	4262258	4262263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123601
90003	NC_020307	GCG	2	6	4262282	4262287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123601
90004	NC_020307	GT	3	6	4262304	4262309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90005	NC_020307	CGG	2	6	4262354	4262359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123602
90006	NC_020307	GAC	2	6	4262418	4262423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90007	NC_020307	GGT	2	6	4262528	4262533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123602
90008	NC_020307	GATGC	2	10	4262535	4262544	20 %	20 %	40 %	20 %	452123602
90009	NC_020307	GGT	2	6	4262562	4262567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123602
90010	NC_020307	TGCGT	2	10	4262639	4262648	0 %	40 %	40 %	20 %	452123602
90011	NC_020307	TCG	2	6	4262740	4262745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90012	NC_020307	CTG	2	6	4262772	4262777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90013	NC_020307	GGC	2	6	4262874	4262879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123602
90014	NC_020307	GCG	2	6	4262956	4262961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123602
90015	NC_020307	CTG	2	6	4262973	4262978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90016	NC_020307	GCT	2	6	4263020	4263025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90017	NC_020307	GGC	2	6	4263111	4263116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123602
90018	NC_020307	ATCG	2	8	4263156	4263163	25 %	25 %	25 %	25 %	452123602
90019	NC_020307	CGG	2	6	4263164	4263169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123602
90020	NC_020307	TGG	2	6	4263175	4263180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123602
90021	NC_020307	GTT	2	6	4263284	4263289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123602
90022	NC_020307	GGCG	2	8	4263305	4263312	0 %	0 %	75 %	25 %	452123602
90023	NC_020307	TGA	2	6	4263343	4263348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123602
90024	NC_020307	GC	3	6	4263385	4263390	0 %	0 %	50 %	50 %	452123602
90025	NC_020307	CTG	2	6	4263402	4263407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90026	NC_020307	GCGGT	2	10	4263478	4263487	0 %	20 %	60 %	20 %	452123602
90027	NC_020307	TTG	2	6	4263568	4263573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123602
90028	NC_020307	GCT	2	6	4263641	4263646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123602
90029	NC_020307	CGT	2	6	4263690	4263695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123603
90030	NC_020307	GTC	2	6	4263696	4263701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123603
90031	NC_020307	T	6	6	4263702	4263707	0 %	100 %	0 %	0 %	452123603
90032	NC_020307	TGGA	2	8	4263712	4263719	25 %	25 %	50 %	0 %	452123603
90033	NC_020307	TGC	2	6	4263763	4263768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123603
90034	NC_020307	GCT	2	6	4263788	4263793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123603
90035	NC_020307	GTT	2	6	4263803	4263808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123603
90036	NC_020307	TATCGG	2	12	4263815	4263826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452123603
90037	NC_020307	TGT	3	9	4263868	4263876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123603
90038	NC_020307	ACC	2	6	4263987	4263992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123603
90039	NC_020307	TTA	2	6	4264024	4264029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123603
90040	NC_020307	CG	3	6	4264084	4264089	0 %	0 %	50 %	50 %	452123603
90041	NC_020307	GCCA	2	8	4264101	4264108	25 %	0 %	25 %	50 %	452123603
90042	NC_020307	GGC	2	6	4264125	4264130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123603
90043	NC_020307	CGC	2	6	4264195	4264200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123603
90044	NC_020307	GCT	2	6	4264244	4264249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123603
90045	NC_020307	CGC	2	6	4264279	4264284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123603
90046	NC_020307	GCA	2	6	4264295	4264300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123603
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90048	NC_020307	GCC	2	6	4264516	4264521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123604
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90050	NC_020307	TG	3	6	4264626	4264631	0 %	50 %	50 %	0 %	452123604
90051	NC_020307	GC	4	8	4264681	4264688	0 %	0 %	50 %	50 %	452123604
90052	NC_020307	TGC	2	6	4264726	4264731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123604
90053	NC_020307	GAAT	2	8	4264741	4264748	50 %	25 %	25 %	0 %	452123604
90054	NC_020307	ATT	2	6	4264761	4264766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123604
90055	NC_020307	TGC	2	6	4264774	4264779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123604
90056	NC_020307	GCT	2	6	4264796	4264801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123604
90057	NC_020307	T	6	6	4264808	4264813	0 %	100 %	0 %	0 %	452123604
90058	NC_020307	CGT	2	6	4264821	4264826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123604
90059	NC_020307	GAA	2	6	4264844	4264849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123604
90060	NC_020307	TCT	2	6	4264944	4264949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452123605
90061	NC_020307	TTC	2	6	4264950	4264955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452123605
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90063	NC_020307	TGA	2	6	4264997	4265002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123605
90064	NC_020307	AGG	2	6	4265019	4265024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452123605
90065	NC_020307	CTC	2	6	4265045	4265050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452123605
90066	NC_020307	CCG	2	6	4265059	4265064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123605
90067	NC_020307	GCTTCC	2	12	4265088	4265099	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	452123605
90068	NC_020307	CTTTT	2	10	4265102	4265111	0 %	80 %	0 %	20 %	452123605
90069	NC_020307	CATAAG	2	12	4265161	4265172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452123605
90070	NC_020307	CG	3	6	4265184	4265189	0 %	0 %	50 %	50 %	452123605
90071	NC_020307	GCT	2	6	4265242	4265247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90072	NC_020307	GGC	2	6	4265333	4265338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123605
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90076	NC_020307	CGGT	2	8	4265445	4265452	0 %	25 %	50 %	25 %	452123605
90077	NC_020307	CAT	2	6	4265486	4265491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123605
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90081	NC_020307	ATC	2	6	4265669	4265674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123605
90082	NC_020307	A	6	6	4265736	4265741	100 %	0 %	0 %	0 %	452123605
90083	NC_020307	AGC	2	6	4265745	4265750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90084	NC_020307	GCG	2	6	4265751	4265756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123605
90085	NC_020307	TAT	2	6	4265764	4265769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123605
90086	NC_020307	CGT	2	6	4265770	4265775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90087	NC_020307	TGA	2	6	4265902	4265907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123605
90088	NC_020307	CAG	2	6	4265915	4265920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90089	NC_020307	CGT	2	6	4265921	4265926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90090	NC_020307	T	6	6	4265933	4265938	0 %	100 %	0 %	0 %	452123605
90091	NC_020307	ATC	2	6	4265939	4265944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123605
90092	NC_020307	ACG	2	6	4266003	4266008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123605
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90094	NC_020307	AAT	2	6	4266103	4266108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452123605
90095	NC_020307	CCAGC	2	10	4266154	4266163	20 %	0 %	20 %	60 %	452123605
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90097	NC_020307	CTG	2	6	4266263	4266268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90098	NC_020307	T	6	6	4266293	4266298	0 %	100 %	0 %	0 %	452123605
90099	NC_020307	C	6	6	4266352	4266357	0 %	0 %	0 %	100 %	452123605
90100	NC_020307	GCT	2	6	4266420	4266425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90101	NC_020307	CAG	3	9	4266428	4266436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123605
90102	NC_020307	TAAT	2	8	4266459	4266466	50 %	50 %	0 %	0 %	452123605
90103	NC_020307	T	6	6	4266473	4266478	0 %	100 %	0 %	0 %	452123605
90104	NC_020307	TGC	2	6	4266531	4266536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90105	NC_020307	TCG	2	6	4266659	4266664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90106	NC_020307	C	6	6	4266697	4266702	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90107	NC_020307	AGA	2	6	4266721	4266726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90108	NC_020307	GA	3	6	4266728	4266733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90109	NC_020307	ATG	2	6	4266737	4266742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123606
90110	NC_020307	CTG	2	6	4266791	4266796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123606
90111	NC_020307	GC	3	6	4266797	4266802	0 %	0 %	50 %	50 %	452123606
90112	NC_020307	AT	3	6	4266831	4266836	50 %	50 %	0 %	0 %	452123606
90113	NC_020307	CTG	2	6	4266908	4266913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123606
90114	NC_020307	AGC	2	6	4266932	4266937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123606
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90116	NC_020307	GCGTA	2	10	4267062	4267071	20 %	20 %	40 %	20 %	452123606
90117	NC_020307	CGG	2	6	4267095	4267100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123606
90118	NC_020307	ATG	2	6	4267139	4267144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123606
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90229	NC_020307	CCA	2	6	4272544	4272549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123607
90230	NC_020307	TCG	2	6	4272607	4272612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123607
90231	NC_020307	GA	3	6	4272621	4272626	50 %	0 %	50 %	0 %	452123607
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90343	NC_020307	TCA	4	12	4278165	4278176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123612
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90467	NC_020307	CG	3	6	4284176	4284181	0 %	0 %	50 %	50 %	452123617
90468	NC_020307	GCT	2	6	4284259	4284264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123617
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90491	NC_020307	AAG	2	6	4285059	4285064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123617
90492	NC_020307	GCTG	3	12	4285078	4285089	0 %	25 %	50 %	25 %	452123617
90493	NC_020307	TG	3	6	4285092	4285097	0 %	50 %	50 %	0 %	452123617
90494	NC_020307	ACA	2	6	4285107	4285112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452123617
90495	NC_020307	ATG	2	6	4285116	4285121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123617
90496	NC_020307	CCA	2	6	4285125	4285130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123617
90497	NC_020307	TGT	2	6	4285197	4285202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90498	NC_020307	CGG	2	6	4285279	4285284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90499	NC_020307	GGGA	2	8	4285374	4285381	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90500	NC_020307	GCATT	2	10	4285388	4285397	20 %	40 %	20 %	20 %	452123618

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