MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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87002	NC_020307	GTT	2	6	4116782	4116787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123452
87003	NC_020307	GAT	2	6	4116857	4116862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123452
87004	NC_020307	CTG	2	6	4116899	4116904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87005	NC_020307	CGCT	2	8	4116956	4116963	0 %	25 %	25 %	50 %	452123452
87006	NC_020307	ACC	2	6	4117037	4117042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123452
87007	NC_020307	CGG	2	6	4117054	4117059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123452
87008	NC_020307	CTG	2	6	4117181	4117186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87009	NC_020307	TGC	2	6	4117222	4117227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87010	NC_020307	GGA	2	6	4117246	4117251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452123452
87011	NC_020307	TCAG	2	8	4117275	4117282	25 %	25 %	25 %	25 %	452123452
87012	NC_020307	TCA	2	6	4117311	4117316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123452
87013	NC_020307	CGA	2	6	4117390	4117395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87014	NC_020307	CTG	2	6	4117502	4117507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87015	NC_020307	CAC	2	6	4117522	4117527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123452
87016	NC_020307	GCTG	2	8	4117624	4117631	0 %	25 %	50 %	25 %	452123452
87017	NC_020307	ATT	2	6	4117697	4117702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123452
87018	NC_020307	TGG	2	6	4117753	4117758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123452
87019	NC_020307	CTG	2	6	4117762	4117767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87020	NC_020307	TGC	2	6	4117863	4117868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
87021	NC_020307	ACG	2	6	4117974	4117979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123453
87022	NC_020307	AAC	2	6	4117982	4117987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452123453
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87024	NC_020307	CGG	2	6	4118125	4118130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123453
87025	NC_020307	GCT	2	6	4118137	4118142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123453
87026	NC_020307	GGCAA	2	10	4118159	4118168	40 %	0 %	40 %	20 %	452123453
87027	NC_020307	AAG	2	6	4118265	4118270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123453
87028	NC_020307	AGC	3	9	4118300	4118308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123453
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87030	NC_020307	GGC	2	6	4118402	4118407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123453
87031	NC_020307	CTGA	2	8	4118516	4118523	25 %	25 %	25 %	25 %	452123454
87032	NC_020307	CAT	2	6	4118548	4118553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123454
87033	NC_020307	TGC	2	6	4118583	4118588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123454
87034	NC_020307	TATGGA	2	12	4118635	4118646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123454
87035	NC_020307	ATG	2	6	4118657	4118662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123454
87036	NC_020307	CCG	2	6	4118724	4118729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123454
87037	NC_020307	GGT	2	6	4118752	4118757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123454
87038	NC_020307	T	6	6	4118761	4118766	0 %	100 %	0 %	0 %	452123454
87039	NC_020307	GAA	2	6	4118770	4118775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123454
87040	NC_020307	TGA	2	6	4118811	4118816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87041	NC_020307	CCA	2	6	4118834	4118839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123455
87042	NC_020307	CCAT	2	8	4118854	4118861	25 %	25 %	0 %	50 %	452123455
87043	NC_020307	CTGA	2	8	4118878	4118885	25 %	25 %	25 %	25 %	452123455
87044	NC_020307	TGGCG	2	10	4118891	4118900	0 %	20 %	60 %	20 %	452123455
87045	NC_020307	GCTG	2	8	4119025	4119032	0 %	25 %	50 %	25 %	452123456
87046	NC_020307	GC	3	6	4119111	4119116	0 %	0 %	50 %	50 %	452123456
87047	NC_020307	GAA	2	6	4119155	4119160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123456
87048	NC_020307	CGG	2	6	4119204	4119209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123456
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87050	NC_020307	A	6	6	4119235	4119240	100 %	0 %	0 %	0 %	452123456
87051	NC_020307	AGT	2	6	4119341	4119346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123456
87052	NC_020307	CGA	2	6	4119373	4119378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123456
87053	NC_020307	GCA	2	6	4119400	4119405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123456
87054	NC_020307	CAG	2	6	4119431	4119436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123456
87055	NC_020307	ATCGC	2	10	4119489	4119498	20 %	20 %	20 %	40 %	452123456
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87082	NC_020307	TGC	2	6	4120797	4120802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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87084	NC_020307	CTG	2	6	4120829	4120834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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87089	NC_020307	TTAC	2	8	4121054	4121061	25 %	50 %	0 %	25 %	452123456
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87098	NC_020307	CAG	2	6	4121425	4121430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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87100	NC_020307	CTG	2	6	4121439	4121444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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87102	NC_020307	GC	3	6	4121699	4121704	0 %	0 %	50 %	50 %	452123456
87103	NC_020307	G	7	7	4121722	4121728	0 %	0 %	100 %	0 %	452123456
87104	NC_020307	ATG	3	9	4121737	4121745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123456
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87110	NC_020307	TGTT	2	8	4122011	4122018	0 %	75 %	25 %	0 %	452123457
87111	NC_020307	T	6	6	4122049	4122054	0 %	100 %	0 %	0 %	452123457
87112	NC_020307	TGA	2	6	4122105	4122110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123457
87113	NC_020307	CT	3	6	4122115	4122120	0 %	50 %	0 %	50 %	452123457
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87115	NC_020307	G	6	6	4122184	4122189	0 %	0 %	100 %	0 %	452123457
87116	NC_020307	GGA	2	6	4122205	4122210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452123457
87117	NC_020307	TGC	2	6	4122212	4122217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123457
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87174	NC_020307	CT	3	6	4124732	4124737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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87232	NC_020307	T	8	8	4127355	4127362	0 %	100 %	0 %	0 %	452123462
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