MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH2

Total Repeats: 2013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020293	CG	3	6	35	40	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
2	NC_020293	ACC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866852
3	NC_020293	GCC	2	6	93	98	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866852
4	NC_020293	TGC	2	6	173	178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
5	NC_020293	GC	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
6	NC_020293	CCCGC	2	10	275	284	0 %	0 %	20 %	80 %	457866852
7	NC_020293	GGAACC	2	12	291	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
8	NC_020293	TCC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
9	NC_020293	TGG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
10	NC_020293	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
11	NC_020293	CG	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
12	NC_020293	GGC	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
13	NC_020293	GGC	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
14	NC_020293	CGG	2	6	411	416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
15	NC_020293	GTG	2	6	423	428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
16	NC_020293	CTC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
17	NC_020293	GCG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
18	NC_020293	GGT	2	6	455	460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
19	NC_020293	TCG	3	9	514	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
20	NC_020293	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
21	NC_020293	CGG	2	6	549	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
22	NC_020293	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
23	NC_020293	CCG	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866852
24	NC_020293	ACC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866852
25	NC_020293	GCC	2	6	648	653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866852
26	NC_020293	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	457866852
27	NC_020293	GGC	2	6	714	719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
28	NC_020293	GGT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
29	NC_020293	GTCC	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	457866852
30	NC_020293	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
31	NC_020293	CG	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
32	NC_020293	CTCGG	2	10	946	955	0 %	20 %	40 %	40 %	457866852
33	NC_020293	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
34	NC_020293	TGG	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
35	NC_020293	TGA	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	457866852
36	NC_020293	GTCG	2	8	1032	1039	0 %	25 %	50 %	25 %	457866852
37	NC_020293	TCG	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
38	NC_020293	GCG	3	9	1064	1072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
39	NC_020293	CGG	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
40	NC_020293	ACG	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
41	NC_020293	GCA	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
42	NC_020293	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	457866852
43	NC_020293	GCGG	2	8	1264	1271	0 %	0 %	75 %	25 %	457866852
44	NC_020293	CGG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
45	NC_020293	GGCC	2	8	1285	1292	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
46	NC_020293	CCT	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
47	NC_020293	CCT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
48	NC_020293	GAG	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866852
49	NC_020293	GCT	2	6	1641	1646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020293	TCC	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_020293	TAC	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020293	GCT	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020293	TGC	2	6	1813	1818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020293	CGTC	2	8	1913	1920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020293	CGT	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020293	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020293	TGAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020293	GCTCG	2	10	2133	2142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_020293	CGAG	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020293	CTGAG	2	10	2275	2284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020293	CTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020293	CGG	2	6	2351	2356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020293	TGG	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020293	CAG	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020293	CTCGG	2	10	2462	2471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_020293	GGCT	2	8	2472	2479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020293	CCTGG	2	10	2594	2603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_020293	TGCG	2	8	2740	2747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020293	GGA	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020293	GCT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866853
71	NC_020293	CCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866853
72	NC_020293	CCT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866853
73	NC_020293	CGCC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	25 %	75 %	457866853
74	NC_020293	GAC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866853
75	NC_020293	GGC	2	6	3103	3108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866853
76	NC_020293	CCGG	3	12	3149	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	457866853
77	NC_020293	CGG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866853
78	NC_020293	CGT	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866853
79	NC_020293	GCA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866853
80	NC_020293	TCCT	2	8	3307	3314	0 %	50 %	0 %	50 %	457866853
81	NC_020293	ACCCGC	2	12	3375	3386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	457866854
82	NC_020293	CGGC	2	8	3477	3484	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
83	NC_020293	TG	3	6	3502	3507	0 %	50 %	50 %	0 %	457866854
84	NC_020293	CAG	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
85	NC_020293	TTC	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	457866854
86	NC_020293	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	457866854
87	NC_020293	CTG	3	9	3710	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866854
88	NC_020293	CG	3	6	3752	3757	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
89	NC_020293	GCC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
90	NC_020293	TTC	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	457866854
91	NC_020293	CCT	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
92	NC_020293	CGCC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	25 %	75 %	457866854
93	NC_020293	GCCGC	2	10	3808	3817	0 %	0 %	40 %	60 %	457866854
94	NC_020293	TCC	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
95	NC_020293	CCG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
96	NC_020293	CCT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
97	NC_020293	CCA	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866854
98	NC_020293	CGT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866854
99	NC_020293	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
100	NC_020293	GA	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	457866854
101	NC_020293	TCCAC	2	10	4033	4042	20 %	20 %	0 %	60 %	457866854
102	NC_020293	CCGG	2	8	4062	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
103	NC_020293	CGG	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866854
104	NC_020293	CACTC	2	10	4117	4126	20 %	20 %	0 %	60 %	457866854
105	NC_020293	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
106	NC_020293	ACCC	2	8	4172	4179	25 %	0 %	0 %	75 %	457866854
107	NC_020293	GCGG	2	8	4241	4248	0 %	0 %	75 %	25 %	457866854
108	NC_020293	TCC	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
109	NC_020293	GCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
110	NC_020293	CAG	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
111	NC_020293	ACG	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
112	NC_020293	GGT	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866854
113	NC_020293	CCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
114	NC_020293	GTC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866854
115	NC_020293	GCC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
116	NC_020293	CAGT	2	8	4639	4646	25 %	25 %	25 %	25 %	457866854
117	NC_020293	ATG	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020293	CACGA	2	10	4814	4823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_020293	TG	3	6	4852	4857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020293	GGA	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020293	CCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020293	TCC	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020293	GTG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020293	GGT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866855
125	NC_020293	TGA	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	457866855
126	NC_020293	GC	3	6	5210	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	457866855
127	NC_020293	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866855
128	NC_020293	ATC	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	457866855
129	NC_020293	GCC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020293	GCC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020293	GGGTC	2	10	5463	5472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020293	TC	4	8	5471	5478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020293	A	6	6	5508	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020293	ACC	2	6	5518	5523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_020293	GCT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020293	TCC	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_020293	CG	3	6	5765	5770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020293	GAG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020293	CCGG	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
140	NC_020293	GCT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866856
141	NC_020293	CAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866856
142	NC_020293	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866856
143	NC_020293	GGC	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866856
144	NC_020293	GCG	2	6	6155	6160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866856
145	NC_020293	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866856
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148	NC_020293	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
149	NC_020293	GGGCA	2	10	6351	6360	20 %	0 %	60 %	20 %	457866856
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162	NC_020293	TCCGC	2	10	6836	6845	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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164	NC_020293	TGG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020293	CGA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_020293	CTG	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_020293	GTC	2	6	7165	7170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_020293	CCGGG	2	10	7226	7235	0 %	0 %	60 %	40 %	457866857
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176	NC_020293	CCG	2	6	7308	7313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866857
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185	NC_020293	TGG	3	9	7603	7611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866857
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257	NC_020293	AGC	2	6	10462	10467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_020293	GCC	2	6	10495	10500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_020293	T	6	6	10525	10530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_020293	AAGAC	2	10	10588	10597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_020293	GCT	2	6	10630	10635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_020293	GGC	2	6	10734	10739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866861
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269	NC_020293	GCA	2	6	10979	10984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866861
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271	NC_020293	CTG	2	6	11014	11019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866861
272	NC_020293	GCG	2	6	11067	11072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866861
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274	NC_020293	CTG	2	6	11101	11106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866861
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289	NC_020293	CGG	2	6	11488	11493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_020293	GAG	2	6	16235	16240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866866
400	NC_020293	CCGG	2	8	16243	16250	0 %	0 %	50 %	50 %	457866866
401	NC_020293	G	6	6	16338	16343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
402	NC_020293	GGC	2	6	16358	16363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_020293	GCGG	2	8	16373	16380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
404	NC_020293	G	6	6	16414	16419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
405	NC_020293	GTC	2	6	16471	16476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_020293	GGGC	2	8	16514	16521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
407	NC_020293	GC	4	8	16523	16530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
408	NC_020293	CTGC	2	8	16548	16555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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432	NC_020293	CGG	2	6	17894	17899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866868
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497	NC_020293	TGC	2	6	20086	20091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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