MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH2

Total Repeats: 2013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020293	TCGCCA	2	12	53527	53538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	457866905
1502	NC_020293	GCG	2	6	53541	53546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866905
1503	NC_020293	GC	3	6	53563	53568	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
1504	NC_020293	GGGC	2	8	53699	53706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_020293	CGG	2	6	53791	53796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020293	GT	3	6	53848	53853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020293	CCCG	2	8	53867	53874	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1508	NC_020293	CCTC	2	8	53912	53919	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1509	NC_020293	GGCG	2	8	53926	53933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_020293	TGG	2	6	53969	53974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020293	GTT	2	6	54006	54011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020293	CGT	2	6	54063	54068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020293	GCC	2	6	54074	54079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_020293	GC	3	6	54106	54111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_020293	CCT	2	6	54154	54159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866906
1516	NC_020293	GTTG	2	8	54160	54167	0 %	50 %	50 %	0 %	457866906
1517	NC_020293	GGC	2	6	54187	54192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866906
1518	NC_020293	TCG	2	6	54198	54203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866906
1519	NC_020293	CAC	2	6	54302	54307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866906
1520	NC_020293	GC	3	6	54364	54369	0 %	0 %	50 %	50 %	457866906
1521	NC_020293	GCG	2	6	54490	54495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866906
1522	NC_020293	CAC	2	6	54619	54624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866906
1523	NC_020293	CTGCG	2	10	54660	54669	0 %	20 %	40 %	40 %	457866906
1524	NC_020293	GGA	2	6	54761	54766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866906
1525	NC_020293	GCCG	2	8	54783	54790	0 %	0 %	50 %	50 %	457866906
1526	NC_020293	GCGGT	2	10	54819	54828	0 %	20 %	60 %	20 %	457866906
1527	NC_020293	GGGC	2	8	54830	54837	0 %	0 %	75 %	25 %	457866906
1528	NC_020293	CGCC	2	8	54871	54878	0 %	0 %	25 %	75 %	457866906
1529	NC_020293	CCCG	2	8	54894	54901	0 %	0 %	25 %	75 %	457866906
1530	NC_020293	AGC	2	6	54934	54939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866906
1531	NC_020293	CGC	2	6	54950	54955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866906
1532	NC_020293	CCA	2	6	55041	55046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866907
1533	NC_020293	CCA	2	6	55107	55112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866907
1534	NC_020293	CGA	2	6	55116	55121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866907
1535	NC_020293	GTG	2	6	55174	55179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866907
1536	NC_020293	CG	3	6	55189	55194	0 %	0 %	50 %	50 %	457866907
1537	NC_020293	GTG	2	6	55219	55224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866907
1538	NC_020293	GAC	2	6	55264	55269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866907
1539	NC_020293	GCC	2	6	55279	55284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866907
1540	NC_020293	GTG	2	6	55285	55290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866907
1541	NC_020293	CGA	2	6	55344	55349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866907
1542	NC_020293	CTC	2	6	55402	55407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866907
1543	NC_020293	CAC	2	6	55509	55514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866908
1544	NC_020293	GTG	2	6	55531	55536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866908
1545	NC_020293	GGCGCG	2	12	55551	55562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1546	NC_020293	GCCA	2	8	55644	55651	25 %	0 %	25 %	50 %	457866908
1547	NC_020293	CGG	2	6	55658	55663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1548	NC_020293	GTT	2	6	55688	55693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	457866908
1549	NC_020293	GGT	2	6	55704	55709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866908
1550	NC_020293	GGC	2	6	55779	55784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1551	NC_020293	CCACGG	2	12	55812	55823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	457866908
1552	NC_020293	CAG	2	6	55935	55940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866908
1553	NC_020293	GCG	2	6	55989	55994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1554	NC_020293	CCG	2	6	56110	56115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866908
1555	NC_020293	AGCC	2	8	56158	56165	25 %	0 %	25 %	50 %	457866908
1556	NC_020293	GTG	2	6	56296	56301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866908
1557	NC_020293	GCG	2	6	56341	56346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1558	NC_020293	GTCGT	2	10	56359	56368	0 %	40 %	40 %	20 %	457866908
1559	NC_020293	GCC	2	6	56418	56423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866908
1560	NC_020293	TCG	2	6	56449	56454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866908
1561	NC_020293	TC	3	6	56455	56460	0 %	50 %	0 %	50 %	457866908
1562	NC_020293	CCA	2	6	56495	56500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866908
1563	NC_020293	CGG	2	6	56505	56510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1564	NC_020293	GCC	2	6	56527	56532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866908
1565	NC_020293	CGG	2	6	56588	56593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866908
1566	NC_020293	GCC	2	6	56623	56628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866908
1567	NC_020293	GCC	2	6	56639	56644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866908
1568	NC_020293	GCG	2	6	56749	56754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_020293	GGT	2	6	56884	56889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020293	C	6	6	56898	56903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_020293	GAC	2	6	56910	56915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_020293	CACAC	2	10	56916	56925	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1573	NC_020293	CGACCG	2	12	56926	56937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_020293	GAC	2	6	56960	56965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_020293	GCA	2	6	56968	56973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_020293	CGA	2	6	57007	57012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_020293	GACC	2	8	57029	57036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_020293	GC	3	6	57041	57046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_020293	GTG	2	6	57062	57067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020293	GGC	2	6	57099	57104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_020293	TGC	2	6	57120	57125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_020293	GCG	2	6	57126	57131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_020293	CGA	3	9	57172	57180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1584	NC_020293	GCG	2	6	57223	57228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866909
1585	NC_020293	CAC	2	6	57271	57276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866909
1586	NC_020293	CGG	2	6	57315	57320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866909
1587	NC_020293	GCT	2	6	57356	57361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1588	NC_020293	CG	4	8	57375	57382	0 %	0 %	50 %	50 %	457866909
1589	NC_020293	GCT	2	6	57472	57477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1590	NC_020293	CTG	2	6	57497	57502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1591	NC_020293	GCG	2	6	57649	57654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866909
1592	NC_020293	CTG	2	6	57704	57709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1593	NC_020293	GCA	2	6	57718	57723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1594	NC_020293	GCT	2	6	57733	57738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1595	NC_020293	TCC	2	6	57765	57770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866909
1596	NC_020293	CGG	2	6	57788	57793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866909
1597	NC_020293	CCGG	2	8	57800	57807	0 %	0 %	50 %	50 %	457866909
1598	NC_020293	GCA	2	6	57822	57827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1599	NC_020293	GTGCC	2	10	57901	57910	0 %	20 %	40 %	40 %	457866909
1600	NC_020293	GAA	2	6	57920	57925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	457866909
1601	NC_020293	TCC	2	6	57992	57997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866909
1602	NC_020293	GAC	2	6	58049	58054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1603	NC_020293	GCC	2	6	58057	58062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866909
1604	NC_020293	CTG	3	9	58082	58090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866909
1605	NC_020293	CGG	2	6	58098	58103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866909
1606	NC_020293	CGTCC	2	10	58149	58158	0 %	20 %	20 %	60 %	457866909
1607	NC_020293	CGC	2	6	58241	58246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866909
1608	NC_020293	CAC	2	6	58300	58305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866909
1609	NC_020293	CCG	2	6	58320	58325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866909
1610	NC_020293	GCCC	2	8	58336	58343	0 %	0 %	25 %	75 %	457866909
1611	NC_020293	TGG	2	6	58356	58361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866909
1612	NC_020293	CGG	2	6	58417	58422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866909
1613	NC_020293	TG	3	6	58435	58440	0 %	50 %	50 %	0 %	457866909
1614	NC_020293	CGC	2	6	58471	58476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866909
1615	NC_020293	TCG	2	6	58577	58582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866910
1616	NC_020293	CCT	2	6	58590	58595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866910
1617	NC_020293	TCG	2	6	58613	58618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866910
1618	NC_020293	CGA	2	6	58626	58631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866910
1619	NC_020293	GGC	2	6	58680	58685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866910
1620	NC_020293	CGT	3	9	58704	58712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866910
1621	NC_020293	CGC	2	6	58713	58718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866910
1622	NC_020293	CCT	2	6	58724	58729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866910
1623	NC_020293	CAC	2	6	58743	58748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866910
1624	NC_020293	GGGCG	2	10	58761	58770	0 %	0 %	80 %	20 %	457866910
1625	NC_020293	CTGCG	2	10	58805	58814	0 %	20 %	40 %	40 %	457866910
1626	NC_020293	TCG	2	6	58835	58840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866910
1627	NC_020293	TGA	2	6	58859	58864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	457866910
1628	NC_020293	CGG	2	6	58973	58978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866910
1629	NC_020293	GCC	2	6	59014	59019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866910
1630	NC_020293	GTG	2	6	59020	59025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866910
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1632	NC_020293	ACC	2	6	59038	59043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866910
1633	NC_020293	GCC	2	6	59051	59056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866910
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1754	NC_020293	GCG	2	6	63447	63452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866915
1755	NC_020293	AGC	2	6	63619	63624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866915
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1757	NC_020293	TCA	2	6	63653	63658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	457866915
1758	NC_020293	GGAACT	2	12	63665	63676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	457866915
1759	NC_020293	ACGG	2	8	63701	63708	25 %	0 %	50 %	25 %	457866915
1760	NC_020293	ACG	2	6	63772	63777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866915
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1762	NC_020293	GGC	2	6	63933	63938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866915
1763	NC_020293	GC	3	6	63965	63970	0 %	0 %	50 %	50 %	457866915
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1771	NC_020293	GCA	2	6	64209	64214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866916
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1773	NC_020293	CG	4	8	64319	64326	0 %	0 %	50 %	50 %	457866916
1774	NC_020293	GCG	3	9	64324	64332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866916
1775	NC_020293	GGC	2	6	64429	64434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866916
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1783	NC_020293	CGG	2	6	64559	64564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866917
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1785	NC_020293	CCT	2	6	64622	64627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866917
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1803	NC_020293	CGGC	2	8	65121	65128	0 %	0 %	50 %	50 %	457866917
1804	NC_020293	CG	4	8	65132	65139	0 %	0 %	50 %	50 %	457866917
1805	NC_020293	CGCC	2	8	65168	65175	0 %	0 %	25 %	75 %	457866917
1806	NC_020293	GCG	3	9	65182	65190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866917
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1808	NC_020293	ACG	2	6	65412	65417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1870	NC_020293	GGC	2	6	67760	67765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1874	NC_020293	CCG	2	6	67915	67920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1875	NC_020293	CGG	3	9	67939	67947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1877	NC_020293	G	6	6	68034	68039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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