MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC03

Total Repeats: 727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019895	GGGC	2	8	14	21	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019895	GCCC	2	8	28	35	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019895	GGC	2	6	48	53	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
4	NC_019895	CAGC	2	8	114	121	25 %	0 %	25 %	50 %	430748168
5	NC_019895	GCT	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
6	NC_019895	TCGCT	2	10	202	211	0 %	40 %	20 %	40 %	430748168
7	NC_019895	AGG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748168
8	NC_019895	AGC	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
9	NC_019895	GC	3	6	304	309	0 %	0 %	50 %	50 %	430748168
10	NC_019895	GGC	2	6	336	341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
11	NC_019895	CGG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
12	NC_019895	CCG	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
13	NC_019895	TGCG	2	8	577	584	0 %	25 %	50 %	25 %	430748168
14	NC_019895	TTG	2	6	616	621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748168
15	NC_019895	GCC	2	6	694	699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
16	NC_019895	GCT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
17	NC_019895	AGC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
18	NC_019895	CCG	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
19	NC_019895	TCG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
20	NC_019895	TTCGGC	2	12	1011	1022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
21	NC_019895	CGG	2	6	1047	1052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
22	NC_019895	CGG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
23	NC_019895	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748168
24	NC_019895	GC	3	6	1240	1245	0 %	0 %	50 %	50 %	430748168
25	NC_019895	CGG	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
26	NC_019895	CGA	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
27	NC_019895	GCTT	2	8	1295	1302	0 %	50 %	25 %	25 %	430748168
28	NC_019895	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
29	NC_019895	TCC	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748168
30	NC_019895	CGGTGA	2	12	1403	1414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430748168
31	NC_019895	GGC	2	6	1473	1478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
32	NC_019895	GCT	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
33	NC_019895	TCG	2	6	1588	1593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
34	NC_019895	CCA	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748168
35	NC_019895	AACTC	2	10	1631	1640	40 %	20 %	0 %	40 %	430748168
36	NC_019895	CTT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
37	NC_019895	GCG	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
38	NC_019895	CGG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
39	NC_019895	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
40	NC_019895	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
41	NC_019895	CGG	3	9	1838	1846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
42	NC_019895	CTT	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
43	NC_019895	ATC	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748168
44	NC_019895	TAT	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748168
45	NC_019895	TCC	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748169
46	NC_019895	GGT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748169
47	NC_019895	TGA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748169
48	NC_019895	GCC	2	6	2039	2044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748169
49	NC_019895	ACA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748169
50	NC_019895	GGC	2	6	2143	2148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748169
51	NC_019895	CTG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748169
52	NC_019895	TGG	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748169
53	NC_019895	TTG	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019895	GGGC	2	8	2308	2315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019895	GCCC	2	8	2322	2329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_019895	CGC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748170
57	NC_019895	AGC	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748170
58	NC_019895	GTC	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748170
59	NC_019895	TTCC	2	8	2476	2483	0 %	50 %	0 %	50 %	430748170
60	NC_019895	TCG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748170
61	NC_019895	CTTG	2	8	2496	2503	0 %	50 %	25 %	25 %	430748170
62	NC_019895	GCTGC	2	10	2506	2515	0 %	20 %	40 %	40 %	430748170
63	NC_019895	TGG	2	6	2562	2567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748170
64	NC_019895	TG	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	430748170
65	NC_019895	TTTCC	2	10	2617	2626	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019895	TTCA	2	8	2746	2753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019895	TGAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019895	GCG	2	6	2792	2797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019895	GGC	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019895	GCCG	2	8	2901	2908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019895	CGG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019895	GGA	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019895	GGCT	2	8	3027	3034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019895	C	6	6	3045	3050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_019895	CGG	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019895	GACAA	2	10	3146	3155	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019895	ATC	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019895	CCG	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748171
79	NC_019895	AAC	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748171
80	NC_019895	TCC	2	6	3390	3395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748171
81	NC_019895	CAT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
82	NC_019895	GTA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
83	NC_019895	AGCCC	2	10	3490	3499	20 %	0 %	20 %	60 %	430748171
84	NC_019895	CTG	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748171
85	NC_019895	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748171
86	NC_019895	CA	3	6	3687	3692	50 %	0 %	0 %	50 %	430748171
87	NC_019895	CCTG	2	8	3694	3701	0 %	25 %	25 %	50 %	430748171
88	NC_019895	CCG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748171
89	NC_019895	TCA	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
90	NC_019895	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
91	NC_019895	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748171
92	NC_019895	CCCG	2	8	4020	4027	0 %	0 %	25 %	75 %	430748171
93	NC_019895	ATG	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
94	NC_019895	GAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
95	NC_019895	CGG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748171
96	NC_019895	CTC	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019895	CCG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019895	TAC	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019895	G	8	8	4363	4370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019895	CAG	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019895	CGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019895	GC	4	8	4485	4492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019895	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019895	CAC	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748172
105	NC_019895	GC	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	430748172
106	NC_019895	AAG	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748172
107	NC_019895	GCC	2	6	4702	4707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
108	NC_019895	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748172
109	NC_019895	GTGAGG	2	12	4743	4754	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	430748172
110	NC_019895	GCC	2	6	4793	4798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
111	NC_019895	CTC	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748172
112	NC_019895	CGG	2	6	4815	4820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
113	NC_019895	CCG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
114	NC_019895	CGG	2	6	4885	4890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
115	NC_019895	CCGC	2	8	4891	4898	0 %	0 %	25 %	75 %	430748172
116	NC_019895	CGAT	2	8	4956	4963	25 %	25 %	25 %	25 %	430748172
117	NC_019895	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
118	NC_019895	GAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748172
119	NC_019895	TGC	2	6	5121	5126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
120	NC_019895	GGC	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
121	NC_019895	GGA	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748172
122	NC_019895	GCA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748172
123	NC_019895	ATC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748172
124	NC_019895	CGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
125	NC_019895	GCT	2	6	5674	5679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
126	NC_019895	CCGC	2	8	5687	5694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_019895	CCG	2	6	5707	5712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019895	CGC	2	6	5731	5736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019895	CTGC	2	8	5745	5752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019895	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019895	CGC	2	6	5806	5811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019895	GAA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748173
133	NC_019895	GCC	2	6	5920	5925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748173
134	NC_019895	CGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748173
135	NC_019895	CCGGG	2	10	6018	6027	0 %	0 %	60 %	40 %	430748173
136	NC_019895	CTGC	2	8	6054	6061	0 %	25 %	25 %	50 %	430748173
137	NC_019895	TGG	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748173
138	NC_019895	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
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140	NC_019895	GCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
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153	NC_019895	GGTT	2	8	6706	6713	0 %	50 %	50 %	0 %	430748174
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256	NC_019895	GCCG	2	8	10972	10979	0 %	0 %	50 %	50 %	430748177
257	NC_019895	GAG	2	6	10997	11002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748177
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259	NC_019895	CGGG	2	8	11097	11104	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
260	NC_019895	CGG	2	6	11145	11150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_019895	CCA	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_019895	GGA	2	6	11178	11183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019895	GAA	2	6	11197	11202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748178
264	NC_019895	GCG	2	6	11219	11224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748178
265	NC_019895	TGA	2	6	11225	11230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748178
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267	NC_019895	CGT	2	6	11244	11249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748178
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392	NC_019895	GAT	3	9	17010	17018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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