MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 chromosome

Total Repeats: 202529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019892	GCG	2	6	459528	459533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741359
10002	NC_019892	C	6	6	459578	459583	0 %	0 %	0 %	100 %	430741359
10003	NC_019892	AGC	2	6	459584	459589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741359
10004	NC_019892	G	8	8	459701	459708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_019892	GAT	2	6	459741	459746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_019892	TTA	2	6	459770	459775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_019892	GGA	2	6	459863	459868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_019892	GGC	2	6	459947	459952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741360
10009	NC_019892	GACAC	2	10	459968	459977	40 %	0 %	20 %	40 %	430741360
10010	NC_019892	TGT	2	6	460001	460006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741360
10011	NC_019892	GCC	2	6	460184	460189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741360
10012	NC_019892	CG	3	6	460241	460246	0 %	0 %	50 %	50 %	430741360
10013	NC_019892	TGG	2	6	460287	460292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741360
10014	NC_019892	CGG	2	6	460312	460317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741360
10015	NC_019892	CGG	3	9	460321	460329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741360
10016	NC_019892	CCT	2	6	460336	460341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741360
10017	NC_019892	CCAG	2	8	460375	460382	25 %	0 %	25 %	50 %	430741360
10018	NC_019892	GAC	2	6	460399	460404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741360
10019	NC_019892	TGC	2	6	460418	460423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741360
10020	NC_019892	CCTC	2	8	460455	460462	0 %	25 %	0 %	75 %	430741360
10021	NC_019892	CAG	2	6	460478	460483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741360
10022	NC_019892	GTT	2	6	460616	460621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741360
10023	NC_019892	ATG	2	6	460749	460754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741360
10024	NC_019892	CGG	2	6	460758	460763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741360
10025	NC_019892	GCT	2	6	460861	460866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741360
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10027	NC_019892	GC	3	6	460934	460939	0 %	0 %	50 %	50 %	430741360
10028	NC_019892	TCG	2	6	460953	460958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741360
10029	NC_019892	GTG	2	6	460960	460965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741360
10030	NC_019892	ACCG	2	8	461012	461019	25 %	0 %	25 %	50 %	430741360
10031	NC_019892	CCGA	2	8	461059	461066	25 %	0 %	25 %	50 %	430741360
10032	NC_019892	GGT	2	6	461077	461082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741360
10033	NC_019892	CGCGC	2	10	461099	461108	0 %	0 %	40 %	60 %	430741360
10034	NC_019892	AGG	2	6	461128	461133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741360
10035	NC_019892	GCC	2	6	461181	461186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741360
10036	NC_019892	CCA	2	6	461234	461239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741360
10037	NC_019892	TCC	2	6	461252	461257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741360
10038	NC_019892	GAC	2	6	461285	461290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741360
10039	NC_019892	CGA	2	6	461295	461300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741360
10040	NC_019892	G	7	7	461318	461324	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_019892	A	6	6	461333	461338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_019892	TGA	2	6	461408	461413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_019892	TGC	2	6	461416	461421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_019892	TCCC	2	8	461507	461514	0 %	25 %	0 %	75 %	430741361
10045	NC_019892	ATTG	2	8	461621	461628	25 %	50 %	25 %	0 %	430741361
10046	NC_019892	TCG	2	6	461629	461634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741361
10047	NC_019892	CAGC	2	8	461656	461663	25 %	0 %	25 %	50 %	430741361
10048	NC_019892	CCGG	2	8	461736	461743	0 %	0 %	50 %	50 %	430741361
10049	NC_019892	CGC	2	6	461759	461764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741361
10050	NC_019892	G	6	6	461770	461775	0 %	0 %	100 %	0 %	430741361
10051	NC_019892	TCG	2	6	461779	461784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741361
10052	NC_019892	CAA	2	6	461792	461797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430741361
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10054	NC_019892	TGG	2	6	461833	461838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741361
10055	NC_019892	ACG	2	6	461958	461963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741361
10056	NC_019892	GGC	2	6	461965	461970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741361
10057	NC_019892	CTGC	2	8	462017	462024	0 %	25 %	25 %	50 %	430741361
10058	NC_019892	CGC	2	6	462033	462038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741361
10059	NC_019892	CGA	2	6	462062	462067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741361
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10061	NC_019892	GAC	2	6	462093	462098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741361
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10063	NC_019892	CGCCGG	2	12	462185	462196	0 %	0 %	50 %	50 %	430741361
10064	NC_019892	TCG	2	6	462264	462269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741361
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10066	NC_019892	TCG	2	6	462533	462538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741361
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10068	NC_019892	GTC	2	6	462625	462630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741361
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10070	NC_019892	GCT	2	6	462676	462681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741361
10071	NC_019892	CGA	2	6	462701	462706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741361
10072	NC_019892	CTTG	2	8	462788	462795	0 %	50 %	25 %	25 %	430741361
10073	NC_019892	CCA	2	6	462811	462816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741361
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10075	NC_019892	ATCG	2	8	462897	462904	25 %	25 %	25 %	25 %	430741361
10076	NC_019892	CT	3	6	462913	462918	0 %	50 %	0 %	50 %	430741361
10077	NC_019892	GCG	2	6	463074	463079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741362
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10080	NC_019892	GC	3	6	463207	463212	0 %	0 %	50 %	50 %	430741362
10081	NC_019892	GGTCGT	2	12	463218	463229	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430741362
10082	NC_019892	CGA	2	6	463313	463318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741362
10083	NC_019892	GGCT	2	8	463330	463337	0 %	25 %	50 %	25 %	430741362
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10087	NC_019892	GAC	2	6	463500	463505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741362
10088	NC_019892	GGCC	2	8	463515	463522	0 %	0 %	50 %	50 %	430741362
10089	NC_019892	TC	3	6	463605	463610	0 %	50 %	0 %	50 %	430741362
10090	NC_019892	AAC	2	6	463720	463725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430741362
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10092	NC_019892	GA	3	6	463842	463847	50 %	0 %	50 %	0 %	430741362
10093	NC_019892	CGC	2	6	463848	463853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741362
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10102	NC_019892	AAG	3	9	464352	464360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741363
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10105	NC_019892	CCAC	2	8	464545	464552	25 %	0 %	0 %	75 %	430741363
10106	NC_019892	CCG	2	6	464558	464563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741363
10107	NC_019892	TGG	2	6	464565	464570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741363
10108	NC_019892	GAT	2	6	464688	464693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741363
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10110	NC_019892	GTT	2	6	464762	464767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741363
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10118	NC_019892	CCTG	3	12	465111	465122	0 %	25 %	25 %	50 %	430741364
10119	NC_019892	CCG	3	9	465131	465139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741364
10120	NC_019892	CGA	2	6	465147	465152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741364
10121	NC_019892	CGAC	2	8	465176	465183	25 %	0 %	25 %	50 %	430741364
10122	NC_019892	TCGC	2	8	465197	465204	0 %	25 %	25 %	50 %	430741364
10123	NC_019892	CGA	2	6	465240	465245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741364
10124	NC_019892	CGC	2	6	465264	465269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741364
10125	NC_019892	GAT	2	6	465313	465318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741364
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10218	NC_019892	GCT	2	6	469713	469718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741369
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10240	NC_019892	GCTC	2	8	470469	470476	0 %	25 %	25 %	50 %	430741369
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10242	NC_019892	ATG	2	6	470531	470536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741369
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10244	NC_019892	GCG	2	6	470612	470617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_019892	A	9	9	470644	470652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_019892	GAT	2	6	470721	470726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_019892	GAT	2	6	470749	470754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_019892	TTCTT	2	10	470849	470858	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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10362	NC_019892	CCCGG	2	10	477773	477782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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10496	NC_019892	GAC	2	6	489239	489244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741373
10497	NC_019892	CCGA	2	8	489264	489271	25 %	0 %	25 %	50 %	430741373
10498	NC_019892	GAC	2	6	489284	489289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741373
10499	NC_019892	G	6	6	489315	489320	0 %	0 %	100 %	0 %	430741373
10500	NC_019892	GTC	2	6	489347	489352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741373

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