MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02

Total Repeats: 2379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019749	ATC	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019749	CGAG	2	8	31	38	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019749	TCAA	2	8	101	108	50 %	25 %	0 %	25 %	434401064
4	NC_019749	AGG	2	6	111	116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401064
5	NC_019749	ACT	3	9	127	135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401064
6	NC_019749	CT	3	6	157	162	0 %	50 %	0 %	50 %	434401064
7	NC_019749	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434401064
8	NC_019749	CGATGC	2	12	186	197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434401064
9	NC_019749	AGT	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401064
10	NC_019749	GAA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401064
11	NC_019749	ATC	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401064
12	NC_019749	TGA	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401064
13	NC_019749	ACG	2	6	343	348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401064
14	NC_019749	CAG	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401064
15	NC_019749	GAG	2	6	461	466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401064
16	NC_019749	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	434401064
17	NC_019749	GCA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401064
18	NC_019749	AGA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401065
19	NC_019749	A	7	7	753	759	100 %	0 %	0 %	0 %	434401065
20	NC_019749	TTA	2	6	887	892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401065
21	NC_019749	CT	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	434401065
22	NC_019749	GGA	2	6	935	940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401065
23	NC_019749	GCT	3	9	953	961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401065
24	NC_019749	GACT	2	8	969	976	25 %	25 %	25 %	25 %	434401065
25	NC_019749	CGA	2	6	1006	1011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401065
26	NC_019749	TTC	2	6	1086	1091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401065
27	NC_019749	TCT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401065
28	NC_019749	TC	3	6	1131	1136	0 %	50 %	0 %	50 %	434401065
29	NC_019749	AAT	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401065
30	NC_019749	CTAAAG	2	12	1338	1349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434401065
31	NC_019749	GAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401065
32	NC_019749	CT	3	6	1391	1396	0 %	50 %	0 %	50 %	434401065
33	NC_019749	CTCCCT	2	12	1411	1422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401065
34	NC_019749	AGAA	2	8	1467	1474	75 %	0 %	25 %	0 %	434401065
35	NC_019749	AAC	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434401065
36	NC_019749	A	6	6	1543	1548	100 %	0 %	0 %	0 %	434401065
37	NC_019749	GAAA	2	8	1551	1558	75 %	0 %	25 %	0 %	434401065
38	NC_019749	AATT	2	8	1587	1594	50 %	50 %	0 %	0 %	434401065
39	NC_019749	AGA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401065
40	NC_019749	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401065
41	NC_019749	TTA	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019749	CGA	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401066
43	NC_019749	TG	3	6	1965	1970	0 %	50 %	50 %	0 %	434401066
44	NC_019749	AAG	2	6	1971	1976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401066
45	NC_019749	ATT	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401066
46	NC_019749	GCTT	2	8	2053	2060	0 %	50 %	25 %	25 %	434401066
47	NC_019749	AGC	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401066
48	NC_019749	CCT	2	6	2175	2180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401066
49	NC_019749	A	7	7	2234	2240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019749	AGA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019749	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019749	AGC	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401067
53	NC_019749	TTA	2	6	2446	2451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401067
54	NC_019749	GTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401067
55	NC_019749	TA	3	6	2570	2575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019749	CT	3	6	2576	2581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019749	AGCG	2	8	2605	2612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019749	ATT	2	6	2644	2649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401068
59	NC_019749	GTA	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401068
60	NC_019749	AATTAG	2	12	2718	2729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434401068
61	NC_019749	AAT	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401068
62	NC_019749	A	6	6	2777	2782	100 %	0 %	0 %	0 %	434401068
63	NC_019749	TTA	2	6	2792	2797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401068
64	NC_019749	A	6	6	2819	2824	100 %	0 %	0 %	0 %	434401068
65	NC_019749	GAAAA	2	10	2873	2882	80 %	0 %	20 %	0 %	434401068
66	NC_019749	TTA	2	6	2898	2903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401068
67	NC_019749	TA	3	6	2954	2959	50 %	50 %	0 %	0 %	434401068
68	NC_019749	GA	3	6	2994	2999	50 %	0 %	50 %	0 %	434401068
69	NC_019749	AG	3	6	3050	3055	50 %	0 %	50 %	0 %	434401068
70	NC_019749	AGA	2	6	3097	3102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401068
71	NC_019749	TAT	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401068
72	NC_019749	A	6	6	3132	3137	100 %	0 %	0 %	0 %	434401068
73	NC_019749	ATG	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401068
74	NC_019749	A	6	6	3176	3181	100 %	0 %	0 %	0 %	434401068
75	NC_019749	T	6	6	3322	3327	0 %	100 %	0 %	0 %	434401068
76	NC_019749	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	434401068
77	NC_019749	TTG	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401068
78	NC_019749	TGA	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401068
79	NC_019749	TAAT	2	8	3410	3417	50 %	50 %	0 %	0 %	434401068
80	NC_019749	T	6	6	3431	3436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019749	TC	3	6	3440	3445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019749	A	6	6	3500	3505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019749	AAAC	2	8	3536	3543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019749	ATA	2	6	3549	3554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019749	AGA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019749	CTT	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401069
87	NC_019749	TTA	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401069
88	NC_019749	TGC	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401069
89	NC_019749	CTT	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401069
90	NC_019749	TCA	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401069
91	NC_019749	AAT	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401069
92	NC_019749	TTG	2	6	3907	3912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401069
93	NC_019749	GTA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401069
94	NC_019749	ACG	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401069
95	NC_019749	AATC	2	8	4122	4129	50 %	25 %	0 %	25 %	434401069
96	NC_019749	AGC	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401069
97	NC_019749	CAT	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401069
98	NC_019749	ACTCC	2	10	4234	4243	20 %	20 %	0 %	60 %	434401069
99	NC_019749	ACAA	2	8	4264	4271	75 %	0 %	0 %	25 %	434401069
100	NC_019749	GAC	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019749	AAC	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434401070
102	NC_019749	ATT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401070
103	NC_019749	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401070
104	NC_019749	AT	3	6	4475	4480	50 %	50 %	0 %	0 %	434401070
105	NC_019749	CTC	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401070
106	NC_019749	G	6	6	4621	4626	0 %	0 %	100 %	0 %	434401070
107	NC_019749	C	6	6	4638	4643	0 %	0 %	0 %	100 %	434401070
108	NC_019749	ATT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401070
109	NC_019749	TCA	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401070
110	NC_019749	CAT	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401070
111	NC_019749	C	6	6	4716	4721	0 %	0 %	0 %	100 %	434401070
112	NC_019749	C	6	6	4736	4741	0 %	0 %	0 %	100 %	434401070
113	NC_019749	T	6	6	4768	4773	0 %	100 %	0 %	0 %	434401070
114	NC_019749	CTT	2	6	4886	4891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401070
115	NC_019749	TA	4	8	4907	4914	50 %	50 %	0 %	0 %	434401070
116	NC_019749	TAAGG	2	10	4945	4954	40 %	20 %	40 %	0 %	434401070
117	NC_019749	G	6	6	4966	4971	0 %	0 %	100 %	0 %	434401070
118	NC_019749	TTTA	2	8	4996	5003	25 %	75 %	0 %	0 %	434401070
119	NC_019749	ACT	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401070
120	NC_019749	CAG	2	6	5044	5049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401070
121	NC_019749	ATC	2	6	5071	5076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401070
122	NC_019749	GTT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401070
123	NC_019749	CTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401070
124	NC_019749	CTTT	2	8	5199	5206	0 %	75 %	0 %	25 %	434401070
125	NC_019749	C	6	6	5231	5236	0 %	0 %	0 %	100 %	434401070
126	NC_019749	TTC	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401070
127	NC_019749	GAA	2	6	5366	5371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401070
128	NC_019749	AGT	2	6	5470	5475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401070
129	NC_019749	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401071
130	NC_019749	AGC	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401071
131	NC_019749	AAT	2	6	5704	5709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401071
132	NC_019749	TGA	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401071
133	NC_019749	ATC	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401071
134	NC_019749	AAAAC	2	10	5729	5738	80 %	0 %	0 %	20 %	434401071
135	NC_019749	TCA	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401071
136	NC_019749	CTC	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401071
137	NC_019749	CTT	2	6	5821	5826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401071
138	NC_019749	TGG	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401071
139	NC_019749	CAATC	2	10	5893	5902	40 %	20 %	0 %	40 %	434401071
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142	NC_019749	TC	3	6	6132	6137	0 %	50 %	0 %	50 %	434401071
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242	NC_019749	A	6	6	11122	11127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_019749	GAA	2	6	11204	11209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_019749	GTTT	2	8	11501	11508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019749	TAT	2	6	11533	11538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019749	T	7	7	11644	11650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019749	ATCG	2	8	11670	11677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
255	NC_019749	AGC	2	6	11791	11796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_019749	ATG	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019749	AG	4	8	11823	11830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
258	NC_019749	A	8	8	11837	11844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_019749	TGC	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_019749	TTAAT	2	10	11875	11884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019749	CTA	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_019749	CCT	2	6	11974	11979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401077
263	NC_019749	TGA	2	6	11985	11990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401077
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265	NC_019749	AAT	2	6	12073	12078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401077
266	NC_019749	GCCAA	2	10	12101	12110	40 %	0 %	20 %	40 %	434401077
267	NC_019749	AAT	2	6	12135	12140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401077
268	NC_019749	CTTT	2	8	12278	12285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
269	NC_019749	ATTA	2	8	12322	12329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019749	GATA	2	8	12332	12339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019749	AGG	2	6	12344	12349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019749	ATA	2	6	12616	12621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401078
273	NC_019749	AAC	2	6	12666	12671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434401078
274	NC_019749	T	7	7	12774	12780	0 %	100 %	0 %	0 %	434401078
275	NC_019749	TAT	2	6	12806	12811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401078
276	NC_019749	TC	4	8	12851	12858	0 %	50 %	0 %	50 %	434401078
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278	NC_019749	TTAATT	2	12	12928	12939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_019749	TGG	2	6	13140	13145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_019749	T	8	8	18891	18898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_019749	CAT	3	9	18969	18977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401083
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401	NC_019749	ATT	2	6	19105	19110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401083
402	NC_019749	AGG	2	6	19228	19233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401083
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404	NC_019749	TCTT	2	8	19259	19266	0 %	75 %	0 %	25 %	434401083
405	NC_019749	TCTTG	2	10	19268	19277	0 %	60 %	20 %	20 %	434401083
406	NC_019749	TAGC	2	8	19311	19318	25 %	25 %	25 %	25 %	434401083
407	NC_019749	CAAAA	2	10	19338	19347	80 %	0 %	0 %	20 %	434401083
408	NC_019749	TTC	2	6	19410	19415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401083
409	NC_019749	CAT	2	6	19452	19457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401083
410	NC_019749	TAC	3	9	19476	19484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401083
411	NC_019749	A	7	7	19492	19498	100 %	0 %	0 %	0 %	434401083
412	NC_019749	AAT	2	6	19509	19514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401083
413	NC_019749	TAC	2	6	19567	19572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401083
414	NC_019749	T	6	6	19585	19590	0 %	100 %	0 %	0 %	434401083
415	NC_019749	T	6	6	19632	19637	0 %	100 %	0 %	0 %	434401083
416	NC_019749	TCT	2	6	19652	19657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401083
417	NC_019749	GAG	2	6	19677	19682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401083
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423	NC_019749	T	7	7	19875	19881	0 %	100 %	0 %	0 %	434401083
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430	NC_019749	TTC	2	6	20133	20138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401083
431	NC_019749	TGG	2	6	20155	20160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401083
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435	NC_019749	TGC	2	6	20210	20215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401083
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439	NC_019749	AAT	2	6	20340	20345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401083
440	NC_019749	T	6	6	20377	20382	0 %	100 %	0 %	0 %	434401083
441	NC_019749	ATA	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401083
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443	NC_019749	T	6	6	20444	20449	0 %	100 %	0 %	0 %	434401083
444	NC_019749	TGG	2	6	20467	20472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401083
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451	NC_019749	AT	3	6	20636	20641	50 %	50 %	0 %	0 %	434401083
452	NC_019749	TTTG	2	8	20651	20658	0 %	75 %	25 %	0 %	434401083
453	NC_019749	T	6	6	20675	20680	0 %	100 %	0 %	0 %	434401083
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500	NC_019749	AGA	2	6	23086	23091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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