MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_019702	GTCT	2	8	2530617	2530624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44002	NC_019702	GA	3	6	2530709	2530714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_019702	AACA	2	8	2530829	2530836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44004	NC_019702	CAA	2	6	2530904	2530909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44005	NC_019702	CAA	2	6	2530916	2530921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44006	NC_019702	T	6	6	2530968	2530973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44007	NC_019702	T	8	8	2531021	2531028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44008	NC_019702	AGC	2	6	2531144	2531149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44009	NC_019702	TAATT	2	10	2531161	2531170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44010	NC_019702	GTTTT	2	10	2531239	2531248	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44011	NC_019702	T	6	6	2531245	2531250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44012	NC_019702	T	7	7	2531339	2531345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44013	NC_019702	ATC	2	6	2531495	2531500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44014	NC_019702	TC	3	6	2531536	2531541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44015	NC_019702	GAT	2	6	2531703	2531708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_019702	CTG	2	6	2531765	2531770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44017	NC_019702	TG	3	6	2531815	2531820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44018	NC_019702	GAA	2	6	2531866	2531871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44019	NC_019702	ATTG	2	8	2531879	2531886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44020	NC_019702	TTC	2	6	2531915	2531920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44021	NC_019702	CAA	2	6	2531928	2531933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44022	NC_019702	GATA	2	8	2531973	2531980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44023	NC_019702	TAT	2	6	2531986	2531991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44024	NC_019702	CAC	2	6	2532132	2532137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44025	NC_019702	AAC	2	6	2532141	2532146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44026	NC_019702	TAC	2	6	2532219	2532224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44027	NC_019702	TAT	2	6	2532227	2532232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44028	NC_019702	TGA	2	6	2532344	2532349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222490
44029	NC_019702	A	6	6	2532402	2532407	100 %	0 %	0 %	0 %	428222490
44030	NC_019702	GAA	2	6	2532408	2532413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222490
44031	NC_019702	ACC	2	6	2532416	2532421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222490
44032	NC_019702	GA	3	6	2532437	2532442	50 %	0 %	50 %	0 %	428222490
44033	NC_019702	GAA	2	6	2532516	2532521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222490
44034	NC_019702	GCG	3	9	2532559	2532567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222490
44035	NC_019702	A	7	7	2532685	2532691	100 %	0 %	0 %	0 %	428222490
44036	NC_019702	CTAA	2	8	2532694	2532701	50 %	25 %	0 %	25 %	428222490
44037	NC_019702	TCAA	2	8	2532720	2532727	50 %	25 %	0 %	25 %	428222491
44038	NC_019702	TGG	2	6	2532867	2532872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222491
44039	NC_019702	ATC	2	6	2532956	2532961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222491
44040	NC_019702	GGA	2	6	2532996	2533001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222491
44041	NC_019702	CAAT	2	8	2533028	2533035	50 %	25 %	0 %	25 %	428222491
44042	NC_019702	AAT	3	9	2533033	2533041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222491
44043	NC_019702	ATA	2	6	2533256	2533261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222491
44044	NC_019702	ACCCAA	2	12	2533453	2533464	50 %	0 %	0 %	50 %	428222491
44045	NC_019702	CAT	2	6	2533598	2533603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222491
44046	NC_019702	CAA	2	6	2533630	2533635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222491
44047	NC_019702	AAGT	2	8	2533743	2533750	50 %	25 %	25 %	0 %	428222491
44048	NC_019702	ATT	2	6	2533879	2533884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44049	NC_019702	GGT	2	6	2533981	2533986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44050	NC_019702	T	8	8	2534104	2534111	0 %	100 %	0 %	0 %	428222492
44051	NC_019702	GAT	2	6	2534175	2534180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222492
44052	NC_019702	CGCC	2	8	2534312	2534319	0 %	0 %	25 %	75 %	428222492
44053	NC_019702	GA	3	6	2534487	2534492	50 %	0 %	50 %	0 %	428222492
44054	NC_019702	TAG	2	6	2534510	2534515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222492
44055	NC_019702	TTGA	2	8	2534544	2534551	25 %	50 %	25 %	0 %	428222492
44056	NC_019702	CAG	2	6	2534567	2534572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222492
44057	NC_019702	TCC	2	6	2534685	2534690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222492
44058	NC_019702	GTA	2	6	2534696	2534701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222492
44059	NC_019702	ATA	2	6	2534706	2534711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222492
44060	NC_019702	CCA	2	6	2534716	2534721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222492
44061	NC_019702	CTTT	2	8	2534890	2534897	0 %	75 %	0 %	25 %	428222492
44062	NC_019702	ATT	2	6	2534976	2534981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222492
44063	NC_019702	CGCAC	2	10	2535019	2535028	20 %	0 %	20 %	60 %	428222492
44064	NC_019702	TAA	2	6	2535029	2535034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222492
44065	NC_019702	TCT	2	6	2535080	2535085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222492
44066	NC_019702	CTG	2	6	2535198	2535203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222492
44067	NC_019702	TC	3	6	2535321	2535326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44068	NC_019702	TAA	2	6	2535393	2535398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44069	NC_019702	A	6	6	2535489	2535494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44070	NC_019702	TGC	2	6	2535508	2535513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44071	NC_019702	TATG	2	8	2535514	2535521	25 %	50 %	25 %	0 %	428222493
44072	NC_019702	CTG	2	6	2535525	2535530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222493
44073	NC_019702	AGCC	2	8	2535537	2535544	25 %	0 %	25 %	50 %	428222493
44074	NC_019702	TGC	2	6	2535596	2535601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222493
44075	NC_019702	CAA	2	6	2535620	2535625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222493
44076	NC_019702	TGG	2	6	2535628	2535633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222493
44077	NC_019702	A	7	7	2535647	2535653	100 %	0 %	0 %	0 %	428222493
44078	NC_019702	ATGCC	2	10	2535721	2535730	20 %	20 %	20 %	40 %	428222493
44079	NC_019702	TGA	2	6	2535755	2535760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222493
44080	NC_019702	GAA	2	6	2535809	2535814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222493
44081	NC_019702	GTAG	2	8	2535818	2535825	25 %	25 %	50 %	0 %	428222493
44082	NC_019702	T	7	7	2535903	2535909	0 %	100 %	0 %	0 %	428222494
44083	NC_019702	CTG	2	6	2535910	2535915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222494
44084	NC_019702	TTC	2	6	2535935	2535940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222494
44085	NC_019702	TAG	2	6	2535941	2535946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222494
44086	NC_019702	CTAA	2	8	2535987	2535994	50 %	25 %	0 %	25 %	428222494
44087	NC_019702	CTG	2	6	2536003	2536008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222494
44088	NC_019702	ACCTGC	2	12	2536084	2536095	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428222494
44089	NC_019702	TCC	2	6	2536158	2536163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222494
44090	NC_019702	CTA	2	6	2536259	2536264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222494
44091	NC_019702	AT	3	6	2536371	2536376	50 %	50 %	0 %	0 %	428222494
44092	NC_019702	ACTT	2	8	2536392	2536399	25 %	50 %	0 %	25 %	428222494
44093	NC_019702	GCC	2	6	2536419	2536424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222494
44094	NC_019702	ATC	2	6	2536456	2536461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222494
44095	NC_019702	TGC	3	9	2536520	2536528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222494
44096	NC_019702	A	7	7	2536613	2536619	100 %	0 %	0 %	0 %	428222494
44097	NC_019702	TGC	3	9	2536643	2536651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222494
44098	NC_019702	ACT	2	6	2536728	2536733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222494
44099	NC_019702	GATTGT	2	12	2536763	2536774	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428222495
44100	NC_019702	A	6	6	2536784	2536789	100 %	0 %	0 %	0 %	428222495
44101	NC_019702	TGT	2	6	2536862	2536867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222495
44102	NC_019702	ACTG	2	8	2536911	2536918	25 %	25 %	25 %	25 %	428222495
44103	NC_019702	TTG	3	9	2537011	2537019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222495
44104	NC_019702	CTG	2	6	2537023	2537028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222495
44105	NC_019702	ATTT	2	8	2537031	2537038	25 %	75 %	0 %	0 %	428222495
44106	NC_019702	GCT	2	6	2537100	2537105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222495
44107	NC_019702	GATT	2	8	2537123	2537130	25 %	50 %	25 %	0 %	428222495
44108	NC_019702	GAT	2	6	2537141	2537146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222495
44109	NC_019702	TGG	2	6	2537160	2537165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222495
44110	NC_019702	TGC	2	6	2537185	2537190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222495
44111	NC_019702	TTG	2	6	2537196	2537201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222495
44112	NC_019702	GTTG	2	8	2537217	2537224	0 %	50 %	50 %	0 %	428222495
44113	NC_019702	ACT	2	6	2537257	2537262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222495
44114	NC_019702	CCG	2	6	2537337	2537342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222495
44115	NC_019702	TAA	2	6	2537373	2537378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222495
44116	NC_019702	TAC	2	6	2537430	2537435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222495
44117	NC_019702	GGAAC	2	10	2537449	2537458	40 %	0 %	40 %	20 %	428222495
44118	NC_019702	CAA	2	6	2537486	2537491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44120	NC_019702	TAG	2	6	2537551	2537556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44343	NC_019702	A	6	6	2549422	2549427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44344	NC_019702	ATTT	2	8	2549463	2549470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44345	NC_019702	TCT	2	6	2549507	2549512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44351	NC_019702	TCC	2	6	2549986	2549991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222506
44352	NC_019702	ATC	2	6	2550015	2550020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222506
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44354	NC_019702	T	6	6	2550104	2550109	0 %	100 %	0 %	0 %	428222506
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44471	NC_019702	AGC	2	6	2557280	2557285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222514
44472	NC_019702	ATTA	2	8	2557703	2557710	50 %	50 %	0 %	0 %	428222514
44473	NC_019702	TTA	2	6	2557722	2557727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222514
44474	NC_019702	AATT	2	8	2557735	2557742	50 %	50 %	0 %	0 %	428222514
44475	NC_019702	ATTA	2	8	2557841	2557848	50 %	50 %	0 %	0 %	428222514
44476	NC_019702	CCTG	2	8	2557884	2557891	0 %	25 %	25 %	50 %	428222514
44477	NC_019702	ACT	2	6	2557908	2557913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222514
44478	NC_019702	AAAT	2	8	2557926	2557933	75 %	25 %	0 %	0 %	428222514
44479	NC_019702	GT	3	6	2557998	2558003	0 %	50 %	50 %	0 %	428222514
44480	NC_019702	AATT	2	8	2558012	2558019	50 %	50 %	0 %	0 %	428222514
44481	NC_019702	ACA	2	6	2558049	2558054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222514
44482	NC_019702	T	6	6	2558077	2558082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44483	NC_019702	GTC	2	6	2558137	2558142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44484	NC_019702	T	7	7	2558269	2558275	0 %	100 %	0 %	0 %	428222515
44485	NC_019702	GGTTT	2	10	2558278	2558287	0 %	60 %	40 %	0 %	428222515
44486	NC_019702	AAT	2	6	2558288	2558293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222515
44487	NC_019702	ATC	2	6	2558383	2558388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222515
44488	NC_019702	TAC	2	6	2558416	2558421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222515
44489	NC_019702	AGATT	2	10	2558424	2558433	40 %	40 %	20 %	0 %	428222515
44490	NC_019702	GGC	2	6	2558550	2558555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222515
44491	NC_019702	TTC	2	6	2558593	2558598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222515
44492	NC_019702	GGT	2	6	2558672	2558677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44493	NC_019702	AT	3	6	2558705	2558710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44494	NC_019702	TCC	2	6	2558779	2558784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44495	NC_019702	ATC	2	6	2558860	2558865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222516
44496	NC_019702	ATG	2	6	2558989	2558994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222516
44497	NC_019702	A	6	6	2559018	2559023	100 %	0 %	0 %	0 %	428222516
44498	NC_019702	AGA	2	6	2559041	2559046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222516
44499	NC_019702	A	6	6	2559054	2559059	100 %	0 %	0 %	0 %	428222516
44500	NC_019702	GGT	2	6	2559156	2559161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222516

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