MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_019702	ACTC	2	8	2502235	2502242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43502	NC_019702	ATAGAT	2	12	2502247	2502258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43503	NC_019702	ATTAG	2	10	2502276	2502285	40 %	40 %	20 %	0 %	428222465
43504	NC_019702	CTT	2	6	2502302	2502307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222465
43505	NC_019702	GGC	2	6	2502314	2502319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222465
43506	NC_019702	AAC	2	6	2502421	2502426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222465
43507	NC_019702	TGC	2	6	2502475	2502480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222465
43508	NC_019702	CTT	2	6	2502510	2502515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222465
43509	NC_019702	TGA	2	6	2502535	2502540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222465
43510	NC_019702	TGC	2	6	2502713	2502718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222465
43511	NC_019702	GC	3	6	2502717	2502722	0 %	0 %	50 %	50 %	428222465
43512	NC_019702	T	6	6	2502861	2502866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_019702	AACT	2	8	2502873	2502880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43514	NC_019702	TAAT	2	8	2502940	2502947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_019702	CG	3	6	2503028	2503033	0 %	0 %	50 %	50 %	428222466
43516	NC_019702	ATG	2	6	2503109	2503114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222466
43517	NC_019702	TGC	2	6	2503329	2503334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222466
43518	NC_019702	ATG	2	6	2503370	2503375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222466
43519	NC_019702	GTT	2	6	2503408	2503413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222466
43520	NC_019702	TTG	2	6	2503481	2503486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222466
43521	NC_019702	CAT	2	6	2503601	2503606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222466
43522	NC_019702	T	6	6	2503613	2503618	0 %	100 %	0 %	0 %	428222466
43523	NC_019702	AAGC	2	8	2503708	2503715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43524	NC_019702	AC	3	6	2503781	2503786	50 %	0 %	0 %	50 %	428222467
43525	NC_019702	AGGC	2	8	2503880	2503887	25 %	0 %	50 %	25 %	428222467
43526	NC_019702	A	6	6	2503888	2503893	100 %	0 %	0 %	0 %	428222467
43527	NC_019702	CTT	2	6	2503929	2503934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222467
43528	NC_019702	A	6	6	2504079	2504084	100 %	0 %	0 %	0 %	428222467
43529	NC_019702	GATG	2	8	2504092	2504099	25 %	25 %	50 %	0 %	428222467
43530	NC_019702	ATCG	2	8	2504164	2504171	25 %	25 %	25 %	25 %	428222467
43531	NC_019702	GGACTT	2	12	2504176	2504187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428222467
43532	NC_019702	TCT	2	6	2504195	2504200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222467
43533	NC_019702	TTAA	2	8	2504375	2504382	50 %	50 %	0 %	0 %	428222467
43534	NC_019702	A	6	6	2504426	2504431	100 %	0 %	0 %	0 %	428222467
43535	NC_019702	TAA	2	6	2504445	2504450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222467
43536	NC_019702	CGG	2	6	2504460	2504465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222467
43537	NC_019702	AAT	2	6	2504486	2504491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222467
43538	NC_019702	CT	3	6	2504521	2504526	0 %	50 %	0 %	50 %	428222467
43539	NC_019702	ATT	2	6	2504536	2504541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222467
43540	NC_019702	CAG	2	6	2504553	2504558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222467
43541	NC_019702	AT	3	6	2504561	2504566	50 %	50 %	0 %	0 %	428222467
43542	NC_019702	CTAAAA	2	12	2504724	2504735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428222467
43543	NC_019702	CAG	2	6	2504751	2504756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222467
43544	NC_019702	GCT	2	6	2504777	2504782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222467
43545	NC_019702	TGTA	2	8	2504920	2504927	25 %	50 %	25 %	0 %	428222467
43546	NC_019702	ACCGC	2	10	2504928	2504937	20 %	0 %	20 %	60 %	428222467
43547	NC_019702	CCA	2	6	2505012	2505017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222467
43548	NC_019702	GAC	2	6	2505021	2505026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222467
43549	NC_019702	ATG	2	6	2505074	2505079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222467
43550	NC_019702	AT	3	6	2505103	2505108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43551	NC_019702	TCA	2	6	2505118	2505123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43552	NC_019702	T	6	6	2505141	2505146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43553	NC_019702	TATG	2	8	2505189	2505196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43554	NC_019702	AG	3	6	2505200	2505205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43555	NC_019702	TTC	2	6	2505216	2505221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43556	NC_019702	TAA	2	6	2505256	2505261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43557	NC_019702	AGA	2	6	2505306	2505311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43558	NC_019702	AAAT	2	8	2505328	2505335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43559	NC_019702	CTG	2	6	2505410	2505415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43560	NC_019702	CAC	2	6	2505422	2505427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43561	NC_019702	ATC	2	6	2505494	2505499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43562	NC_019702	ATC	2	6	2505511	2505516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222468
43563	NC_019702	CAT	2	6	2505631	2505636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222468
43564	NC_019702	T	7	7	2505691	2505697	0 %	100 %	0 %	0 %	428222468
43565	NC_019702	GTT	2	6	2505706	2505711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222468
43566	NC_019702	CGC	2	6	2505731	2505736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222468
43567	NC_019702	TAA	2	6	2506102	2506107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222468
43568	NC_019702	TTC	2	6	2506120	2506125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222468
43569	NC_019702	GGA	2	6	2506142	2506147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222468
43570	NC_019702	CGG	2	6	2506203	2506208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222468
43571	NC_019702	TGA	2	6	2506257	2506262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222468
43572	NC_019702	TTC	2	6	2506286	2506291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222468
43573	NC_019702	AGA	2	6	2506328	2506333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222468
43574	NC_019702	GGA	2	6	2506336	2506341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222468
43575	NC_019702	CAC	2	6	2506351	2506356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222468
43576	NC_019702	TAA	2	6	2506363	2506368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222468
43577	NC_019702	ACC	2	6	2506382	2506387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222468
43578	NC_019702	AGC	2	6	2506433	2506438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222468
43579	NC_019702	ACA	2	6	2506512	2506517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222468
43580	NC_019702	AGT	2	6	2506544	2506549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222468
43581	NC_019702	TTACCC	2	12	2506626	2506637	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428222468
43582	NC_019702	CTG	2	6	2506666	2506671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222468
43583	NC_019702	GCG	2	6	2506731	2506736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222468
43584	NC_019702	TGG	2	6	2506759	2506764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222468
43585	NC_019702	TTG	2	6	2506793	2506798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222468
43586	NC_019702	AATG	2	8	2506810	2506817	50 %	25 %	25 %	0 %	428222468
43587	NC_019702	GCC	2	6	2506829	2506834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222468
43588	NC_019702	ATA	3	9	2506884	2506892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222468
43589	NC_019702	CCA	2	6	2506982	2506987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222468
43590	NC_019702	CCA	3	9	2507079	2507087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222468
43591	NC_019702	CTT	2	6	2507095	2507100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222468
43592	NC_019702	GGT	2	6	2507108	2507113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222468
43593	NC_019702	ATTC	2	8	2507207	2507214	25 %	50 %	0 %	25 %	428222468
43594	NC_019702	T	6	6	2507291	2507296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43595	NC_019702	AAGA	2	8	2507298	2507305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43596	NC_019702	TCA	2	6	2507430	2507435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222469
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43598	NC_019702	CAG	2	6	2507449	2507454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222469
43599	NC_019702	ACT	2	6	2507490	2507495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222469
43600	NC_019702	ATA	2	6	2507579	2507584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222469
43601	NC_019702	GCA	2	6	2507595	2507600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222469
43602	NC_019702	AAT	2	6	2507711	2507716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222470
43603	NC_019702	GTT	2	6	2507781	2507786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222470
43604	NC_019702	AGC	2	6	2507897	2507902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222470
43605	NC_019702	CGG	2	6	2507920	2507925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222470
43606	NC_019702	TAA	2	6	2508095	2508100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222470
43607	NC_019702	T	6	6	2508157	2508162	0 %	100 %	0 %	0 %	428222470
43608	NC_019702	GAC	2	6	2508172	2508177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222470
43609	NC_019702	ATC	2	6	2508185	2508190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222470
43610	NC_019702	TCCC	2	8	2508343	2508350	0 %	25 %	0 %	75 %	428222470
43611	NC_019702	GCA	2	6	2508381	2508386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222470
43612	NC_019702	ATC	2	6	2508389	2508394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222470
43613	NC_019702	GA	3	6	2508427	2508432	50 %	0 %	50 %	0 %	428222470
43614	NC_019702	GGCAAC	2	12	2508599	2508610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222470
43615	NC_019702	CAT	3	9	2508616	2508624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222470
43616	NC_019702	CCAATT	2	12	2508652	2508663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222470
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43618	NC_019702	CAT	2	6	2508817	2508822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222470
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43969	NC_019702	CTTT	2	8	2528858	2528865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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43979	NC_019702	TAA	2	6	2529355	2529360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43980	NC_019702	TAA	2	6	2529367	2529372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43981	NC_019702	GGAT	2	8	2529386	2529393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43982	NC_019702	A	6	6	2529412	2529417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43983	NC_019702	GCA	2	6	2529449	2529454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43984	NC_019702	CAA	2	6	2529522	2529527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43985	NC_019702	TAA	2	6	2529532	2529537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43986	NC_019702	AAAATC	2	12	2529562	2529573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43987	NC_019702	TGA	2	6	2529658	2529663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43988	NC_019702	GA	3	6	2529662	2529667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43989	NC_019702	CATCG	2	10	2529718	2529727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43990	NC_019702	CGAG	2	8	2529788	2529795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43991	NC_019702	AT	4	8	2529890	2529897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43992	NC_019702	TAT	2	6	2529915	2529920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43993	NC_019702	ATG	2	6	2529932	2529937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43996	NC_019702	TGCA	2	8	2530196	2530203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43997	NC_019702	A	8	8	2530221	2530228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43998	NC_019702	ATC	2	6	2530247	2530252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43999	NC_019702	CTTT	2	8	2530371	2530378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44000	NC_019702	GAC	2	6	2530522	2530527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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