MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_019702	GGT	2	6	1132069	1132074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221188
19502	NC_019702	GCA	2	6	1132117	1132122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221188
19503	NC_019702	GC	3	6	1132137	1132142	0 %	0 %	50 %	50 %	428221188
19504	NC_019702	ATT	2	6	1132144	1132149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221188
19505	NC_019702	AAT	2	6	1132185	1132190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221188
19506	NC_019702	ATT	2	6	1132216	1132221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221188
19507	NC_019702	AAGG	2	8	1132249	1132256	50 %	0 %	50 %	0 %	428221188
19508	NC_019702	AAT	2	6	1132270	1132275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221188
19509	NC_019702	CTCCC	2	10	1132325	1132334	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19510	NC_019702	AAACC	2	10	1132486	1132495	60 %	0 %	0 %	40 %	428221189
19511	NC_019702	GAT	2	6	1132535	1132540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221189
19512	NC_019702	ACC	2	6	1132592	1132597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221189
19513	NC_019702	TGCGG	2	10	1132600	1132609	0 %	20 %	60 %	20 %	428221189
19514	NC_019702	CTAT	2	8	1132623	1132630	25 %	50 %	0 %	25 %	428221189
19515	NC_019702	CCG	3	9	1132783	1132791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221189
19516	NC_019702	TGA	2	6	1132832	1132837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_019702	CAA	2	6	1132868	1132873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221190
19518	NC_019702	T	6	6	1132898	1132903	0 %	100 %	0 %	0 %	428221190
19519	NC_019702	ACT	2	6	1132992	1132997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221190
19520	NC_019702	CAAA	2	8	1133022	1133029	75 %	0 %	0 %	25 %	428221190
19521	NC_019702	ACA	2	6	1133049	1133054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221190
19522	NC_019702	AT	3	6	1133065	1133070	50 %	50 %	0 %	0 %	428221190
19523	NC_019702	CTA	2	6	1133108	1133113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221190
19524	NC_019702	GAT	2	6	1133156	1133161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221190
19525	NC_019702	CTA	2	6	1133173	1133178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221190
19526	NC_019702	TTA	2	6	1133185	1133190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221190
19527	NC_019702	AAG	2	6	1133301	1133306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221190
19528	NC_019702	TAT	2	6	1133307	1133312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221190
19529	NC_019702	GAT	2	6	1133354	1133359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221190
19530	NC_019702	AGA	2	6	1133400	1133405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221190
19531	NC_019702	CAA	2	6	1133444	1133449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221190
19532	NC_019702	TGG	2	6	1133459	1133464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221190
19533	NC_019702	TTAAA	2	10	1133476	1133485	60 %	40 %	0 %	0 %	428221190
19534	NC_019702	AATT	2	8	1133548	1133555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_019702	ATT	2	6	1133649	1133654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221191
19536	NC_019702	AGG	2	6	1133657	1133662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221191
19537	NC_019702	TTTA	2	8	1133717	1133724	25 %	75 %	0 %	0 %	428221191
19538	NC_019702	TCT	2	6	1133775	1133780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221191
19539	NC_019702	GCCATC	2	12	1133936	1133947	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428221191
19540	NC_019702	ACC	2	6	1133958	1133963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221191
19541	NC_019702	CGATTA	2	12	1134153	1134164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428221191
19542	NC_019702	TTA	2	6	1134177	1134182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221191
19543	NC_019702	C	6	6	1134188	1134193	0 %	0 %	0 %	100 %	428221191
19544	NC_019702	ACC	2	6	1134197	1134202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221191
19545	NC_019702	TTAA	2	8	1134294	1134301	50 %	50 %	0 %	0 %	428221191
19546	NC_019702	ATC	2	6	1134404	1134409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221191
19547	NC_019702	AAT	2	6	1134419	1134424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221191
19548	NC_019702	GCC	2	6	1134431	1134436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221191
19549	NC_019702	ACC	2	6	1134440	1134445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221191
19550	NC_019702	ACC	2	6	1134449	1134454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221191
19551	NC_019702	CCT	2	6	1134462	1134467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221191
19552	NC_019702	ATTGC	2	10	1134553	1134562	20 %	40 %	20 %	20 %	428221191
19553	NC_019702	ACT	2	6	1134631	1134636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221192
19554	NC_019702	CTT	2	6	1134743	1134748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221192
19555	NC_019702	CAG	2	6	1134795	1134800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221192
19556	NC_019702	TA	3	6	1134870	1134875	50 %	50 %	0 %	0 %	428221192
19557	NC_019702	CTAA	2	8	1134914	1134921	50 %	25 %	0 %	25 %	428221192
19558	NC_019702	CCACA	2	10	1134943	1134952	40 %	0 %	0 %	60 %	428221192
19559	NC_019702	CA	3	6	1134955	1134960	50 %	0 %	0 %	50 %	428221192
19560	NC_019702	ATA	2	6	1135007	1135012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221192
19561	NC_019702	TCA	2	6	1135023	1135028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221192
19562	NC_019702	TCAA	2	8	1135035	1135042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19563	NC_019702	AATC	2	8	1135046	1135053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19564	NC_019702	ATTT	2	8	1135087	1135094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19565	NC_019702	TTAAA	2	10	1135196	1135205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_019702	TAT	2	6	1135218	1135223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19567	NC_019702	GTTTA	2	10	1135297	1135306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19568	NC_019702	ATT	2	6	1135368	1135373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221193
19569	NC_019702	TAG	2	6	1135386	1135391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221193
19570	NC_019702	T	6	6	1135424	1135429	0 %	100 %	0 %	0 %	428221193
19571	NC_019702	AGT	2	6	1135445	1135450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221193
19572	NC_019702	GCA	2	6	1135568	1135573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221193
19573	NC_019702	GCA	3	9	1135588	1135596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221193
19574	NC_019702	ATA	3	9	1135635	1135643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221193
19575	NC_019702	ATA	2	6	1135710	1135715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221193
19576	NC_019702	GA	3	6	1135821	1135826	50 %	0 %	50 %	0 %	428221193
19577	NC_019702	CCG	2	6	1135851	1135856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221193
19578	NC_019702	TTA	2	6	1135899	1135904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19579	NC_019702	ACT	2	6	1135911	1135916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221194
19580	NC_019702	TCT	2	6	1136000	1136005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221194
19581	NC_019702	CTTT	2	8	1136098	1136105	0 %	75 %	0 %	25 %	428221194
19582	NC_019702	TATT	2	8	1136160	1136167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19583	NC_019702	A	7	7	1136239	1136245	100 %	0 %	0 %	0 %	428221195
19584	NC_019702	CTA	2	6	1136246	1136251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221195
19585	NC_019702	TGG	2	6	1136293	1136298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221195
19586	NC_019702	ATA	2	6	1136361	1136366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221195
19587	NC_019702	AAT	2	6	1136387	1136392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221195
19588	NC_019702	ATATTG	2	12	1136550	1136561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428221195
19589	NC_019702	AAAGG	2	10	1136604	1136613	60 %	0 %	40 %	0 %	428221195
19590	NC_019702	A	6	6	1136699	1136704	100 %	0 %	0 %	0 %	428221195
19591	NC_019702	TATT	2	8	1136730	1136737	25 %	75 %	0 %	0 %	428221195
19592	NC_019702	TGCTAA	2	12	1136767	1136778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428221195
19593	NC_019702	ATT	2	6	1136783	1136788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221195
19594	NC_019702	TA	3	6	1136822	1136827	50 %	50 %	0 %	0 %	428221195
19595	NC_019702	T	8	8	1136886	1136893	0 %	100 %	0 %	0 %	428221195
19596	NC_019702	AACA	2	8	1136903	1136910	75 %	0 %	0 %	25 %	428221195
19597	NC_019702	TCC	2	6	1136977	1136982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221195
19598	NC_019702	ATT	2	6	1137016	1137021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221195
19599	NC_019702	TAC	2	6	1137049	1137054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221195
19600	NC_019702	CAT	2	6	1137206	1137211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221195
19601	NC_019702	TGG	2	6	1137247	1137252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221195
19602	NC_019702	AT	3	6	1137256	1137261	50 %	50 %	0 %	0 %	428221195
19603	NC_019702	TGA	2	6	1137262	1137267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221195
19604	NC_019702	AGAA	2	8	1137286	1137293	75 %	0 %	25 %	0 %	428221195
19605	NC_019702	TGA	2	6	1137334	1137339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221195
19606	NC_019702	AGT	2	6	1137386	1137391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221195
19607	NC_019702	AATT	2	8	1137399	1137406	50 %	50 %	0 %	0 %	428221195
19608	NC_019702	TCC	2	6	1137418	1137423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221195
19609	NC_019702	ATC	3	9	1137562	1137570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221196
19610	NC_019702	TGA	2	6	1137627	1137632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221196
19611	NC_019702	TC	3	6	1137633	1137638	0 %	50 %	0 %	50 %	428221196
19612	NC_019702	ATC	2	6	1137646	1137651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221196
19613	NC_019702	ATT	2	6	1137670	1137675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221196
19614	NC_019702	GCT	2	6	1137695	1137700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221196
19615	NC_019702	T	6	6	1137709	1137714	0 %	100 %	0 %	0 %	428221196
19616	NC_019702	AAAT	2	8	1137814	1137821	75 %	25 %	0 %	0 %	428221196
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19975	NC_019702	TTG	2	6	1158280	1158285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221220
19976	NC_019702	TAA	2	6	1158343	1158348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221220
19977	NC_019702	TGA	2	6	1158389	1158394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221220
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19979	NC_019702	CAAT	2	8	1158458	1158465	50 %	25 %	0 %	25 %	428221220
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19982	NC_019702	T	6	6	1158642	1158647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19983	NC_019702	ATG	2	6	1158716	1158721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19996	NC_019702	AATT	2	8	1159393	1159400	50 %	50 %	0 %	0 %	428221221
19997	NC_019702	ATTTA	2	10	1159463	1159472	40 %	60 %	0 %	0 %	428221221
19998	NC_019702	ATTT	2	8	1159531	1159538	25 %	75 %	0 %	0 %	428221221
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