MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_019702	CTT	2	6	867796	867801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_019702	GAT	2	6	867841	867846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_019702	AT	3	6	867845	867850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_019702	T	6	6	867869	867874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_019702	TA	3	6	867878	867883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_019702	GCC	2	6	867912	867917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220968
15007	NC_019702	CGGG	2	8	867922	867929	0 %	0 %	75 %	25 %	428220968
15008	NC_019702	TC	3	6	867987	867992	0 %	50 %	0 %	50 %	428220968
15009	NC_019702	CTA	2	6	868013	868018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220968
15010	NC_019702	CTG	3	9	868055	868063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220968
15011	NC_019702	T	6	6	868064	868069	0 %	100 %	0 %	0 %	428220968
15012	NC_019702	TCC	2	6	868141	868146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220968
15013	NC_019702	TCT	2	6	868151	868156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220968
15014	NC_019702	GAT	2	6	868160	868165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220968
15015	NC_019702	CAT	2	6	868169	868174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220968
15016	NC_019702	TCA	2	6	868261	868266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220968
15017	NC_019702	A	6	6	868293	868298	100 %	0 %	0 %	0 %	428220968
15018	NC_019702	TTG	2	6	868388	868393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220968
15019	NC_019702	TGT	2	6	868416	868421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_019702	TTCT	2	8	868427	868434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15021	NC_019702	TGG	2	6	868518	868523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220969
15022	NC_019702	TCT	2	6	868619	868624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220969
15023	NC_019702	TC	3	6	868626	868631	0 %	50 %	0 %	50 %	428220969
15024	NC_019702	GCT	2	6	868674	868679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220969
15025	NC_019702	TA	3	6	868732	868737	50 %	50 %	0 %	0 %	428220970
15026	NC_019702	ACC	2	6	868738	868743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220970
15027	NC_019702	AGC	2	6	868750	868755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220970
15028	NC_019702	TCC	2	6	868811	868816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220970
15029	NC_019702	GAA	2	6	869006	869011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_019702	GCT	2	6	869043	869048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_019702	CAA	2	6	869088	869093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_019702	TTAG	2	8	869200	869207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_019702	A	6	6	869208	869213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_019702	TCT	2	6	869271	869276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_019702	CAT	2	6	869312	869317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_019702	GTT	2	6	869399	869404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_019702	TTTC	2	8	869486	869493	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15038	NC_019702	GGT	2	6	869536	869541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_019702	TTG	2	6	869566	869571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_019702	CAC	2	6	869577	869582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15041	NC_019702	GAT	2	6	869583	869588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_019702	TCA	2	6	869636	869641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_019702	TGC	2	6	869653	869658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_019702	TTTC	2	8	869686	869693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15045	NC_019702	TTA	2	6	869720	869725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_019702	GT	3	6	869801	869806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_019702	TGC	2	6	869833	869838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_019702	TTTCT	2	10	869839	869848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15049	NC_019702	TGT	2	6	869878	869883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_019702	TC	3	6	869901	869906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15051	NC_019702	TTG	2	6	869962	869967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_019702	TGT	2	6	869981	869986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_019702	ATA	2	6	870029	870034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_019702	CAT	2	6	870035	870040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_019702	TCT	2	6	870068	870073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_019702	CTGT	2	8	870171	870178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15057	NC_019702	CAGT	2	8	870215	870222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15058	NC_019702	TTC	2	6	870277	870282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_019702	TCTT	2	8	870291	870298	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15060	NC_019702	ATT	2	6	870417	870422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_019702	TAG	2	6	870495	870500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_019702	CAA	2	6	870656	870661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220971
15063	NC_019702	TGCCC	2	10	870670	870679	0 %	20 %	20 %	60 %	428220971
15064	NC_019702	ATTC	2	8	870775	870782	25 %	50 %	0 %	25 %	428220971
15065	NC_019702	CAA	2	6	870828	870833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220971
15066	NC_019702	CTA	2	6	870880	870885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220971
15067	NC_019702	CCA	2	6	870938	870943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220971
15068	NC_019702	CAA	2	6	871199	871204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220971
15069	NC_019702	CTG	3	9	871312	871320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_019702	ATCT	2	8	871321	871328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15071	NC_019702	GAC	2	6	871491	871496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220972
15072	NC_019702	GCA	2	6	871499	871504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220972
15073	NC_019702	ACCT	2	8	871509	871516	25 %	25 %	0 %	50 %	428220972
15074	NC_019702	CAC	2	6	871631	871636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220972
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15076	NC_019702	GGCGA	2	10	871879	871888	20 %	0 %	60 %	20 %	428220972
15077	NC_019702	CAT	2	6	871905	871910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220972
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15081	NC_019702	GGC	2	6	871993	871998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220972
15082	NC_019702	TCGC	2	8	872001	872008	0 %	25 %	25 %	50 %	428220972
15083	NC_019702	A	6	6	872041	872046	100 %	0 %	0 %	0 %	428220972
15084	NC_019702	GAG	2	6	872106	872111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220972
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15087	NC_019702	A	6	6	872182	872187	100 %	0 %	0 %	0 %	428220972
15088	NC_019702	GCG	2	6	872209	872214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220972
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15091	NC_019702	TTC	2	6	872347	872352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220972
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15095	NC_019702	TA	3	6	872710	872715	50 %	50 %	0 %	0 %	428220972
15096	NC_019702	TAT	2	6	872734	872739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220972
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15098	NC_019702	TGC	2	6	872864	872869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220972
15099	NC_019702	ACTGT	2	10	873000	873009	20 %	40 %	20 %	20 %	428220972
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15102	NC_019702	TAA	2	6	873187	873192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220972
15103	NC_019702	TTA	2	6	873318	873323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_019702	CTTT	2	8	873412	873419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15105	NC_019702	AATT	2	8	873430	873437	50 %	50 %	0 %	0 %	428220973
15106	NC_019702	AGA	2	6	873447	873452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220973
15107	NC_019702	AGAA	2	8	873482	873489	75 %	0 %	25 %	0 %	428220973
15108	NC_019702	TGT	3	9	873517	873525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220973
15109	NC_019702	TTG	2	6	873534	873539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220973
15110	NC_019702	ATT	2	6	873549	873554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220973
15111	NC_019702	GTA	2	6	873596	873601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220973
15112	NC_019702	CTGTA	2	10	873786	873795	20 %	40 %	20 %	20 %	428220973
15113	NC_019702	AAT	2	6	873804	873809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220973
15114	NC_019702	AAAT	2	8	873857	873864	75 %	25 %	0 %	0 %	428220973
15115	NC_019702	T	7	7	873895	873901	0 %	100 %	0 %	0 %	428220973
15116	NC_019702	GGC	2	6	873969	873974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220973
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15120	NC_019702	AATTAA	2	12	874101	874112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220973
15121	NC_019702	TGAGT	2	10	874175	874184	20 %	40 %	40 %	0 %	428220973
15122	NC_019702	TTGA	2	8	874221	874228	25 %	50 %	25 %	0 %	428220973
15123	NC_019702	GTA	2	6	874280	874285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220973
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15125	NC_019702	T	6	6	874323	874328	0 %	100 %	0 %	0 %	428220973
15126	NC_019702	GTA	2	6	874383	874388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220973
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15150	NC_019702	CTG	2	6	875723	875728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220973
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15235	NC_019702	ATC	2	6	880230	880235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220976
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15244	NC_019702	ATT	2	6	880875	880880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220976
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15490	NC_019702	A	6	6	896078	896083	100 %	0 %	0 %	0 %	428220985
15491	NC_019702	AAT	2	6	896121	896126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220985
15492	NC_019702	TGA	2	6	896127	896132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220985
15493	NC_019702	AGA	2	6	896151	896156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220985
15494	NC_019702	TAC	2	6	896233	896238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15495	NC_019702	AT	3	6	896239	896244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15496	NC_019702	CCG	2	6	896290	896295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220986
15497	NC_019702	TTTA	2	8	896307	896314	25 %	75 %	0 %	0 %	428220986
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15499	NC_019702	TC	3	6	896366	896371	0 %	50 %	0 %	50 %	428220986
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