MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_019702	ATT	2	6	661157	661162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_019702	TAA	2	6	661235	661240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220764
11503	NC_019702	TCC	2	6	661332	661337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220764
11504	NC_019702	TTG	2	6	661341	661346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220764
11505	NC_019702	GA	3	6	661385	661390	50 %	0 %	50 %	0 %	428220764
11506	NC_019702	T	6	6	661410	661415	0 %	100 %	0 %	0 %	428220764
11507	NC_019702	CA	3	6	661441	661446	50 %	0 %	0 %	50 %	428220764
11508	NC_019702	TGA	2	6	661476	661481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220764
11509	NC_019702	TA	3	6	661491	661496	50 %	50 %	0 %	0 %	428220764
11510	NC_019702	TAT	2	6	661505	661510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220764
11511	NC_019702	CGA	2	6	661549	661554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220764
11512	NC_019702	TTA	2	6	661555	661560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220764
11513	NC_019702	GAT	2	6	661563	661568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220764
11514	NC_019702	AGT	2	6	661628	661633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220764
11515	NC_019702	ATA	2	6	661742	661747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220764
11516	NC_019702	TCA	2	6	661867	661872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220764
11517	NC_019702	CGG	2	6	661993	661998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220764
11518	NC_019702	GTT	2	6	661999	662004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220764
11519	NC_019702	AATT	2	8	662034	662041	50 %	50 %	0 %	0 %	428220764
11520	NC_019702	TTA	2	6	662092	662097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220764
11521	NC_019702	AGG	2	6	662310	662315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220764
11522	NC_019702	TAC	2	6	662337	662342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220764
11523	NC_019702	T	6	6	662367	662372	0 %	100 %	0 %	0 %	428220764
11524	NC_019702	CTT	2	6	662379	662384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220764
11525	NC_019702	TTG	2	6	662606	662611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220765
11526	NC_019702	AAT	2	6	662615	662620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220765
11527	NC_019702	TAA	2	6	662633	662638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220765
11528	NC_019702	GCA	2	6	662641	662646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220765
11529	NC_019702	AT	3	6	662652	662657	50 %	50 %	0 %	0 %	428220765
11530	NC_019702	ATAG	2	8	662732	662739	50 %	25 %	25 %	0 %	428220765
11531	NC_019702	CTGAGG	2	12	662747	662758	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428220765
11532	NC_019702	TGA	2	6	662784	662789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220765
11533	NC_019702	AAT	2	6	662861	662866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220765
11534	NC_019702	T	7	7	662930	662936	0 %	100 %	0 %	0 %	428220765
11535	NC_019702	GTT	2	6	662977	662982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220765
11536	NC_019702	GCCAT	2	10	663033	663042	20 %	20 %	20 %	40 %	428220765
11537	NC_019702	TAA	2	6	663180	663185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220766
11538	NC_019702	AAT	2	6	663273	663278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220766
11539	NC_019702	A	6	6	663352	663357	100 %	0 %	0 %	0 %	428220766
11540	NC_019702	CAAA	2	8	663392	663399	75 %	0 %	0 %	25 %	428220766
11541	NC_019702	A	6	6	663397	663402	100 %	0 %	0 %	0 %	428220766
11542	NC_019702	T	6	6	663435	663440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_019702	ATTA	2	8	663441	663448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_019702	TTAA	2	8	663511	663518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_019702	AG	3	6	663519	663524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_019702	TA	3	6	663585	663590	50 %	50 %	0 %	0 %	428220767
11547	NC_019702	ATC	2	6	663616	663621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220767
11548	NC_019702	AAT	2	6	663654	663659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220767
11549	NC_019702	CTT	2	6	663665	663670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220767
11550	NC_019702	CTT	3	9	663794	663802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220767
11551	NC_019702	A	6	6	663807	663812	100 %	0 %	0 %	0 %	428220767
11552	NC_019702	TC	3	6	663838	663843	0 %	50 %	0 %	50 %	428220767
11553	NC_019702	CCA	2	6	663869	663874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220767
11554	NC_019702	AATTT	2	10	663994	664003	40 %	60 %	0 %	0 %	428220767
11555	NC_019702	AAT	2	6	664035	664040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220767
11556	NC_019702	CGATGA	2	12	664069	664080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428220767
11557	NC_019702	GAT	2	6	664182	664187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220767
11558	NC_019702	TTAA	2	8	664224	664231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_019702	TAAT	2	8	664238	664245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_019702	GTTA	2	8	664248	664255	25 %	50 %	25 %	0 %	428220768
11561	NC_019702	TTC	2	6	664280	664285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220768
11562	NC_019702	TAA	2	6	664300	664305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220768
11563	NC_019702	TGT	2	6	664320	664325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220768
11564	NC_019702	CGG	2	6	664473	664478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220768
11565	NC_019702	T	6	6	664488	664493	0 %	100 %	0 %	0 %	428220768
11566	NC_019702	AAAT	2	8	664589	664596	75 %	25 %	0 %	0 %	428220768
11567	NC_019702	CTGC	2	8	664612	664619	0 %	25 %	25 %	50 %	428220768
11568	NC_019702	G	6	6	664715	664720	0 %	0 %	100 %	0 %	428220768
11569	NC_019702	TTG	2	6	664787	664792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220768
11570	NC_019702	TCA	2	6	664944	664949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220768
11571	NC_019702	CAG	2	6	664973	664978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220768
11572	NC_019702	TTTGAA	2	12	664981	664992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428220768
11573	NC_019702	TCA	2	6	665055	665060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220768
11574	NC_019702	TCC	2	6	665150	665155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220768
11575	NC_019702	TAC	2	6	665347	665352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220768
11576	NC_019702	CTGAAA	2	12	665369	665380	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428220768
11577	NC_019702	GGT	2	6	665454	665459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_019702	TAA	2	6	665479	665484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_019702	GCT	2	6	665657	665662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_019702	ATT	2	6	665709	665714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220769
11581	NC_019702	A	6	6	665730	665735	100 %	0 %	0 %	0 %	428220769
11582	NC_019702	CAG	2	6	665754	665759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220769
11583	NC_019702	AAT	2	6	665814	665819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220769
11584	NC_019702	CCA	2	6	665836	665841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220769
11585	NC_019702	AAT	2	6	665913	665918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220769
11586	NC_019702	A	6	6	665925	665930	100 %	0 %	0 %	0 %	428220769
11587	NC_019702	ATT	2	6	666062	666067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220769
11588	NC_019702	A	7	7	666097	666103	100 %	0 %	0 %	0 %	428220769
11589	NC_019702	ACTT	2	8	666157	666164	25 %	50 %	0 %	25 %	428220769
11590	NC_019702	ACC	2	6	666166	666171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220769
11591	NC_019702	CAA	2	6	666246	666251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220769
11592	NC_019702	GAA	2	6	666315	666320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220769
11593	NC_019702	TATG	2	8	666416	666423	25 %	50 %	25 %	0 %	428220769
11594	NC_019702	TCA	2	6	666476	666481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220769
11595	NC_019702	AGA	2	6	666522	666527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220769
11596	NC_019702	TAA	2	6	666539	666544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220769
11597	NC_019702	C	6	6	666547	666552	0 %	0 %	0 %	100 %	428220769
11598	NC_019702	GAT	2	6	666570	666575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220769
11599	NC_019702	GAA	2	6	666657	666662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220769
11600	NC_019702	CAA	2	6	666734	666739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_019702	A	7	7	666771	666777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_019702	ACT	2	6	666790	666795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_019702	CTG	2	6	666843	666848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220770
11604	NC_019702	TGC	2	6	666886	666891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220770
11605	NC_019702	GATG	2	8	666919	666926	25 %	25 %	50 %	0 %	428220770
11606	NC_019702	TTAA	2	8	667184	667191	50 %	50 %	0 %	0 %	428220770
11607	NC_019702	TGG	2	6	667246	667251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220770
11608	NC_019702	GTT	2	6	667271	667276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220770
11609	NC_019702	TGA	2	6	667306	667311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220770
11610	NC_019702	TGG	2	6	667342	667347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220770
11611	NC_019702	ATA	2	6	667359	667364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220770
11612	NC_019702	CGG	2	6	667410	667415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220770
11613	NC_019702	TAAC	2	8	667526	667533	50 %	25 %	0 %	25 %	428220771
11614	NC_019702	CTG	2	6	667536	667541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220771
11615	NC_019702	CTT	2	6	667704	667709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220771
11616	NC_019702	ATAA	2	8	667711	667718	75 %	25 %	0 %	0 %	428220771
11617	NC_019702	TACT	2	8	667739	667746	25 %	50 %	0 %	25 %	428220771
11618	NC_019702	AT	3	6	667815	667820	50 %	50 %	0 %	0 %	428220771
11619	NC_019702	TTGCC	2	10	667845	667854	0 %	40 %	20 %	40 %	428220771
11620	NC_019702	ATA	2	6	667983	667988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220771
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11986	NC_019702	TCA	2	6	690687	690692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220788
11987	NC_019702	G	7	7	690738	690744	0 %	0 %	100 %	0 %	428220788
11988	NC_019702	ATCA	2	8	690778	690785	50 %	25 %	0 %	25 %	428220788
11989	NC_019702	CCA	2	6	690813	690818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220788
11990	NC_019702	CTG	2	6	690894	690899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220788
11991	NC_019702	GGAT	2	8	690926	690933	25 %	25 %	50 %	0 %	428220788
11992	NC_019702	GAT	2	6	690967	690972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220788
11993	NC_019702	TGC	2	6	690979	690984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220788
11994	NC_019702	AGA	2	6	691012	691017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220788
11995	NC_019702	TAA	2	6	691089	691094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220788
11996	NC_019702	TGT	2	6	691229	691234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220788
11997	NC_019702	TCT	2	6	691277	691282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220788
11998	NC_019702	GGCATA	2	12	691357	691368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428220788
11999	NC_019702	GCGATC	2	12	691417	691428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220788
12000	NC_019702	ACC	2	6	691591	691596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220788

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