MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019702	TAG	2	6	632668	632673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_019702	AGT	2	6	632678	632683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_019702	GGA	2	6	632687	632692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_019702	TTCT	2	8	632707	632714	0 %	75 %	0 %	25 %	428220736
11005	NC_019702	AGCC	2	8	632740	632747	25 %	0 %	25 %	50 %	428220736
11006	NC_019702	AATT	2	8	632832	632839	50 %	50 %	0 %	0 %	428220736
11007	NC_019702	A	6	6	632849	632854	100 %	0 %	0 %	0 %	428220736
11008	NC_019702	AGC	3	9	632902	632910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220736
11009	NC_019702	AAT	2	6	632921	632926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220736
11010	NC_019702	CAG	2	6	632963	632968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220736
11011	NC_019702	TA	3	6	633057	633062	50 %	50 %	0 %	0 %	428220736
11012	NC_019702	CAG	3	9	633167	633175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220736
11013	NC_019702	ATT	2	6	633209	633214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220736
11014	NC_019702	CTT	2	6	633218	633223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220736
11015	NC_019702	TACT	2	8	633257	633264	25 %	50 %	0 %	25 %	428220736
11016	NC_019702	CAA	2	6	633266	633271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220736
11017	NC_019702	CAA	2	6	633328	633333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220736
11018	NC_019702	AT	3	6	633401	633406	50 %	50 %	0 %	0 %	428220736
11019	NC_019702	GCA	2	6	633569	633574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220736
11020	NC_019702	ATA	2	6	633591	633596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220736
11021	NC_019702	TTG	2	6	633609	633614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220736
11022	NC_019702	ACT	2	6	633676	633681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220736
11023	NC_019702	AGCA	2	8	633723	633730	50 %	0 %	25 %	25 %	428220736
11024	NC_019702	ATT	2	6	633736	633741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220736
11025	NC_019702	CCTA	2	8	633898	633905	25 %	25 %	0 %	50 %	428220737
11026	NC_019702	TAA	2	6	634006	634011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220737
11027	NC_019702	AC	3	6	634014	634019	50 %	0 %	0 %	50 %	428220737
11028	NC_019702	G	6	6	634047	634052	0 %	0 %	100 %	0 %	428220737
11029	NC_019702	TTA	2	6	634067	634072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220737
11030	NC_019702	AGTAAA	2	12	634084	634095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428220737
11031	NC_019702	CCA	2	6	634135	634140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220737
11032	NC_019702	AAGA	2	8	634161	634168	75 %	0 %	25 %	0 %	428220737
11033	NC_019702	TCC	2	6	634235	634240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220737
11034	NC_019702	ATT	2	6	634300	634305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220737
11035	NC_019702	TAT	2	6	634359	634364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220737
11036	NC_019702	ATT	2	6	634367	634372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220737
11037	NC_019702	CCT	2	6	634437	634442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220737
11038	NC_019702	T	6	6	634449	634454	0 %	100 %	0 %	0 %	428220737
11039	NC_019702	ATT	2	6	634495	634500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220737
11040	NC_019702	T	6	6	634572	634577	0 %	100 %	0 %	0 %	428220737
11041	NC_019702	CTA	2	6	634578	634583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220737
11042	NC_019702	AGT	2	6	634658	634663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220737
11043	NC_019702	T	6	6	634666	634671	0 %	100 %	0 %	0 %	428220737
11044	NC_019702	TCT	2	6	634673	634678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220737
11045	NC_019702	GA	3	6	634752	634757	50 %	0 %	50 %	0 %	428220737
11046	NC_019702	T	6	6	634759	634764	0 %	100 %	0 %	0 %	428220737
11047	NC_019702	AAGCCC	2	12	634787	634798	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428220737
11048	NC_019702	GTT	2	6	634878	634883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220737
11049	NC_019702	TGC	2	6	634924	634929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220737
11050	NC_019702	CTG	2	6	634996	635001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220737
11051	NC_019702	CATC	2	8	635079	635086	25 %	25 %	0 %	50 %	428220737
11052	NC_019702	AGT	2	6	635180	635185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220738
11053	NC_019702	AAT	2	6	635186	635191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220738
11054	NC_019702	ATA	2	6	635196	635201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220738
11055	NC_019702	GCA	2	6	635208	635213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220738
11056	NC_019702	CCA	2	6	635368	635373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220738
11057	NC_019702	TGC	2	6	635384	635389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220738
11058	NC_019702	TAA	2	6	635480	635485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220738
11059	NC_019702	TAC	2	6	635498	635503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220738
11060	NC_019702	GGCAAA	2	12	635609	635620	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428220738
11061	NC_019702	TAA	2	6	635635	635640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220738
11062	NC_019702	ATAC	2	8	635674	635681	50 %	25 %	0 %	25 %	428220738
11063	NC_019702	ATTT	2	8	635683	635690	25 %	75 %	0 %	0 %	428220738
11064	NC_019702	CAG	2	6	635702	635707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220738
11065	NC_019702	GCA	2	6	635730	635735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220738
11066	NC_019702	TAA	2	6	635737	635742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220738
11067	NC_019702	GAT	2	6	635747	635752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220738
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11070	NC_019702	CAT	2	6	635824	635829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220738
11071	NC_019702	CTG	2	6	635836	635841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220738
11072	NC_019702	AAT	2	6	635849	635854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220738
11073	NC_019702	CCTT	2	8	635859	635866	0 %	50 %	0 %	50 %	428220738
11074	NC_019702	CAGA	2	8	635887	635894	50 %	0 %	25 %	25 %	428220738
11075	NC_019702	TGC	2	6	635930	635935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220738
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11077	NC_019702	CGC	2	6	635996	636001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220738
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11079	NC_019702	ACT	2	6	636030	636035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220738
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11084	NC_019702	ACT	2	6	636425	636430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220738
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11086	NC_019702	AGGAA	2	10	636526	636535	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_019702	TCT	2	6	636601	636606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_019702	AAT	2	6	636624	636629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_019702	ATT	2	6	636746	636751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220739
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11091	NC_019702	TGC	2	6	636829	636834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220739
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11093	NC_019702	AATT	2	8	636855	636862	50 %	50 %	0 %	0 %	428220739
11094	NC_019702	TTG	2	6	636867	636872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220739
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11097	NC_019702	TAAAAA	2	12	636993	637004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_019702	ATG	2	6	637052	637057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_019702	AACT	2	8	637132	637139	50 %	25 %	0 %	25 %	428220740
11100	NC_019702	CTTT	2	8	637280	637287	0 %	75 %	0 %	25 %	428220740
11101	NC_019702	GTC	2	6	637309	637314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220740
11102	NC_019702	AAG	2	6	637322	637327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220740
11103	NC_019702	C	6	6	637337	637342	0 %	0 %	0 %	100 %	428220740
11104	NC_019702	CCA	2	6	637394	637399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220740
11105	NC_019702	CAG	2	6	637412	637417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220740
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11108	NC_019702	CGG	2	6	637551	637556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220740
11109	NC_019702	GATC	2	8	637557	637564	25 %	25 %	25 %	25 %	428220740
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11112	NC_019702	TCA	2	6	637868	637873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220740
11113	NC_019702	TAGTT	2	10	637945	637954	20 %	60 %	20 %	0 %	428220740
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11119	NC_019702	GCC	2	6	638428	638433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220740
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11121	NC_019702	GCG	2	6	638483	638488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220740
11122	NC_019702	AACT	2	8	638512	638519	50 %	25 %	0 %	25 %	428220740
11123	NC_019702	GGT	2	6	638606	638611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220740
11124	NC_019702	GCA	2	6	638646	638651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220740
11125	NC_019702	AT	3	6	638657	638662	50 %	50 %	0 %	0 %	428220740
11126	NC_019702	CTAA	2	8	638744	638751	50 %	25 %	0 %	25 %	428220740
11127	NC_019702	T	6	6	638819	638824	0 %	100 %	0 %	0 %	428220740
11128	NC_019702	CAC	2	6	638907	638912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220740
11129	NC_019702	CAC	2	6	638916	638921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220740
11130	NC_019702	CCG	2	6	638933	638938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220740
11131	NC_019702	CCA	2	6	639218	639223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220740
11132	NC_019702	CCAC	2	8	639332	639339	25 %	0 %	0 %	75 %	428220740
11133	NC_019702	TAGC	2	8	639419	639426	25 %	25 %	25 %	25 %	428220740
11134	NC_019702	AG	3	6	639448	639453	50 %	0 %	50 %	0 %	428220740
11135	NC_019702	TAA	2	6	639460	639465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220740
11136	NC_019702	CATTTG	2	12	639538	639549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220740
11137	NC_019702	TAAG	2	8	639592	639599	50 %	25 %	25 %	0 %	428220740
11138	NC_019702	AAGC	2	8	639629	639636	50 %	0 %	25 %	25 %	428220740
11139	NC_019702	AAT	2	6	639673	639678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220740
11140	NC_019702	GGA	2	6	639743	639748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220740
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11142	NC_019702	TAA	2	6	639840	639845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220740
11143	NC_019702	CTG	2	6	639850	639855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220740
11144	NC_019702	TCCCT	2	10	640047	640056	0 %	40 %	0 %	60 %	428220740
11145	NC_019702	GGA	2	6	640070	640075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220740
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11147	NC_019702	ATC	2	6	640153	640158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220740
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11149	NC_019702	GTC	2	6	640267	640272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220740
11150	NC_019702	CTG	2	6	640312	640317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220740
11151	NC_019702	GTT	2	6	640362	640367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220740
11152	NC_019702	GCCT	2	8	640434	640441	0 %	25 %	25 %	50 %	428220740
11153	NC_019702	CATCCA	2	12	640461	640472	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428220740
11154	NC_019702	AACC	2	8	640488	640495	50 %	0 %	0 %	50 %	428220740
11155	NC_019702	ACC	3	9	640493	640501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220740
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11157	NC_019702	CGGG	2	8	640526	640533	0 %	0 %	75 %	25 %	428220740
11158	NC_019702	GCT	2	6	640556	640561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220740
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11163	NC_019702	CGA	2	6	640964	640969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220740
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11165	NC_019702	TAGA	2	8	641073	641080	50 %	25 %	25 %	0 %	428220740
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11170	NC_019702	TAC	2	6	641418	641423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220740
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11174	NC_019702	TA	4	8	641685	641692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11175	NC_019702	GTCTA	2	10	641694	641703	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11176	NC_019702	ATT	2	6	641704	641709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11177	NC_019702	TGT	2	6	641728	641733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11178	NC_019702	TAC	2	6	641751	641756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11180	NC_019702	CAAG	2	8	641829	641836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11181	NC_019702	CAA	2	6	641893	641898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11182	NC_019702	TTA	2	6	641920	641925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11183	NC_019702	ATC	2	6	642056	642061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220741
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11189	NC_019702	TCA	2	6	642559	642564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11194	NC_019702	A	6	6	643035	643040	100 %	0 %	0 %	0 %	428220742
11195	NC_019702	AC	3	6	643084	643089	50 %	0 %	0 %	50 %	428220742
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11198	NC_019702	GTA	2	6	643203	643208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220742
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11200	NC_019702	CTG	2	6	643279	643284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220742
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11202	NC_019702	GTT	2	6	643530	643535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220742
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11214	NC_019702	CCAT	2	8	644108	644115	25 %	25 %	0 %	50 %	428220742
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11220	NC_019702	GAA	2	6	644589	644594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11221	NC_019702	TAGA	2	8	644659	644666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_019702	AAGA	2	8	644742	644749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11223	NC_019702	A	6	6	644845	644850	100 %	0 %	0 %	0 %	428220743
11224	NC_019702	GTA	2	6	644851	644856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220743
11225	NC_019702	AT	3	6	644942	644947	50 %	50 %	0 %	0 %	428220743
11226	NC_019702	GTG	2	6	644950	644955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220743
11227	NC_019702	ATTA	2	8	645000	645007	50 %	50 %	0 %	0 %	428220743
11228	NC_019702	AAG	2	6	645065	645070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220743
11229	NC_019702	AGT	2	6	645149	645154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_019702	TTG	2	6	645215	645220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220744
11231	NC_019702	TCT	2	6	645270	645275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220744
11232	NC_019702	T	6	6	645425	645430	0 %	100 %	0 %	0 %	428220744
11233	NC_019702	GAC	2	6	645490	645495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220744
11234	NC_019702	CTC	2	6	645521	645526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220744
11235	NC_019702	GATCGC	2	12	645544	645555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220744
11236	NC_019702	TAAA	2	8	645559	645566	75 %	25 %	0 %	0 %	428220744
11237	NC_019702	TATG	2	8	645595	645602	25 %	50 %	25 %	0 %	428220744
11238	NC_019702	AC	3	6	645640	645645	50 %	0 %	0 %	50 %	428220744
11239	NC_019702	CTA	2	6	645847	645852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11240	NC_019702	GGC	2	6	645920	645925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220745
11241	NC_019702	TGG	2	6	646058	646063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220745
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11243	NC_019702	GTT	2	6	646147	646152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220745
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11359	NC_019702	A	6	6	652943	652948	100 %	0 %	0 %	0 %	428220752
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