MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019702	TACA	2	8	575418	575425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_019702	A	6	6	575467	575472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_019702	TTG	2	6	575519	575524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_019702	ATAA	2	8	575577	575584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_019702	ATTTG	2	10	575597	575606	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_019702	CTT	2	6	575695	575700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220688
10007	NC_019702	ACT	2	6	575756	575761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220688
10008	NC_019702	AGC	2	6	575912	575917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220688
10009	NC_019702	TAC	2	6	575929	575934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220688
10010	NC_019702	A	6	6	575942	575947	100 %	0 %	0 %	0 %	428220688
10011	NC_019702	GTAG	2	8	576024	576031	25 %	25 %	50 %	0 %	428220688
10012	NC_019702	TTACC	2	10	576136	576145	20 %	40 %	0 %	40 %	428220688
10013	NC_019702	ATTG	2	8	576209	576216	25 %	50 %	25 %	0 %	428220688
10014	NC_019702	ATA	2	6	576304	576309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220688
10015	NC_019702	TAA	2	6	576357	576362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_019702	TGC	2	6	576494	576499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220689
10017	NC_019702	AAT	2	6	576528	576533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220689
10018	NC_019702	GA	3	6	576540	576545	50 %	0 %	50 %	0 %	428220689
10019	NC_019702	TAAT	2	8	576546	576553	50 %	50 %	0 %	0 %	428220689
10020	NC_019702	TCA	2	6	576554	576559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220689
10021	NC_019702	CTC	2	6	576578	576583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220689
10022	NC_019702	T	7	7	576726	576732	0 %	100 %	0 %	0 %	428220689
10023	NC_019702	TAT	2	6	576897	576902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_019702	ATC	2	6	577059	577064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220690
10025	NC_019702	CTC	2	6	577067	577072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220690
10026	NC_019702	GACT	2	8	577078	577085	25 %	25 %	25 %	25 %	428220690
10027	NC_019702	GAATTA	2	12	577238	577249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428220690
10028	NC_019702	TAGAGT	2	12	577260	577271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220690
10029	NC_019702	CTA	2	6	577281	577286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220690
10030	NC_019702	AGG	2	6	577315	577320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220690
10031	NC_019702	TTA	2	6	577373	577378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220690
10032	NC_019702	G	6	6	577409	577414	0 %	0 %	100 %	0 %	428220690
10033	NC_019702	ATT	2	6	577516	577521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220690
10034	NC_019702	ATG	2	6	577529	577534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220690
10035	NC_019702	TTC	2	6	577623	577628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220690
10036	NC_019702	TCT	2	6	577647	577652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220690
10037	NC_019702	TAG	2	6	577927	577932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220690
10038	NC_019702	TGG	2	6	577957	577962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220690
10039	NC_019702	GAT	2	6	578263	578268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220690
10040	NC_019702	ACA	2	6	578338	578343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220690
10041	NC_019702	TTG	2	6	578351	578356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220690
10042	NC_019702	GCT	2	6	578494	578499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220691
10043	NC_019702	CA	3	6	578506	578511	50 %	0 %	0 %	50 %	428220691
10044	NC_019702	GAT	2	6	578643	578648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220691
10045	NC_019702	GAA	2	6	578654	578659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220691
10046	NC_019702	TAAT	2	8	578715	578722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_019702	AAT	2	6	578726	578731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_019702	TAC	2	6	578781	578786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_019702	CAA	2	6	578859	578864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220692
10050	NC_019702	CGC	2	6	578938	578943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220692
10051	NC_019702	C	6	6	579019	579024	0 %	0 %	0 %	100 %	428220692
10052	NC_019702	AACT	2	8	579080	579087	50 %	25 %	0 %	25 %	428220692
10053	NC_019702	AT	3	6	579210	579215	50 %	50 %	0 %	0 %	428220692
10054	NC_019702	TTA	2	6	579246	579251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220692
10055	NC_019702	ACA	2	6	579363	579368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220692
10056	NC_019702	CGG	2	6	579419	579424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220692
10057	NC_019702	ATTTA	2	10	579434	579443	40 %	60 %	0 %	0 %	428220692
10058	NC_019702	CGG	2	6	579556	579561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220692
10059	NC_019702	ATG	2	6	579581	579586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220692
10060	NC_019702	TAAT	2	8	579601	579608	50 %	50 %	0 %	0 %	428220692
10061	NC_019702	GAT	2	6	579708	579713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220693
10062	NC_019702	GCT	2	6	579734	579739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220693
10063	NC_019702	ATA	2	6	579767	579772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220693
10064	NC_019702	GGT	2	6	579778	579783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220693
10065	NC_019702	GTG	2	6	579811	579816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220693
10066	NC_019702	AAT	2	6	579826	579831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220693
10067	NC_019702	A	6	6	579976	579981	100 %	0 %	0 %	0 %	428220693
10068	NC_019702	TCA	2	6	579986	579991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10069	NC_019702	AAT	2	6	580007	580012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220693
10070	NC_019702	CGG	2	6	580014	580019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220693
10071	NC_019702	ATT	2	6	580033	580038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220693
10072	NC_019702	T	6	6	580068	580073	0 %	100 %	0 %	0 %	428220693
10073	NC_019702	AGG	2	6	580092	580097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220693
10074	NC_019702	ATCACT	2	12	580123	580134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10075	NC_019702	TCA	2	6	580169	580174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10076	NC_019702	ATC	2	6	580214	580219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10077	NC_019702	CTA	2	6	580350	580355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10078	NC_019702	TTAGGA	2	12	580367	580378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220693
10079	NC_019702	A	6	6	580483	580488	100 %	0 %	0 %	0 %	428220693
10080	NC_019702	ATC	2	6	580552	580557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10081	NC_019702	TAAC	2	8	580632	580639	50 %	25 %	0 %	25 %	428220693
10082	NC_019702	AATTA	2	10	580693	580702	60 %	40 %	0 %	0 %	428220693
10083	NC_019702	ATCA	2	8	580732	580739	50 %	25 %	0 %	25 %	428220693
10084	NC_019702	TAA	2	6	580788	580793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220693
10085	NC_019702	TGCGGG	2	12	580803	580814	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428220693
10086	NC_019702	CT	3	6	580840	580845	0 %	50 %	0 %	50 %	428220693
10087	NC_019702	AAT	2	6	580846	580851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220693
10088	NC_019702	AT	4	8	580907	580914	50 %	50 %	0 %	0 %	428220693
10089	NC_019702	AAAAT	2	10	581013	581022	80 %	20 %	0 %	0 %	428220693
10090	NC_019702	CTT	2	6	581064	581069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220693
10091	NC_019702	TTC	2	6	581077	581082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220693
10092	NC_019702	AT	3	6	581096	581101	50 %	50 %	0 %	0 %	428220693
10093	NC_019702	CAT	2	6	581122	581127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220693
10094	NC_019702	CTTG	2	8	581136	581143	0 %	50 %	25 %	25 %	428220693
10095	NC_019702	TGA	2	6	581156	581161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220693
10096	NC_019702	ATG	2	6	581198	581203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_019702	AGTT	2	8	581325	581332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_019702	TAATC	2	10	581361	581370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10099	NC_019702	TGT	2	6	581381	581386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_019702	TA	3	6	581416	581421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_019702	GA	3	6	581552	581557	50 %	0 %	50 %	0 %	428220694
10102	NC_019702	A	6	6	581560	581565	100 %	0 %	0 %	0 %	428220694
10103	NC_019702	CTA	2	6	581567	581572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220694
10104	NC_019702	TCT	2	6	581595	581600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220694
10105	NC_019702	CGAT	2	8	581692	581699	25 %	25 %	25 %	25 %	428220694
10106	NC_019702	TTA	2	6	581700	581705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220694
10107	NC_019702	TGG	2	6	581741	581746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220694
10108	NC_019702	AAC	2	6	581761	581766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220694
10109	NC_019702	TTA	2	6	581776	581781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220694
10110	NC_019702	ATT	2	6	581787	581792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220694
10111	NC_019702	A	7	7	581934	581940	100 %	0 %	0 %	0 %	428220694
10112	NC_019702	TAT	2	6	582010	582015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220694
10113	NC_019702	CTTA	2	8	582053	582060	25 %	50 %	0 %	25 %	428220694
10114	NC_019702	TGA	2	6	582089	582094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220694
10115	NC_019702	CGAT	2	8	582136	582143	25 %	25 %	25 %	25 %	428220694
10116	NC_019702	A	6	6	582177	582182	100 %	0 %	0 %	0 %	428220694
10117	NC_019702	ACT	2	6	582191	582196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220694
10118	NC_019702	CATTA	2	10	582306	582315	40 %	40 %	0 %	20 %	428220694
10119	NC_019702	ATG	2	6	582334	582339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220694
10120	NC_019702	ATT	2	6	582363	582368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220694
10121	NC_019702	AAG	2	6	582436	582441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_019702	TC	3	6	582608	582613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_019702	CT	3	6	582639	582644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_019702	TGGA	2	8	582692	582699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_019702	AATC	2	8	583229	583236	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10223	NC_019702	TGG	2	6	587979	587984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220700
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10229	NC_019702	CA	3	6	588237	588242	50 %	0 %	0 %	50 %	428220700
10230	NC_019702	AGT	2	6	588247	588252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220700
10231	NC_019702	TGC	2	6	588258	588263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220700
10232	NC_019702	GCAA	2	8	588357	588364	50 %	0 %	25 %	25 %	428220700
10233	NC_019702	CCA	2	6	588463	588468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220700
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10235	NC_019702	ATA	2	6	588527	588532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220700
10236	NC_019702	TAA	2	6	588606	588611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220700
10237	NC_019702	TGAC	2	8	588616	588623	25 %	25 %	25 %	25 %	428220700
10238	NC_019702	GGT	2	6	588630	588635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220700
10239	NC_019702	GAGC	2	8	588661	588668	25 %	0 %	50 %	25 %	428220700
10240	NC_019702	CTG	2	6	588684	588689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220700
10241	NC_019702	TCC	2	6	588732	588737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220700
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10243	NC_019702	GAT	2	6	588822	588827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_019702	AAT	2	6	588868	588873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_019702	AAT	3	9	588923	588931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220701
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10491	NC_019702	ATTT	2	8	602178	602185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_019702	TTG	2	6	602200	602205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10494	NC_019702	TTAA	2	8	602330	602337	50 %	50 %	0 %	0 %	428220715
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10499	NC_019702	AATT	2	8	602545	602552	50 %	50 %	0 %	0 %	428220715
10500	NC_019702	TAGG	2	8	602637	602644	25 %	25 %	50 %	0 %	428220715

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