MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_019702	CAAA	2	8	520172	520179	75 %	0 %	0 %	25 %	428220634
9002	NC_019702	GCC	2	6	520272	520277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220634
9003	NC_019702	ATT	2	6	520326	520331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220634
9004	NC_019702	TA	3	6	520366	520371	50 %	50 %	0 %	0 %	428220634
9005	NC_019702	ATT	2	6	520385	520390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220634
9006	NC_019702	TTA	2	6	520410	520415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220634
9007	NC_019702	CAA	2	6	520428	520433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220634
9008	NC_019702	TCC	2	6	520551	520556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220634
9009	NC_019702	CCT	2	6	520581	520586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220634
9010	NC_019702	TAA	2	6	520591	520596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220634
9011	NC_019702	CAG	2	6	520668	520673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220634
9012	NC_019702	GAT	2	6	520763	520768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220634
9013	NC_019702	TAG	3	9	520831	520839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220634
9014	NC_019702	CCAGT	2	10	520861	520870	20 %	20 %	20 %	40 %	428220634
9015	NC_019702	AGC	2	6	520880	520885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220634
9016	NC_019702	TGT	2	6	520900	520905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220634
9017	NC_019702	A	6	6	520921	520926	100 %	0 %	0 %	0 %	428220634
9018	NC_019702	GCC	2	6	520955	520960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220634
9019	NC_019702	TGAT	2	8	520972	520979	25 %	50 %	25 %	0 %	428220634
9020	NC_019702	TAA	2	6	521012	521017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220634
9021	NC_019702	CTG	2	6	521071	521076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220634
9022	NC_019702	TTA	2	6	521169	521174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220634
9023	NC_019702	CCAA	2	8	521236	521243	50 %	0 %	0 %	50 %	428220634
9024	NC_019702	AAT	2	6	521289	521294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220634
9025	NC_019702	ATC	2	6	521367	521372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_019702	AAT	2	6	521493	521498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_019702	ATA	2	6	521508	521513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_019702	TTA	2	6	521535	521540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_019702	CAA	2	6	521546	521551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_019702	GCA	2	6	521630	521635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_019702	TTA	2	6	521670	521675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_019702	GCA	2	6	521719	521724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220635
9033	NC_019702	GAC	2	6	521753	521758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220635
9034	NC_019702	TGG	2	6	521833	521838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220635
9035	NC_019702	CAC	2	6	521851	521856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220635
9036	NC_019702	CTT	3	9	521862	521870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220635
9037	NC_019702	TCT	2	6	521933	521938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220635
9038	NC_019702	CT	4	8	521959	521966	0 %	50 %	0 %	50 %	428220635
9039	NC_019702	TAC	2	6	521967	521972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220635
9040	NC_019702	TGG	2	6	522019	522024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220635
9041	NC_019702	GATT	2	8	522060	522067	25 %	50 %	25 %	0 %	428220635
9042	NC_019702	CTGG	2	8	522192	522199	0 %	25 %	50 %	25 %	428220635
9043	NC_019702	ATG	2	6	522290	522295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220635
9044	NC_019702	GAT	2	6	522368	522373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220635
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9047	NC_019702	TAG	2	6	522541	522546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220635
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9049	NC_019702	AGA	2	6	522616	522621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220635
9050	NC_019702	ATGG	2	8	522679	522686	25 %	25 %	50 %	0 %	428220635
9051	NC_019702	CTC	2	6	522687	522692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220635
9052	NC_019702	AAT	2	6	522895	522900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220636
9053	NC_019702	TAC	2	6	522930	522935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220636
9054	NC_019702	TGG	2	6	522946	522951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220636
9055	NC_019702	TTA	2	6	522968	522973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220636
9056	NC_019702	GCCA	2	8	523120	523127	25 %	0 %	25 %	50 %	428220636
9057	NC_019702	TGG	2	6	523146	523151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220636
9058	NC_019702	TGT	2	6	523179	523184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220636
9059	NC_019702	CGG	2	6	523208	523213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220636
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9061	NC_019702	ACT	2	6	523268	523273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220636
9062	NC_019702	CTTT	2	8	523277	523284	0 %	75 %	0 %	25 %	428220636
9063	NC_019702	ACAAAA	2	12	523301	523312	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428220636
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9065	NC_019702	TTG	2	6	523342	523347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220636
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9069	NC_019702	TGG	2	6	523497	523502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220636
9070	NC_019702	ATC	2	6	523513	523518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220636
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9072	NC_019702	CAT	2	6	523566	523571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220636
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9075	NC_019702	TG	3	6	523710	523715	0 %	50 %	50 %	0 %	428220636
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9080	NC_019702	TCG	2	6	524010	524015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220636
9081	NC_019702	TCAA	2	8	524050	524057	50 %	25 %	0 %	25 %	428220636
9082	NC_019702	TTC	4	12	524143	524154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220636
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9087	NC_019702	CAA	2	6	524360	524365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_019702	CGG	2	6	524380	524385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_019702	CTG	2	6	524486	524491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220637
9090	NC_019702	AT	4	8	524518	524525	50 %	50 %	0 %	0 %	428220637
9091	NC_019702	CAG	2	6	524713	524718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220637
9092	NC_019702	TCTCCA	2	12	524820	524831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428220637
9093	NC_019702	ACAAAT	2	12	524832	524843	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428220637
9094	NC_019702	GAT	2	6	524854	524859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220637
9095	NC_019702	T	6	6	524890	524895	0 %	100 %	0 %	0 %	428220637
9096	NC_019702	CAT	2	6	524896	524901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220637
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9103	NC_019702	A	6	6	525347	525352	100 %	0 %	0 %	0 %	428220637
9104	NC_019702	A	6	6	525434	525439	100 %	0 %	0 %	0 %	428220637
9105	NC_019702	TTC	2	6	525440	525445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220637
9106	NC_019702	CTA	2	6	525640	525645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_019702	TTAT	2	8	525661	525668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_019702	CGG	2	6	525749	525754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220638
9109	NC_019702	AT	3	6	525765	525770	50 %	50 %	0 %	0 %	428220638
9110	NC_019702	CCAAGA	2	12	525805	525816	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428220638
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9112	NC_019702	TTTAAT	2	12	526318	526329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220639
9113	NC_019702	A	6	6	526458	526463	100 %	0 %	0 %	0 %	428220639
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9117	NC_019702	TGCC	2	8	526767	526774	0 %	25 %	25 %	50 %	428220639
9118	NC_019702	GCA	2	6	526782	526787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220639
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9121	NC_019702	ATTTA	2	10	526967	526976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9123	NC_019702	GGT	2	6	527132	527137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220640
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9240	NC_019702	A	6	6	533861	533866	100 %	0 %	0 %	0 %	428220644
9241	NC_019702	AAT	2	6	533919	533924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220644
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9243	NC_019702	TAA	2	6	533990	533995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9244	NC_019702	TAA	2	6	534003	534008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9245	NC_019702	TA	4	8	534218	534225	50 %	50 %	0 %	0 %	428220645
9246	NC_019702	TCC	2	6	534240	534245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220645
9247	NC_019702	TTAA	2	8	534476	534483	50 %	50 %	0 %	0 %	428220645
9248	NC_019702	GGTT	2	8	534497	534504	0 %	50 %	50 %	0 %	428220645
9249	NC_019702	TAC	2	6	534531	534536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220645
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9251	NC_019702	GCA	2	6	534623	534628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220645
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9263	NC_019702	A	7	7	535417	535423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9264	NC_019702	CTGT	2	8	535457	535464	0 %	50 %	25 %	25 %	428220646
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9493	NC_019702	ACC	2	6	547892	547897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220657
9494	NC_019702	AAC	2	6	548037	548042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220657
9495	NC_019702	ATTGA	2	10	548078	548087	40 %	40 %	20 %	0 %	428220657
9496	NC_019702	AGGCT	2	10	548153	548162	20 %	20 %	40 %	20 %	428220657
9497	NC_019702	AAG	2	6	548217	548222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220657
9498	NC_019702	TTTC	2	8	548482	548489	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9499	NC_019702	TTC	2	6	548539	548544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220658
9500	NC_019702	AGC	2	6	548606	548611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220658

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