MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_019702	AGCC	2	8	3241217	3241224	25 %	0 %	25 %	50 %	428223139
56502	NC_019702	TTC	2	6	3241265	3241270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223139
56503	NC_019702	CCA	2	6	3241287	3241292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223139
56504	NC_019702	CTTAGA	2	12	3241417	3241428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428223139
56505	NC_019702	TGC	2	6	3241474	3241479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223139
56506	NC_019702	AGA	2	6	3241653	3241658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56507	NC_019702	GGT	2	6	3241668	3241673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56508	NC_019702	A	6	6	3241685	3241690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56509	NC_019702	CTG	2	6	3241726	3241731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56510	NC_019702	ATA	2	6	3241733	3241738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56511	NC_019702	TTA	2	6	3241796	3241801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56512	NC_019702	GT	3	6	3241870	3241875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56513	NC_019702	GTT	2	6	3241976	3241981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56514	NC_019702	GGT	2	6	3242010	3242015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56515	NC_019702	TAGA	2	8	3242031	3242038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56516	NC_019702	CTT	2	6	3242123	3242128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56517	NC_019702	GAT	2	6	3242140	3242145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56518	NC_019702	AT	3	6	3242162	3242167	50 %	50 %	0 %	0 %	428223140
56519	NC_019702	TTA	2	6	3242185	3242190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223140
56520	NC_019702	AG	3	6	3242214	3242219	50 %	0 %	50 %	0 %	428223140
56521	NC_019702	CTA	2	6	3242323	3242328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223140
56522	NC_019702	AAAG	2	8	3242385	3242392	75 %	0 %	25 %	0 %	428223140
56523	NC_019702	C	6	6	3242409	3242414	0 %	0 %	0 %	100 %	428223140
56524	NC_019702	TACT	2	8	3242470	3242477	25 %	50 %	0 %	25 %	428223140
56525	NC_019702	AAGC	2	8	3242592	3242599	50 %	0 %	25 %	25 %	428223140
56526	NC_019702	AGC	2	6	3242660	3242665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223140
56527	NC_019702	CGCC	2	8	3242744	3242751	0 %	0 %	25 %	75 %	428223140
56528	NC_019702	ATTT	2	8	3242773	3242780	25 %	75 %	0 %	0 %	428223140
56529	NC_019702	AGA	2	6	3242849	3242854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223140
56530	NC_019702	GAA	2	6	3242889	3242894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223140
56531	NC_019702	TAAT	2	8	3242968	3242975	50 %	50 %	0 %	0 %	428223140
56532	NC_019702	A	6	6	3243022	3243027	100 %	0 %	0 %	0 %	428223140
56533	NC_019702	TC	3	6	3243045	3243050	0 %	50 %	0 %	50 %	428223140
56534	NC_019702	AG	3	6	3243072	3243077	50 %	0 %	50 %	0 %	428223140
56535	NC_019702	T	6	6	3243128	3243133	0 %	100 %	0 %	0 %	428223140
56536	NC_019702	AAT	2	6	3243209	3243214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223140
56537	NC_019702	TAA	2	6	3243248	3243253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223140
56538	NC_019702	CTGC	2	8	3243322	3243329	0 %	25 %	25 %	50 %	428223140
56539	NC_019702	TAG	2	6	3243445	3243450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223140
56540	NC_019702	TAG	3	9	3243565	3243573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223140
56541	NC_019702	TGC	2	6	3243662	3243667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223140
56542	NC_019702	TTA	2	6	3243675	3243680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223140
56543	NC_019702	GTG	2	6	3243687	3243692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223140
56544	NC_019702	TTA	2	6	3243780	3243785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223140
56545	NC_019702	AC	3	6	3243821	3243826	50 %	0 %	0 %	50 %	428223140
56546	NC_019702	ATT	2	6	3244011	3244016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223140
56547	NC_019702	TGC	2	6	3244072	3244077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223140
56548	NC_019702	TTATTT	2	12	3244118	3244129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428223140
56549	NC_019702	CAG	2	6	3244137	3244142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223140
56550	NC_019702	GT	3	6	3244155	3244160	0 %	50 %	50 %	0 %	428223140
56551	NC_019702	AGC	2	6	3244238	3244243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223140
56552	NC_019702	AGA	2	6	3244274	3244279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223140
56553	NC_019702	ATG	2	6	3244293	3244298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223140
56554	NC_019702	GAA	2	6	3244356	3244361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223140
56555	NC_019702	ATTC	2	8	3244382	3244389	25 %	50 %	0 %	25 %	428223140
56556	NC_019702	GCG	2	6	3244437	3244442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223140
56557	NC_019702	GTG	2	6	3244456	3244461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223140
56558	NC_019702	TAT	2	6	3244673	3244678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56559	NC_019702	ATC	2	6	3244681	3244686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56560	NC_019702	ATG	2	6	3244720	3244725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56561	NC_019702	AT	3	6	3244840	3244845	50 %	50 %	0 %	0 %	428223141
56562	NC_019702	ACT	2	6	3244869	3244874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223141
56563	NC_019702	ATC	2	6	3244959	3244964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223141
56564	NC_019702	A	6	6	3244972	3244977	100 %	0 %	0 %	0 %	428223141
56565	NC_019702	TCAA	2	8	3245106	3245113	50 %	25 %	0 %	25 %	428223141
56566	NC_019702	ACAGAG	2	12	3245135	3245146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428223141
56567	NC_019702	CAGTCG	2	12	3245191	3245202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428223141
56568	NC_019702	AAC	2	6	3245250	3245255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223141
56569	NC_019702	GCG	2	6	3245299	3245304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223141
56570	NC_019702	TTA	2	6	3245342	3245347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223141
56571	NC_019702	TAAA	2	8	3245406	3245413	75 %	25 %	0 %	0 %	428223141
56572	NC_019702	A	6	6	3245411	3245416	100 %	0 %	0 %	0 %	428223141
56573	NC_019702	ATG	2	6	3245453	3245458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223141
56574	NC_019702	AAG	2	6	3245556	3245561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223141
56575	NC_019702	GTT	2	6	3245570	3245575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223141
56576	NC_019702	TGA	2	6	3245619	3245624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223142
56577	NC_019702	AGA	2	6	3245739	3245744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223142
56578	NC_019702	TTG	2	6	3245764	3245769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223142
56579	NC_019702	ATGG	2	8	3245801	3245808	25 %	25 %	50 %	0 %	428223142
56580	NC_019702	AGC	2	6	3245922	3245927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223142
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56582	NC_019702	GAA	2	6	3246115	3246120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223142
56583	NC_019702	A	6	6	3246138	3246143	100 %	0 %	0 %	0 %	428223142
56584	NC_019702	ATT	2	6	3246157	3246162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223142
56585	NC_019702	CCCG	2	8	3246190	3246197	0 %	0 %	25 %	75 %	428223142
56586	NC_019702	TTCT	2	8	3246250	3246257	0 %	75 %	0 %	25 %	428223142
56587	NC_019702	TGA	3	9	3246342	3246350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223142
56588	NC_019702	TGCCAG	2	12	3246381	3246392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428223142
56589	NC_019702	AAG	2	6	3246398	3246403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223142
56590	NC_019702	AAT	2	6	3246412	3246417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223142
56591	NC_019702	CG	3	6	3246453	3246458	0 %	0 %	50 %	50 %	428223142
56592	NC_019702	A	7	7	3246547	3246553	100 %	0 %	0 %	0 %	428223142
56593	NC_019702	AACT	2	8	3246617	3246624	50 %	25 %	0 %	25 %	428223142
56594	NC_019702	GAA	2	6	3246628	3246633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223142
56595	NC_019702	GAA	2	6	3246694	3246699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223142
56596	NC_019702	A	8	8	3246702	3246709	100 %	0 %	0 %	0 %	428223142
56597	NC_019702	TGA	2	6	3246786	3246791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223142
56598	NC_019702	ATCCT	2	10	3246815	3246824	20 %	40 %	0 %	40 %	428223142
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56600	NC_019702	ATT	2	6	3246842	3246847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56601	NC_019702	TAA	2	6	3246975	3246980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223143
56602	NC_019702	TCG	2	6	3247058	3247063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223143
56603	NC_019702	CAG	2	6	3247091	3247096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223143
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56605	NC_019702	ACT	2	6	3247154	3247159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223143
56606	NC_019702	TG	4	8	3247188	3247195	0 %	50 %	50 %	0 %	428223143
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56610	NC_019702	GGGTT	2	10	3247414	3247423	0 %	40 %	60 %	0 %	428223143
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56615	NC_019702	TTG	2	6	3247677	3247682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223143
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56618	NC_019702	TGG	2	6	3247836	3247841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223143
56619	NC_019702	GCA	2	6	3247891	3247896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223143
56620	NC_019702	GCAA	2	8	3247968	3247975	50 %	0 %	25 %	25 %	428223143
56621	NC_019702	AGTT	2	8	3248039	3248046	25 %	50 %	25 %	0 %	428223143
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56630	NC_019702	TAT	2	6	3248638	3248643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223144
56631	NC_019702	TCC	2	6	3248712	3248717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223144
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56638	NC_019702	TGG	2	6	3249258	3249263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223144
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56642	NC_019702	ATC	2	6	3249558	3249563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223144
56643	NC_019702	TCT	2	6	3249582	3249587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223144
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56650	NC_019702	GGCAT	2	10	3250037	3250046	20 %	20 %	40 %	20 %	428223144
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56656	NC_019702	AGA	2	6	3250121	3250126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223144
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56663	NC_019702	ATC	2	6	3250672	3250677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56664	NC_019702	ATCT	2	8	3250688	3250695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56665	NC_019702	TCT	2	6	3250712	3250717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223145
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56672	NC_019702	TTA	2	6	3251788	3251793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56673	NC_019702	G	6	6	3251865	3251870	0 %	0 %	100 %	0 %	428223147
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56677	NC_019702	TCA	2	6	3252053	3252058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223147
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56680	NC_019702	TTTA	2	8	3252149	3252156	25 %	75 %	0 %	0 %	428223147
56681	NC_019702	GAC	2	6	3252231	3252236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223147
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56689	NC_019702	GCA	2	6	3252560	3252565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223147
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56693	NC_019702	A	6	6	3252923	3252928	100 %	0 %	0 %	0 %	428223147
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56716	NC_019702	CTT	2	6	3254530	3254535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223149
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56718	NC_019702	T	7	7	3254613	3254619	0 %	100 %	0 %	0 %	428223149
56719	NC_019702	TTAAT	2	10	3254683	3254692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56720	NC_019702	TAAT	2	8	3254741	3254748	50 %	50 %	0 %	0 %	428223150
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56722	NC_019702	CTG	2	6	3254814	3254819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223150
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56725	NC_019702	C	7	7	3255241	3255247	0 %	0 %	0 %	100 %	428223150
56726	NC_019702	ATTG	2	8	3255342	3255349	25 %	50 %	25 %	0 %	428223150
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56732	NC_019702	GCA	2	6	3255789	3255794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223150
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