MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_019702	A	7	7	3043294	3043300	100 %	0 %	0 %	0 %	428222963
53002	NC_019702	TGC	2	6	3043426	3043431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53003	NC_019702	CAG	2	6	3043459	3043464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53004	NC_019702	AT	3	6	3043487	3043492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53005	NC_019702	CAA	2	6	3043615	3043620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222964
53006	NC_019702	TGTA	2	8	3043644	3043651	25 %	50 %	25 %	0 %	428222964
53007	NC_019702	GTG	2	6	3043659	3043664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222964
53008	NC_019702	GAA	2	6	3043676	3043681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222964
53009	NC_019702	CCA	2	6	3043719	3043724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222964
53010	NC_019702	ATTT	2	8	3043727	3043734	25 %	75 %	0 %	0 %	428222964
53011	NC_019702	TGC	2	6	3043744	3043749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222964
53012	NC_019702	TGA	2	6	3043780	3043785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222964
53013	NC_019702	GTAA	2	8	3043851	3043858	50 %	25 %	25 %	0 %	428222964
53014	NC_019702	TTAAT	2	10	3043861	3043870	40 %	60 %	0 %	0 %	428222965
53015	NC_019702	TAA	2	6	3043892	3043897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222965
53016	NC_019702	A	6	6	3043896	3043901	100 %	0 %	0 %	0 %	428222965
53017	NC_019702	CAGG	2	8	3043955	3043962	25 %	0 %	50 %	25 %	428222965
53018	NC_019702	TGCCA	2	10	3043997	3044006	20 %	20 %	20 %	40 %	428222965
53019	NC_019702	TTCA	2	8	3044106	3044113	25 %	50 %	0 %	25 %	428222965
53020	NC_019702	AATT	2	8	3044127	3044134	50 %	50 %	0 %	0 %	428222965
53021	NC_019702	A	6	6	3044199	3044204	100 %	0 %	0 %	0 %	428222965
53022	NC_019702	TGT	2	6	3044218	3044223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222965
53023	NC_019702	AAT	2	6	3044235	3044240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222965
53024	NC_019702	GCA	2	6	3044449	3044454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222965
53025	NC_019702	TAC	2	6	3044465	3044470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222965
53026	NC_019702	CCCA	2	8	3044489	3044496	25 %	0 %	0 %	75 %	428222965
53027	NC_019702	TAG	3	9	3044509	3044517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222965
53028	NC_019702	T	6	6	3044540	3044545	0 %	100 %	0 %	0 %	428222965
53029	NC_019702	TAA	3	9	3044616	3044624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222965
53030	NC_019702	GTA	2	6	3044794	3044799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222965
53031	NC_019702	GGA	2	6	3044803	3044808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222965
53032	NC_019702	CT	3	6	3044824	3044829	0 %	50 %	0 %	50 %	428222965
53033	NC_019702	AAT	2	6	3044873	3044878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53034	NC_019702	T	6	6	3044939	3044944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53035	NC_019702	TAC	2	6	3044978	3044983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222966
53036	NC_019702	GGTA	2	8	3044990	3044997	25 %	25 %	50 %	0 %	428222966
53037	NC_019702	GTA	2	6	3045057	3045062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222966
53038	NC_019702	GGC	2	6	3045074	3045079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222966
53039	NC_019702	T	6	6	3045132	3045137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53040	NC_019702	T	6	6	3045186	3045191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53041	NC_019702	ATTT	2	8	3045195	3045202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53042	NC_019702	TAG	2	6	3045271	3045276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222967
53043	NC_019702	TGC	2	6	3045306	3045311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222967
53044	NC_019702	TAA	2	6	3045697	3045702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222967
53045	NC_019702	GAT	2	6	3045820	3045825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222967
53046	NC_019702	T	7	7	3045840	3045846	0 %	100 %	0 %	0 %	428222967
53047	NC_019702	A	6	6	3045887	3045892	100 %	0 %	0 %	0 %	428222967
53048	NC_019702	TACA	2	8	3046004	3046011	50 %	25 %	0 %	25 %	428222967
53049	NC_019702	ATC	2	6	3046061	3046066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222967
53050	NC_019702	TTA	2	6	3046117	3046122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222967
53051	NC_019702	AATTA	2	10	3046229	3046238	60 %	40 %	0 %	0 %	428222968
53052	NC_019702	AAC	2	6	3046302	3046307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222968
53053	NC_019702	GCA	2	6	3046395	3046400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222968
53054	NC_019702	ATAA	2	8	3046539	3046546	75 %	25 %	0 %	0 %	428222968
53055	NC_019702	TTG	2	6	3046577	3046582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222968
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53057	NC_019702	ATT	3	9	3046616	3046624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222968
53058	NC_019702	GTT	2	6	3046762	3046767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222968
53059	NC_019702	GCA	2	6	3046828	3046833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222968
53060	NC_019702	AGA	2	6	3046894	3046899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222968
53061	NC_019702	GATC	2	8	3047002	3047009	25 %	25 %	25 %	25 %	428222968
53062	NC_019702	AAG	2	6	3047110	3047115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222968
53063	NC_019702	AGT	2	6	3047153	3047158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222968
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53066	NC_019702	CTTA	2	8	3047222	3047229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53067	NC_019702	CAA	2	6	3047300	3047305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222969
53068	NC_019702	CAA	2	6	3047321	3047326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222969
53069	NC_019702	GAT	2	6	3047374	3047379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222969
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53072	NC_019702	TAAA	2	8	3047592	3047599	75 %	25 %	0 %	0 %	428222969
53073	NC_019702	ACCA	2	8	3047600	3047607	50 %	0 %	0 %	50 %	428222969
53074	NC_019702	TGA	2	6	3047614	3047619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222969
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53079	NC_019702	A	6	6	3047905	3047910	100 %	0 %	0 %	0 %	428222969
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53084	NC_019702	AAT	2	6	3048145	3048150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53091	NC_019702	TTTG	2	8	3048592	3048599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53092	NC_019702	CTG	2	6	3048641	3048646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222971
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53473	NC_019702	GTAC	2	8	3070987	3070994	25 %	25 %	25 %	25 %	428222987
53474	NC_019702	ATC	2	6	3071122	3071127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222987
53475	NC_019702	AAT	2	6	3071146	3071151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222987
53476	NC_019702	TAAATC	2	12	3071152	3071163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428222987
53477	NC_019702	CGTG	2	8	3071269	3071276	0 %	25 %	50 %	25 %	428222987
53478	NC_019702	TCA	2	6	3071318	3071323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222987
53479	NC_019702	TAA	2	6	3071328	3071333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222987
53480	NC_019702	ATT	2	6	3071363	3071368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222987
53481	NC_019702	ATT	2	6	3071386	3071391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222988
53482	NC_019702	TCCA	2	8	3071525	3071532	25 %	25 %	0 %	50 %	428222988
53483	NC_019702	ATA	2	6	3071608	3071613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222988
53484	NC_019702	CCA	2	6	3071627	3071632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222988
53485	NC_019702	TTC	2	6	3071645	3071650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222988
53486	NC_019702	ACC	2	6	3071727	3071732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222988
53487	NC_019702	ACATC	2	10	3071749	3071758	40 %	20 %	0 %	40 %	428222988
53488	NC_019702	TTC	2	6	3071849	3071854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222988
53489	NC_019702	CAT	2	6	3071921	3071926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222988
53490	NC_019702	GAC	2	6	3071950	3071955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222988
53491	NC_019702	TAA	3	9	3071978	3071986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222988
53492	NC_019702	TAA	2	6	3072014	3072019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222988
53493	NC_019702	TAA	2	6	3072065	3072070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222988
53494	NC_019702	TGC	3	9	3072071	3072079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222988
53495	NC_019702	TGC	2	6	3072083	3072088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222988
53496	NC_019702	TTC	2	6	3072194	3072199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222988
53497	NC_019702	CGG	2	6	3072220	3072225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222988
53498	NC_019702	ATG	3	9	3072254	3072262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222988
53499	NC_019702	TAAG	2	8	3072269	3072276	50 %	25 %	25 %	0 %	428222988
53500	NC_019702	TCA	2	6	3072291	3072296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222988

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